Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05234
• Subject: NM_173038.3
• Aligned Length: 1272
• Identities: 1131
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGATCAACCTAGTGGAAGAAGTTTCATGCAAGTATTATGTGAAAAATATAGTCCTGAAAATTTTCCTTATCG  74
            |||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct    1  ATGGACCAGCCTAGTGGGAGAAGTTTCATGCAAGTATTGTGTGAAAAATACAGTCCTGAAAACTTCCCTTACCG  74

Query   75  CCGTGGCCCGGGGATGGGAGTCCATGTCCCAGCCACACCTCAGGGCTCTCCTATGAAAGATCGCCTCAACCTCC  148
            |||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCGTGGCCCTGGGGTGGGAGTCCATGTCCCAGCCACTCCCCAGGGCTCGCCTATGAAAGATCGCCTCAACCTCC  148

Query  149  CAAGTGTACTAGTGTTGAACAGCTGTGGAATAACCTGTGCAGGAGATGAAAAAGAAATTGCTGCTTTCTGCGCT  222
            |.||.||.||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||.||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct  149  CGAGCGTGCTCGTGTTGAACAGCTGCGGCATTACCTGCGCGGGAGATGAAAGAGAAATCGCAGCCTTCTGTGCT  222

Query  223  CATGTGTCGGAACTAGATCTTTCTGACAACAAACTCGAAGACTGGCATGAGGTCAGTAAAATTGTGTCAAATGT  296
            ||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  CACGTGTCAGAACTCGATCTTTCTGACAACAAGCTCCAAGACTGGCATGAGGTCAGTAAGATTGTGTCAAATGT  296

Query  297  TCCTCAGTTGGAGTTTCTAAACCTGAGTTCCAACCCTCTGAATTTGTCGGTTTTAGAAAGAACATGTGCTGGGT  370
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.||||.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCTCAGCTGGAGTTTCTAAACCTGAGTTCCAATCCTCTGAGTCTGTCAGTTCTAGAAAGAACATGTGCTGGGT  370

Query  371  CCTTCTCTGGGGTTCGCAAACTTGTCCTCAACAACAGCAAAGCTTCTTGGGAGACGGTCCACATGATACTACAG  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||||..|||||.|||
Sbjct  371  CCTTCTCTGGGGTTCGCAAACTTGTCCTCAACAACAGCAAAGCATCATGGGAAACAGTGCACACCATACTGCAG  444

Query  445  GAGTTACCAGATTTGGAGGAGCTCTTCCTGTGCCTTAATGACTATGAAACAGTGTCTTGTCCTTCTATTTGCTG  518
            |||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||
Sbjct  445  GAGTTGCCAGAGTTGGAGGAGCTCTTCCTGTGCCTTAATGACTATGAAACAGTGTCTTGTCCTTCTGTCTGCTG  518

Query  519  TCATTCTCTTAAGCTACTACATATAACAGACAATAACCTCCAAGACTGGACTGAAATACGAAAGTTAGGAGTTA  592
            ||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|.||.||.|
Sbjct  519  TCATTCCCTCAAGCTCCTACACATCACAGACAACAACCTCCAAGACTGGACTGAAATCCGAAAGCTGGGTGTAA  592

Query  593  TGTTTCCTTCACTGGATACCCTCGTCCTGGCCAACAATCATTTGAATGCTATTGAGGAGCCTGATGATTCATTG  666
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||.|||.||..||
Sbjct  593  TGTTTCCTTCACTGGATACCCTGGTCCTGGCCAACAATCACTTGAATGCAATCGAGGAGCCTGCTGACTCCCTG  666

Query  667  GCCAGGTTGTTTCCTAATCTTCGATCCATCAGCCTCCACAAGTCAGGTTTGCAGTCCTGGGAAGACATTGATAA  740
            ||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  667  GCTAGGTTGTTCCCTAATCTGCGGTCCATCAGCCTCCACAAGTCAGGTTTGCAGTCCTGGGAAGACATTGACAA  740

Query  741  ACTAAATTCATTTCCCAAACTGGAAGAAGTGAGATTGTTAGGAATTCCTCTTCTGCAGCCATATACCACCGAGG  814
            ||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  741  ACTAAATTCATTCCCCAAGCTTGAAGAAGTGAGATTGCTAGGAATTCCTCTTCTACAGCCGTATACCACCGAGG  814

Query  815  AGCGAAGGAAATTGGTAATAGCCAGATTGCCATCAGTTTCCAAACTTAATGGCAGCGTTGTTACTGATGGTGAA  888
            |.||.|||||||||||..|.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.
Sbjct  815  AACGCAGGAAATTGGTGGTGGCCAGATTGCCCTCCGTTTCCAAACTCAATGGCAGTGTTGTGACGGATGGTGAG  888

Query  889  CGAGAAGATTCTGAGAGATTTTTTATTCGTTACTATGTGGATGTTCCACAGGAAGAAGTGCCATTCAGGTATCA  962
            |||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CGAGAGGATTCCGAGAGGTTTTTCATCCGGTACTACGTGGATGTTCCTCAGGAGGAAGTGCCATTCAGGTATCA  962

Query  963  TGAACTGATCACTAAATATGGGAAGTTGGAGCCTTTGGCAGAAGTGGACCTAAGACCCCAGAGCAGTGCAAAAG  1036
            |||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  963  TGAGCTCATTACAAAATATGGGAAATTGGAGCCTTTGGCAGAAGTGGACCTAAGACCCCAGAGCAGTGCGAAAG  1036

Query 1037  TAGAAGTCCACTTTAACGATCAGGTGGAAGAAATGAGCATTCGTCTGGACCAAACAGTGGCAGAACTAAAGAAA  1110
            |||||||.|||||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1037  TAGAAGTTCACTTCAATGACCAAGTGGAGGAAATGAGCATCCGCCTGGACCAGACAGTAGCCGAACTGAAGAAA  1110

Query 1111  CAGTTAAAAACTCTAGTACAATTACCCACAAGCAACATGCTTCTCTACTATTTTGACCATGAAGCACCCTTTGG  1184
            |||.||||.||.||.||.||.||.|||||.||||.|||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1111  CAGCTAAAGACCCTGGTGCAGTTGCCCACCAGCAGCATGCTTCTCTACTACTTTGACCACGAGGCCCCGTTTGG  1184

Query 1185  CCCAGAGGAAATGAAGTACAGCTCTCGGGCATTGCATTCCTTTGGCATTAGGGATGGAGATAAAATTTACGTGG  1258
            |||||||||.||||||||||||||.||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1185  CCCAGAGGAGATGAAGTACAGCTCCCGGGCACTGCACTCCTTTGGCATTAGGGATGGAGATAAAATTTTTGTGG  1258

Query 1259  AATCCAAAACAAAA  1272
            ||||.|||||||||
Sbjct 1259  AATCAAAAACAAAA  1272