Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05294
• Subject: XM_011545783.3
• Aligned Length: 1041
• Identities: 986
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGTCGGCGGAGGCCTCGGGCCCGGCTGCCGCCGCGGCCCCGTCCCTGGAAGCCCCCAAGCCCTCGGGTCTCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCGGCGGAGGCCTCGGGCCCGGCTGCCGCCGCGGCCCCGTCCCTGGAAGCCCCCAAGCCCTCGGGTCTCGA  74

Query   75  GCCTGGCCCCGCCGCCTACGGTCTCAAGCCGCTGACCCCGAACAGCAAATACGTGAAGCTGAACGTGGGCGGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCCTGGCCCCGCCGCCTACGGTCTCAAGCCGCTGACCCCGAACAGCAAATACGTGAAGCTGAACGTGGGCGGCT  148

Query  149  CGTTGCACTACACCACGCTGCGCACCCTCACGGGACAGGACACCATGCTCAAAGCCATGTTCAGCGGCCGCGTG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGTTGCACTACACCACGCTGCGCACCCTCACGGGACAGGACACCATGCTCAAAGCCATGTTCAGCGGCCGCGTG  222

Query  223  GAGGTGCTGACCGATGCCGGAGGTTGGGTGCTGATTGACCGGAGCGGCCGTCACTTTGGTACAATCCTCAATTA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGGTGCTGACCGATGCCGGAGGTTGGGTGCTGATTGACCGGAGCGGCCGTCACTTTGGTACAATCCTCAATTA  296

Query  297  CCTGCGGGATGGGTCTGTGCCACTGCCGGAGAGTACGAGAGAACTGGGGGAGCTGCTGGGCGAAGCACGCTACT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCTGCGGGATGGGTCTGTGCCACTGCCGGAGAGTACGAGAGAACTGGGGGAGCTGCTGGGCGAAGCACGCTACT  370

Query  371  ACCTGGTGCAGGGCCTGATTGAGGACTGCCAGCTGGCGCT----------------------------------  410
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct  371  ACCTGGTGCAGGGCCTGATTGAGGACTGCCAGCTGGCGCTGCAGGTGAGGGCCTTCGGAGTCCCCATGCCTATG  444

Query  411  --------------------GCAGCAAAAAAGGGAGACGCTGTCCCCGCTGTGCCTCATCCCCATGGTGACATC  464
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTCCTGGGAGAGCTGCCCAAGCAGCAAAAAAGGGAGACGCTGTCCCCGCTGTGCCTCATCCCCATGGTGACATC  518

Query  465  TCCCCGGGAGGAGCAGCAGCTCCTGGCCAGCACCTCCAAGCCCGTGGTGAAGCTCCTGCACAACCGCAGTAACA  538
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCCCCGGGAGGAGCAGCAGCTCCTGGCCAGCACCTCCAAGCCCGTGGTGAAGCTCCTGCACAACCGCAGTAACA  592

Query  539  ACAAGTACTCCTACACCAGCACTTCAGATGACAACCTACTTAAGAACATCGAGCTGTTCGACAAGCTGGCCCTG  612
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAAGTACTCCTACACCAGCACTTCAGATGACAACCTACTTAAGAACATCGAGCTGTTCGACAAGCTGGCCCTG  666

Query  613  CGCTTCCACGGGCGGCTACTCTTCCTCAAGGATGTCCTGGGGGACGAGATCTGTTGCTGGTCTTTCTACGGGCA  686
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCTTCCACGGGCGGCTACTCTTCCTCAAGGATGTCCTGGGGGACGAGATCTGCTGCTGGTCTTTCTACGGGCA  740

Query  687  GGGCCGCAAAATCGCCGAGGTGTGCTGCACCTCCATTGTCTATGCTACGGAGAAGAAGCAGACCAAGGTGGAAT  760
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGGCCGCAAAATCGCCGAGGTGTGCTGCACCTCCATTGTCTATGCTACGGAGAAGAAGCAGACCAAGGTGGAAT  814

Query  761  TTCCAGAGGCCCGGATCTTCGAGGAGACCCTGAACATCCTCATCTACGAGACTCCCCGGGGCCCAGACCCAGCC  834
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTCCAGAGGCCCGGATCTTCGAGGAGACCCTGAACATCCTCATCTACGAGACTCCCCGGGGCCCAGACCCAGCC  888

Query  835  CTCCTGGAGGCCACAGGGGGAGCAGCTGGAGCTGGTGGGGCTGGCCGCGGGGAGGATGAAGAGAACCGAGAGCA  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCTGGAGGCCACAGGGGGAGCAGCTGGAGCTGGTGGGGCTGGCCGCGGGGAGGATGAAGAGAACCGAGAGCA  962

Query  909  CCGTGTCCGCAGGATCCATGTCCGGCGCCATATCACCCACGACGAGCGTCCTCATGGCCAACAAATTGTCTTCA  982
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCGTGTCCGCAGGATCCATGTCCGGCGCCATATCACCCACGACGAGCGTCCTCATGGCCAACAAATTGTCTTCA  1036

Query  983  AGGAC  987
            |||||
Sbjct 1037  AGGAC  1041