Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05294
• Subject: NM_172747.2
• Aligned Length: 989
• Identities: 878
• Gaps: 4

Alignment

Query   1  ATGTCGGCGGAGGCCTCGGGCCCGGCTGCC-GCCGCGGCCCCGTCCCTGGAAGCCCCCAAG-CCCTCGGGTCTC  72
           ||||||||.||||||||||||||||| ||| ||.||||||...|.|.||| ||.||||.|| ||||||.||.|.
Sbjct   1  ATGTCGGCCGAGGCCTCGGGCCCGGC-GCCGGCTGCGGCCGAATGCTTGG-AGTCCCCTAGCCCCTCGAGTGTG  72

Query  73  GAGCCTGGCCCCGCCGCCTACGGTCTCAAGCCGCTGACCCCGAACAGCAAATACGTGAAGCTGAACGTGGGCGG  146
           |||||||||.||.||.|.|||.||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  73  GAGCCTGGCTCCCCCTCGTACAGTCTGAAGCCCCTCACCCCGAACAGCAAGTATGTGAAGCTGAACGTGGGCGG  146

Query 147  CTCGTTGCACTACACCACGCTGCGCACCCTCACGGGACAGGACACCATGCTCAAAGCCATGTTCAGCGGCCGCG  220
           ||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 147  CTCGCTGCATTACACCACGCTGCGCACCCTCACGGGGCAGGACACCATGCTCAAGGCCATGTTCAGCGGCCGCG  220

Query 221  TGGAGGTGCTGACCGATGCCGGAGGTTGGGTGCTGATTGACCGGAGCGGCCGTCACTTTGGTACAATCCTCAAT  294
           |.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 221  TTGAAGTGCTCACAGACGCGGGAGGTTGGGTGCTGATTGACCGGAGTGGCCGCCACTTTGGCACAATTCTCAAC  294

Query 295  TACCTGCGGGATGGGTCTGTGCCACTGCCGGAGAGTACGAGAGAACTGGGGGAGCTGCTGGGCGAAGCACGCTA  368
           |||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 295  TACCTGCGGGACGGGTCGGTGCCACTGCCTGAGAGTGCCAGAGAACTCGGGGAGCTGCTAGGTGAAGCCCGATA  368

Query 369  CTACCTGGTGCAGGGCCTGATTGAGGACTGCCAGCTGGCGCTGCAGCAAAAAAGGGAGACGCTGTCCCCGCTGT  442
           |||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||.||.|
Sbjct 369  CTACCTGGTCCAGGGCCTGATTGAAGACTGTCAGCTGGCGCTGCAGCAAAAAAGGGAGAAGCTGTCGCCACTAT  442

Query 443  GCCTCATCCCCATGGTGACATCTCCCCGGGAGGAGCAGCAGCTCCTGGCCAGCACCTCCAAGCCCGTGGTGAAG  516
           ||||||||||||..||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 443  GCCTCATCCCCACAGTGACATCACCCCGGGAAGAGCAGCAGCTCCTGGCCAGCACCTCCAAGCCTGTGGTGAAG  516

Query 517  CTCCTGCACAACCGCAGTAACAACAAGTACTCCTACACCAGCACTTCAGATGACAACCTACTTAAGAACATCGA  590
           ||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 517  CTTCTACACAACCGCAGTAACAACAAGTACTCTTACACCAGCACTTCAGATGACAACTTACTGAAGAACATCGA  590

Query 591  GCTGTTCGACAAGCTGGCCCTGCGCTTCCACGGGCGGCTACTCTTCCTCAAGGATGTCCTGGGGGACGAGATCT  664
           ||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct 591  GCTGTTTGACAAACTAGCCCTGCGCTTCCATGGGCGGCTGCTCTTCCTCAAGGATGTCCTAGGAGATGAGATTT  664

Query 665  GTTGCTGGTCTTTCTACGGGCAGGGCCGCAAAATCGCCGAGGTGTGCTGCACCTCCATTGTCTATGCTACGGAG  738
           |.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 665  GCTGCTGGTCTTTCTACGGGCAGGGCCGAAAAATTGCCGAGGTGTGCTGTACCTCCATAGTCTATGCTACGGAG  738

Query 739  AAGAAGCAGACCAAGGTGGAATTTCCAGAGGCCCGGATCTTCGAGGAGACCCTGAACATCCTCATCTACGAGAC  812
           |||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||.|.||.||.||||.
Sbjct 739  AAGAAGCAGACCAAGGTGGAATTCCCTGAGGCTCGGATCTTTGAGGAGACACTGAACATCTTAATTTATGAGAA  812

Query 813  TCCCCGGGGCCCAGACCCAGCCCTCCTGGAGGCCACAGGGGGAGCAGCTGGAGCTGGTGGGGCTGGCCGCGGGG  886
           |.||||.||||||||.|..||.||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||.||||
Sbjct 813  TTCCCGTGGCCCAGATCTCGCTCTCCTGGAGGCCACAGGGGGTGCAGCTGGAGGTGGTGGGGCAGGCCGAGGGG  886

Query 887  AGGATGAAGAGAACCGAGAGCACCGTGTCCGCAGGATCCATGTCCGGCGCCATATCACCCACGACGAGCGTCCT  960
           |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 887  ACGATGAAGAGAACCGAGAGCACCGTGTCCGGAGGATTCACGTCCGCCGCCATATCACCCACGATGAGCGTCCC  960

Query 961  CATGGCCAACAAATTGTCTTCAAGGAC  987
           ||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 961  CACGGCCAACAGATTGTCTTCAAGGAC  987