Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05195
• Subject: XM_011512535.2
• Aligned Length: 1284
• Identities: 1209
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ATGTTCAGTCTGATGGCCAGTTGCTGCGGCTGGTTCAAGCGGTGGCGGGAGCCTGTCAGAAAGGTGACTCTTTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GATGGTGGGACTTGATAATGCTGGTAAAACCGCAACAGCAAAGGGAATCCAAGGAGAATACCCTGAAGATGTAG  148
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -ATGGTGGGACTTGATAATGCTGGTAAAACCGCAACAGCAAAGGGAATCCAAGGAGAATACCCTGAAGATGTAG  73

Query  149  CTCCTACTGTTGGATTTTCAAAAATTAACCTTAGACAAGGAAAGTTTGAAGTCACCATCTTTGACTTGGGAGGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  CTCCTACTGTTGGATTTTCAAAAATTAACCTTAGACAAGGAAAGTTTGAAGTCACCATCTTTGACTTGGGAGGT  147

Query  223  GGAATAAGAATTCGGGGAATCTGGAAGAATTACTATGCTGAATCCTATGGGGTAATATTTGTTGTGGATTCCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  GGAATAAGAATTCGGGGAATCTGGAAGAATTACTATGCTGAATCCTATGGGGTAATATTTGTTGTGGATTCCAG  221

Query  297  TGATGAAGAGAGAATGGAAGAGACAAAAGAGGCTATGTCAGAAATGCTAAGACATCCTAGGATATCGGGAAAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  TGATGAAGAGAGAATGGAAGAGACAAAAGAGGCTATGTCAGAAATGCTAAGACATCCTAGGATATCGGGAAAGC  295

Query  371  CTATATTGGTGTTGGCAAATAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGATGTCATTGAATGTCTATCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  CTATATTGGTGTTGGCAAATAAACAAGATAAAGAAGGAGCTTTAGGAGAAGCTGATGTCATTGAATGTCTATCT  369

Query  445  CTGGAAAAATTGGTCAATGAGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAGCAATCTCGGGGTATGGAAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  CTGGAAAAATTGGTCAATGAGCACAAGTGCCTGTGTCAGATAGAACCATGTTCAGCAATCTCGGGGTATGGAAA  443

Query  519  GAAAATTGACAAGTCCATTAAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCAAGAGACTTTGATGCCTTAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GAAAATTGACAAGTCCATTAAAAAAGGCCTTTATTGGCTGCTACATGTTATTGCAAGAGACTTTGATGCCTTAA  517

Query  593  ATGAACGCATCCAAAAAGAGACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAAACAAGAAAGAGCTGAACGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  ATGAACGCATCCAAAAAGAGACAACAGAGCAGCGTGCTCTTGAGGAACAAGAGAAACAAGAAAGAGCTGAACGA  591

Query  667  GTGCGAAAATTACGAGAAGAAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCGATGGAACCAGTGGTCTGGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GTGCGAAAATTACGAGAAGAAAGAAAACAAAATGAACAGGAGCAGGCTGAACTCGATGGAACCAGTGGTCTGGC  665

Query  741  TGAGTTGGACCCAGAACCAACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATTGAGAATGAAGGAAAACTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  TGAGTTGGACCCAGAACCAACGAATCCTTTCCAGCCAATAGCATCTGTAATCATTGAGAATGAAGGAAAACTTG  739

Query  815  AAAGAGAGAAAAAAAACCAAAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAAACATAAAATGGAGCATGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  AAAGAGAGAAAAAAAACCAAAAAATGGAGAAAGACAGTGATGGCTGCCACCTGAAACATAAAATGGAGCATGAG  813

Query  889  CAAATAGAGACACAAGGCCAGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTGGACTAGTAGAAAATTATAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CAAATAGAGACACAAGGCCAGGTTAATCACAATGGCCAAAAAAATAATGAATTTGGACTAGTAGAAAATTATAA  887

Query  963  GGAGGCATTAACACAGCAGTTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTGGAATCAGCTAATGGTAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GGAGGCATTAACACAGCAGTTAAAGAATGAAGATGAGACAGACCGGCCATCATTGGAATCAGCTAATGGTAAAA  961

Query 1037  AGAAAACTAAGAAACTAAGAATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATATAGATGACTGTGCTCCTGAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  AGAAAACTAAGAAACTAAGAATGAAAAGGAACCACCGGGTAGAACCACTTAATATAGATGACTGTGCTCCTGAG  1035

Query 1111  AGTCCAACGCCACCCCCACCCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCACTAGACTTCCAAAACTTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  AGTCCAACGCCACCCCCACCCCCTCCTCCTGTTGGCTGGGGAACCCCTAAAGTCACTAGACTTCCAAAACTTGA  1109

Query 1185  GCCTCTTGGTGAAACACATCATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTGGCTGTGCCACAGCGACCTA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  GCCTCTTGGTGAAACACATCATAATGATTTCTATAGGAAGCCACTGCCTCCCCTGGCTGTGCCACAGCGACCTA  1183

Query 1259  ACAGTGATGCTCATGATGTGATCTCA  1284
            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  ACAGTGATGCTCATGATGTGATCTCA  1209