Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05284
- Subject:
- XM_005266885.3
- Aligned Length:
- 1448
- Identities:
- 1333
- Gaps:
- 110
Alignment
Query 1 ATGGCGGCCTCCTGGTCGCTCTTGGTTACCCTGCGCCCCTTAGCACAGAGCCCGCTGAGAGGGAGATGTGTTGG 74
||||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------------ATGTGT--- 6
Query 75 GTGCGGGGCCTGGGCCGCCGCTCTCGCTCCTCTGGCCACC--GCCCCTGGGAAGCCCTTTTGGAA---AGCCTA 143
|||.|| ||||| |||.| || ||||...|| ||||||
Sbjct 7 ----------------GCCACT-------------CCACCCAGCCTC----AA---CTTTAAAAAATTAGCCTA 44
Query 144 TACGGTTCAGACATCCGAGAGCATGACCCCAACTGCCACTTCAGAGACTTATTTGAAAGCTTTGGCCGTTTGCC 217
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 45 TACGGTTCAGACATCCGAGAGCATGACCCCAACTGCCACTTCAGAGACTTATTTGAAAGCTTTGGCCGTTTGCC 118
Query 218 ATGGACCTCTGGACCACTATGATTTTCTGATCAAAGCTCATGAGCTAAAGGATGATGAACATCAAAGAAGAGTC 291
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119 ATGGACCTCTGGACCACTATGATTTTCTGATCAAAGCTCATGAGCTAAAGGATGATGAACATCAAAGAAGAGTC 192
Query 292 ATACAGTGTTTGCAGAAATTACACGAGGACCTTAAAGGATACAATATAGAGGCAGAAGGCCTTTTTTCAAAGCT 365
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193 ATACAGTGTTTGCAGAAATTACACGAGGACCTTAAAGGATACAATATAGAGGCAGAAGGCCTTTTTTCAAAGCT 266
Query 366 TTTTTCAAGGAGCAAACCTCCAAGGGGCCTGTATGTTTATGGAGATGTTGGTACAGGAAAAACAATGGTGATGG 439
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 267 TTTTTCAAGGAGCAAACCTCCAAGGGGCCTGTATGTTTATGGAGATGTTGGTACAGGAAAAACAATGGTGATGG 340
Query 440 ACATGTTTTATGCTTATGTGGAAATGAAGAGGAAAAAACGGGTTCATTTTCATGGTTTCATGCTAGATGTGCAC 513
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 341 ACATGTTTTATGCTTATGTGGAAATGAAGAGGAAAAAACGGGTTCATTTTCATGGTTTCATGCTAGATGTGCAC 414
Query 514 AAAAGAATACATCGCCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAACCAGGATTCATGGCTAAATCATATGACCCAAT 587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415 AAAAGAATACATCGCCTTAAACAGAGTTTGCCAAAAAGGAAACCAGGATTCATGGCTAAATCATATGACCCAAT 488
Query 588 AGCTCCCATAGCCGAAGAAATCAGCGAAGAAGCATGTCTCCTATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATTG 661
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489 AGCTCCCATAGCCGAAGAAATCAGCGAAGAAGCATGTCTCCTATGTTTTGATGAATTTCAGGTCACTGACATTG 562
Query 662 CTGATGCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCAAAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAAC 735
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 563 CTGATGCCATGATTCTGAAACAGCTTTTTGAAAATCTGTTCAAAAACGGGGTCGTCGTTGTGGCAACATCCAAC 636
Query 736 AGGCCACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAAAGAGCTAACTTTGTACCATTCATAGCAGTCTTGAAGGA 809
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 637 AGGCCACCGGAAGATCTCTATAAAAATGGACTCCAAAGAGCTAACTTTGTACCATTCATAGCAGTCTTGAAGGA 710
Query 810 ATATTGTAATACAGTCCAGCTAGATTCTGGGATAGATTACCGGAAAAGGGAACTTCCTGCTGCAGGAAAACTCT 883
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 711 ATATTGTAATACAGTCCAGCTAGATTCTGGGATAGATTACCGGAAAAGGGAACTTCCTGCTGCAGGAAAACTCT 784
Query 884 ACTACCTCACAAGTGAAGCTGATGTGGAGGCTGTCATGGATAAGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAAT 957
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 785 ACTACCTCACAAGTGAAGCTGATGTGGAGGCTGTCATGGATAAGTTGTTTGATGAGCTGGCTCAGAAACAAAAT 858
Query 958 GATTTAACTAGACCAAGGATTCTAAAAGTGCAAGGCAGAGAGCTGCGCCTGAATAAAGCCTGTGGAACCGTTGC 1031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 859 GATTTAACTAGACCAAGGATTCTAAAAGTGCAAGGCAGAGAGCTGCGCCTGAATAAAGCCTGTGGAACCGTTGC 932
Query 1032 CGACTGCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGACCACTTGGAGCCAGTGACTATTTGGAACTATCAAAGAATTTTG 1105
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 933 CGACTGCACATTTGAAGAGCTGTGTGAGAGACCACTTGGAGCCAGTGACTATTTGGAACTATCAAAGAATTTTG 1006
Query 1106 ATACAATATTTTTACGAAACATTCCGCAATTTACTCTGGCAAACAGGACTCAAGGTCGAAGATTCATAACTCTC 1179
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007 ATACAATATTTTTACGAAACATTCCGCAATTTACTCTGGCAAACAGGACTCAAGGTCGAAGATTCATAACTCTC 1080
Query 1180 ATCGATAACTTTTATGATCTCAAGGTGCGTATAATTTGCTCTGCGTCGACTCCTATATCAAGCTTATTTTTGCA 1253
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081 ATCGATAACTTTTATGATCTCAAGGTGCGTATAATTTGCTCTGCGTCGACTCCTATATCAAGCTTATTTTTGCA 1154
Query 1254 TCAACATCATGACAGTGAGTTGGAGCAAAGCAGAATACTGATGGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGATTCAGCAG 1327
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155 TCAACATCATGACAGTGAGTTGGAGCAAAGCAGAATACTGATGGATGATTTGGGGCTGAGCCAGGATTCAGCAG 1228
Query 1328 AAGGACTCTCCATGTTTACCGGAGAAGAGGAAATCTTTGCATTTCAGCGCACAATTTCCCGACTCACGGAAATG 1401
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229 AAGGACTCTCCATGTTTACCGGAGAAGAGGAAATCTTTGCATTTCAGCGCACAATTTCCCGACTCACGGAAATG 1302
Query 1402 CAGACTGAACAGTACTGGAATGAAGGAGACAGAACCAAGAA- 1442
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303 CAGACTGAACAGTACTGGAATGAAGGAGACAGAACCAAGAAG 1344