Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05284
• Subject: NM_001323005.2
• Aligned Length: 1443
• Identities: 1301
• Gaps: 142

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCTCCTGGTCGCTCTTGGTTACCCTGCGCCCCTTAGCACAGAGCCCGCTGAGAGGGAGATGTGTTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCCTCCTGGTCGCTCTTGGTTACCCTGCGCCCCTTAGCACAGAGCCCGCTGAGAGGGAGATGTGTTGG  74

Query   75  GTGCGGGGCCTGGGCCGCCGCTCTCGCTCCTCTGGCCACCGCCCCTGGGAAGCCCTTTTGGAAAGCCTATACGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTGCGGGGCCTGGGCCGCCGCTCTCGCTCCTCTGGCCACCGCCCCTGGGAAGCCCTTTTGGAAAGCCTATACGG  148

Query  149  TTCAGACATCCGAGAGCATGACCCCAACTGCCACTTCAGAGACTTATTTGAAAGCTTTGGCCGTTTGCCATGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TTCAGACATCCGAGAGCATGACCCCAACTGCCACTTCAGAGACTTATTTGAAAGCTTTGGCCGTTTGCCATGGA  222

Query  223  CCTCTGGACCACTATGATTTTCTGATCAAAGCTCATGAGCTAAAGGATGATGAACATCAAAGAAGAGTCATACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCTGGACCACTATGATTTTCTGATCAAAGCTCATGAGCTAAAGGATGATGAACATCAAAGAAGAGTCATACA  296

Query  297  GTGTTTGCAGAAATTACACGAGGACCTTAAAGGATACAATATAGAGGCAGAAGGCCTTTTTTCAAAGCTTTTTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTGTTTGCAGAAATTACACGAGGACCTTAAAGGATACAATATAGAGGCAGAAGGCCTTTTTTCAAAGCTTTTTT  370

Query  371  CAAGGAGCAAACCTCCAAGGGGCCTGTATGTTTATGGAGATGTTGGTACAGGAAAAACAATGGTGATGGACATG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAAGGAGCAAACCTCCAAGGGGCCTGTATGTTTATGGAGATGTTGGTACAGGAAAAACAATGGTGATGGACATG  444

Query  445  TTTTATGCTTATGTGGAAATGAAGAGGAAAAAACGGGTTCATTTTCATGGTTTCATGCTAGATGTGCACAAAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTTATGCTTATGTGGAAATGAAGAGGAAAAAACGGGTTCATTTTCATGGTTTCATGCTAGATGTGCACAAAAG  518

Query  519  AATACATCGCCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAACCAGGATTCATGGCTAAATCATATGACCCAATAGCTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATACATCGCCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAACCAGGATTCATGGCTAAATCATATGACCCAATAGCTC  592

Query  593  CCATAGCCGAAGAAATCAGCGAAGAAGCATGTCTCCTATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATTGCTGAT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCATAGCCGAAGAAATCAGCGAAGAAGCATGTCTCCTATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATTGCTGAT  666

Query  667  GCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCAAAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAACAGGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCAAAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAACAGGCC  740

Query  741  ACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAAAGAGCTAACTTTGTACCATTCATAGCAGTCTTGAAGGAATATT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAAAGAGCTAACTTTGTACCATTCATAGCAGTCTTGAAGGAATATT  814

Query  815  GTAATACAGTCCAGCTAGATTCTGGGATAGATTACCGGAAAAGGGAACTTCCTGCTGCAGGAAAACTCTACTAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTAATACAGTCCAGCTAGATTCTGGGATAGATTACCGGAAAAGGGAACTTCCTGCTGCAGGAAAACTCTACTAC  888

Query  889  CTCACAAGTGAAGCTGATGTGGAGGCTGTCATGGATAAGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAATGATTT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCACAAGTGAAGCTGATGTGGAGGCTGTCATGGATAAGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAATGATTT  962

Query  963  AACTAGACCAAGGATTCTAAAAGTGCAAGGCAGAGAGCTGCGCCTGAATAAAGCCTGTGGAACCGTTGCCGACT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACTAGACCAAGGATTCTAAAAGTGCAAGGCAGAGAGCTGCGCCTGAATAAAGCCTGTGGAACCGTTGCCGACT  1036

Query 1037  GCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGACCACTTGGAGCCAGTGACTATTTGGAACTATCAAAGAATTTTGATACA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct 1037  GCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGA------------------------------------------------  1062

Query 1111  ATATTTTTACGAAACATTCCGCAATTTACTCTGGCAAACAGGACTCAAGGTCGAAGATTCATAACTCTCATCGA  1184
                                                                                      
Sbjct 1063  --------------------------------------------------------------------------  1062

Query 1185  TAACTTTTATGATCTCAAGGTGCGTATAATTTGCTCTGCGTCGACTCCTATATCAAGCTTATTTTTGCATCAAC  1258
                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063  -------------------GTGCGTATAATTTGCTCTGCGTCGACTCCTATATCAAGCTTATTTTTGCATCAAC  1117

Query 1259  ATCATGACAGTGAGTTGGAGCAAAGCAGAATACTGATGGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGATTCAGCAGAAGGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1118  ATCATGACAGTGAGTTGGAGCAAAGCAGAATACTGATGGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGATTCAGCAGAAGGA  1191

Query 1333  CTCTCCATGTTTACCGGAGAAGAGGAAATCTTTGCATTTCAGCGCACAATTTCCCGACTCACGGAAATGCAGAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1192  CTCTCCATGTTTACCGGAGAAGAGGAAATCTTTGCATTTCAGCGCACAATTTCCCGACTCACGGAAATGCAGAC  1265

Query 1407  TGAACAGTACTGGAATGAAGGAGACAGAACCAAGAA-  1442
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1266  TGAACAGTACTGGAATGAAGGAGACAGAACCAAGAAG  1302