Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05246
• Subject: XM_006717702.3
• Aligned Length: 1755
• Identities: 1212
• Gaps: 543

Alignment

Query    1  ATGTTTTCTTGTTTCTGTTTCAGCCTTCAGGATAATTCCTTCAGCAGCACCACTGTAACAGAGTGTGACGAAGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TCCAGTCTCTCTACATGAAGACCAGACTGATTGCTCCAGTCTCAGAGATGAAAACAATAAAGAGAACTACCCCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACGCAGGGGCTCTGGTAGAAGAGCACGCGCCGCCCTCTTGGGAGCCGCAGCAGCAGAATGTAGAGGCGACCGTG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CTGGTGGACAGCGTATTGCGACCCAGCATGGGCAACTTCAAGTCCAGGAAGCCCAAGTCCATCTTCAAAGCGGA  296
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------ATGGGCAACTTCAAGTCCAGGAAGCCCAAGTCCATCTTCAAAGCGGA  47

Query  297  GAGCGGGAGGAGCCACGGAGAAAGTCAGGAGACAGAGCATGTGGTATCCAGCCAGTCAGAGTGTCAGGTGAGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  GAGCGGGAGGAGCCACGGAGAAAGTCAGGAGACAGAGCATGTGGTATCCAGCCAGTCAGAGTGTCAGGTGAGAG  121

Query  371  CAGGAACACCAGCTCATGAGAGTCCACAAAACAATGCCTTCAAGTGCCAAGAAACAGTGCGACTTCAACCAAGA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  CAGGAACACCAGCTCATGAGAGTCCACAAAACAATGCCTTCAAGTGCCAAGAAACAGTGCGACTTCAACCAAGA  195

Query  445  ATAGACCAGAGGACTGCCATTTCGCCAAAGGATGCTTTTGAAACTCGGCAGGACTTAAATGAGGAAGAAGCTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  ATAGACCAGAGGACTGCCATTTCGCCAAAGGATGCTTTTGAAACTCGGCAGGACTTAAATGAGGAAGAAGCTGC  269

Query  519  TCAGGTGCATGGAGTCAAGGACCCGGCGCCAGCATCAACCCAGAGCGTGCTTGCCGATGGGACAGATTCTGCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  TCAGGTGCATGGAGTCAAGGACCCGGCGCCAGCATCAACCCAGAGCGTGCTTGCCGATGGGACAGATTCTGCAG  343

Query  593  ACCCCTCACCAGTCCACAAAGATGGGCAGAATGAGGCCGACAGTGCACCAGAAGACCTCCACTCTGTGGGGACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  ACCCCTCACCAGTCCACAAAGATGGGCAGAATGAGGCCGACAGTGCACCAGAAGACCTCCACTCTGTGGGGACC  417

Query  667  AGCAGGCTGCTCTATCACATCACTGATGGTGATAACCCACTGCTGTCGCCACGATGCTCCATCTTCAGCCAAAG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  AGCAGGCTGCTCTATCACATCACTGATGGTGATAACCCACTGCTGTCGCCACGATGCTCCATCTTCAGCCAAAG  491

Query  741  CCAGAGATTCAACTTAGACCCCGAGTCAGCCCCATCTCCACCCAGCACTCAGCAGTTTATGATGCCGCGGAGTT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  CCAGAGATTCAACTTAGACCCCGAGTCAGCCCCATCTCCACCCAGCACTCAGCAGTTTATGATGCCGCGGAGTT  565

Query  815  CTTCACGCTGCAGCTGTGGAGATGGCAAGGAGCCACAGACCATCACCCAGCTCACCAAGCACATCCAGAGCCTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  CTTCACGCTGCAGCTGTGGAGATGGCAAGGAGCCACAGACCATCACCCAGCTCACCAAGCACATCCAGAGCCTC  639

Query  889  AAGCGGAAAATTCGGAAATTTGAAGAAAAATTTGAACAAGAAAAGAAATACCG---------------------  941
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct  640  AAGCGGAAAATTCGGAAATTTGAAGAAAAATTTGAACAAGAAAAGAAATACCGGCCTTCACATGGTGACAAGAC  713

Query  942  --------------------------------------------------------------------------  941
                                                                                      
Sbjct  714  TTCTAATCCTGAAGTCCTGAAATGGATGAATGATTTGGCTAAAGGTCGTAAACAGCTCAAAGAACTAAAGCTAA  787

Query  942  --------------------------------------------------------------------------  941
                                                                                      
Sbjct  788  AGCTGTCAGAAGAACAAGGGAGTGCTCCCAAAGGTCCACCTAGAAACCTGTTGTGTGAGCAACCCACAGTCCCC  861

Query  942  --------------------------------------------------------------------------  941
                                                                                      
Sbjct  862  AGAGAAAATGGGAAACCGGAAGCTGCGGGCCCGGAGCCAAGCTCCTCTGGAGAAGAGACTCCAGATGCTGCCTT  935

Query  942  ---------------------------------------------------GGTAACTAAGCAAGACAAGAACC  964
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  GACATGCCTGAAGGAGAGAAGAGAGCAACTTCCTCCCCAGGAGGATTCTAAGGTAACTAAGCAAGACAAGAACC  1009

Query  965  TCATAAAGCCGCTTTATGACCGATACAGAATTATCAAGCAAATCTTGTCAACACCTTCCCTTATTCCAACAATT  1038
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  TCATAAAGCCGCTTTATGACCGATACAGAATTATCAAGCAAATCTTGTCAACACCTTCCCTTATTCCAACAATT  1083

Query 1039  CAGGAGGAAGAGGACTCTGATGAAGACCGTCCACAGGGAAGCCAACAACCTTCTTTGGCAGATCCAGCATCTCA  1112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  CAGGAGGAAGAGGACTCTGATGAAGACCGTCCACAGGGAAGCCAACAACCTTCTTTGGCAGATCCAGCATCTCA  1157

Query 1113  CCTTCCTGTTGGTGACCACCTCACCTACTCTAATGAGACTGAGCCTGTTAGGGCCCTTTTACCAGATGAAAAGA  1186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  CCTTCCTGTTGGTGACCACCTCACCTACTCTAATGAGACTGAGCCTGTTAGGGCCCTTTTACCAGATGAAAAGA  1231

Query 1187  AAGAAGTAAAACCACCAGCTCTCTCCATGTCTAATTTACATGAGGCTACCATGCCTGTACTTCTTGACCATCTC  1260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232  AAGAAGTAAAACCACCAGCTCTCTCCATGTCTAATTTACATGAGGCTACCATGCCTGTACTTCTTGACCATCTC  1305

Query 1261  CGAGAAACTAGGGCTGACAAGAAGAGACTGCGGAAAGCCTTAAGAGAATTTGAAGAACAGTTTTTTAAACAAAC  1334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306  CGAGAAACTAGGGCTGACAAGAAGAGACTGCGGAAAGCCTTAAGAGAATTTGAAGAACAGTTTTTTAAACAAAC  1379

Query 1335  AGGAAGAAGTCCACAAAAGGAAGATAGGATACCAATGGCAGATGAGTATTATGAATATAAGCACATAAAAGCCA  1408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380  AGGAAGAAGTCCACAAAAGGAAGATAGGATACCAATGGCAGATGAGTATTATGAATATAAGCACATAAAAGCCA  1453

Query 1409  AACTGAGACTATTAGAGGTCCTCATCAGCAAGCAAGATGTGGCCAAAACTATT  1461
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454  AACTGAGACTATTAGAGGTCCTCATCAGCAAGCAAGATGTGGCCAAAACTATT  1506