Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05205
- Subject:
- NM_001366903.1
- Aligned Length:
- 1555
- Identities:
- 1374
- Gaps:
- 161
Alignment
Query 1 ATGTCATACGGATCCATCGCCCGTGGAGGTGGCCTGGGGAGCCGTGGCCCTTTCGGGGGACCTTCGAGACAAGG 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCATACGGATCCATCGCCCGTGGAGGTGGCCTGGGGAGCCGTGGCCCTTTCGGGGGACCTTCGAGACAAGG 74
Query 75 CTGTCAGCCCCTAGAGTGCGCTAGATGTTGGACCGAGTATGGAATCCGCCATTTCCCCTGCCCGTCGCCAGAGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CTGTCAGCCCCTAGAGTGCGCTAGATGTTGGACCGAGTATGGAATCCGCCATTTCCCCTGCCCGTCGCCAGAGA 148
Query 149 GCAAGCTGCAGAACCGCTGTGTGGGGAAGGACGGGGAAGGTGATCTGGGGCCAGCAGGCACGCCTATTGTCCCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCAAGCTGCAGAACCGCTGTGTGGGGAAGGACGGGGAAGGTGATCTGGGGCCAGCAGGCACGCCTATTGTCCCA 222
Query 223 AGGGCCAGGAAGCGAGGGCCTGGGGTTGCCCCTGAAGGCAGCCGGATGCCGGAGCCCACCTCATCACCCACCAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 AGGGCCAGGAAGCGAGGGCCTGGGGTTGCCCCTGAAGGCAGCCGGATGCCGGAGCCCACCTCATCACCCACCAT 296
Query 297 TGGCCCGAGGAAGGACTCGGCTGCTGGGCCCCATGGCCGGATGGCGGGGCCCAGCACTACCCGGGCCAAGAAGA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGGCCCGAGGAAGGACTCGGCTGCTGGGCCCCATGGCCGGATGGCGGGGCCCAGCACTACCCGGGCCAAGAAGA 370
Query 371 GGAAGCCCAACTTCTGCCCGCAGGAGACCGAGGTGCTGGTGTCCAAGGTGAGCAAGCACCACCAGCTGCTGTTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGAAGCCCAACTTCTGCCCGCAGGAGACCGAGGTGCTGGTGTCCAAGGTGAGCAAGCACCACCAGCTGCTGTTT 444
Query 445 GGCACGGGGCTGCTGAAGGCCGAGCCCACTCGCAGGTACCGCGTGTGGAGCCGCATCCTGCAGGCCGTGAATGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGCACGGGGCTGCTGAAGGCCGAGCCCACTCGCAGGTACCGCGTGTGGAGCCGCATCCTGCAGGCCGTGAATGC 518
Query 519 GCTGGGCTACTGTCGCCGCGACGTTGTGGACCTGAAGCACAAGTGGCGGGACCTACGAGCCGTCGTGCGGCGCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTGGGCTACTGTCGCCGCGACGTTGTGGACCTGAAGCACAAGTGGCGGGACCTACGAGCCGTCGTGCGGCGCA 592
Query 593 AGCTGGGCGACCTCCGGAAGGCGGCCCATGGCCCCAGCCCTGGTTCCGGCAAGCCCCAGGCCCTGGCTCTCACG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCTGGGCGACCTCCGGAAGGCGGCCCATGGCCCCAGCCCTGGTTCCGGCAAGCCCCAGGCCCTGGCTCTCACG 666
Query 667 CCCGTGGAGCAGGTGGTGGCCAAGACCTTCTCTTGCCAGGCCCTGCCCTCCGAGGGCTTCAGTCTGGAGCCGCC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CCCGTGGAGCAGGTGGTGGCCAAGACCTTCTCTTGCCAGGCCCTGCCCTCCGAGGGCTTCAGTCTGGAGCCGCC 740
Query 741 CAGAGCCACCCAGGTCGATCCGTGCAACCTCCAGGAGCTGTTCCAGGAGATGTCGGCCAACGTCTTCCGAATCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAGAGCCACCCAGGTCGATCCGTGCAACCTCCAGGAGCTGTTCCAGGAGATGTCGGCCAACGTCTTCCGAATCA 814
Query 815 ACTCCAGTGTGACCTCCTTGGAGCGGAGCCTTCAGTCCTTAGGGACACCGAGTGACACGCAGGAGCTTCGGGAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACTCCAGTGTGACCTCCTTGGAGCGGAGCCTTCAGTCCTTAGGGACACCGAGTGACACGCAGGAGCTTCGGGAC 888
Query 889 AGCCTGCACACGGCACAGCAGGAGACCAACAAGACCATTGCAGCCAGCGCCAGCTCCGTGAAGCAGATGGCCGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGCCTGCACACGGCACAGCAGGAGACCAACAAGACCATTGCAGCCAGCGCCAGCTCCGTGAAGCAGATGGCCGA 962
Query 963 GCTGCTGCGCAGCTCCTGCCCGCAGGAGCGTCTGCAGCAGGAGCGTCCTCAGCTGGACCGGCTGAAAACCCAGC 1036
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCTGCTGCGCAGCTCCTGCCC---GGAGCGTCTGCAGCAGGAGCGTCCTCAGCTGGACCGGCTGAAAACCCAGC 1033
Query 1037 TCTCAGATGCCATTCAGTGCTATGGAGTGGTGCAGAAGAAAATTGCAGAAAAGTCCAGAGCGCTGCTTCCCATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 TCTCAGATGCCATTCAGTGCTATGGAGTGGTGCAGAAGAAAATTGCAGAAAAGTCCAGAGCGCTGCTTCCCATG 1107
Query 1111 GCGCAGAGGGGCAGTAAA---CAGAGTCCCCAGGCCCCGTTTGCCGAGCTGGCTGATGATGAGAAGGTCTTTAA 1181
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 GCGCAGAGGGGCAGTAAACAGCAGAGTCCCCAGGCCCCGTTTGCCGAGCTGGCTGATGATGAGAAGGTCTTTAA 1181
Query 1182 CGGGAGTGACAACATGTGGCAGGGCCAGGAGCAGGCGCTGCTCCCGGACATCACTGAAGAGGACCTGGAGGCCA 1255
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 CGGGAGTGACAACATGTGGCAGGGCCAGGAGCAGGCGCTGCTCCCGGACATCACTGAAGAGGACCTGGAGGCCA 1255
Query 1256 TCCGGCTGCGGGAGGAGGCCATCCTGCAGATGGAGAGCAACTTGCTGGATGTGAATCAGATCATCAAGGACTTG 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct 1256 TCCGGCTGCGGGAGGAGGCCATCCTGCAGATGGAG---------------GTGA-------------------G 1295
Query 1330 GCCTCCATGGTGTCAGAGCAAG-GAG---AAGCTGTTGATAGTATTGAAGCCAGCCTTGAGGCTGCGTCCTCGC 1399
|| |||.|| |.||||| |.| | ||.|..|.|.| ||| |.|||||||| |.
Sbjct 1296 GC-----TGGCGT--GGGCAAGCGTGCTCA--CTCTCCACACT-------CCA--CATGAGGCTG-------GG 1344
Query 1400 ATGCGGAGGCAGCCC----GCCAGCTCCTGGCTGGAGCCAGCCGGCACCAACTCCAGAGACACAAGATCAAGTG 1469
|..|.|||| ||||| ||||| |||| |.||||||
Sbjct 1345 AACCAGAGG-AGCCCAGGTGCCAG--CCTG------------CTGCACCA------------------------ 1379
Query 1470 CTGCTT--CCTATCAGCTGGAGTCACTG---CCCTGCTTGTCATCATCATCATCATCGCCACCTCTGTCCGAAA 1538
.||||| ||| |.|.||||||...||| |
Sbjct 1380 TTGCTTGCCCT-TGACCTGGAGGGGCTGGAAC------------------------------------------ 1410
Query 1539 G 1539
Sbjct 1411 - 1410