Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05356
• Subject: XM_011538221.2
• Aligned Length: 2082
• Identities: 2081
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCAGCCTGCAATTCAAGTATGGTTTGGAGAAGATCTGCCTCTAAGTCCTCGGAGTCCTCTGACTCCCAGACA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGCCTGCAATTCAAGTATGGTTTGGAGAAGATCTGCCTCTAAGTCCTCGGAGTCCTCTGACTCCCAGACA  74

Query   75  CGGACCAGGATTGGCTAATGTTTGTCAGTACGATGAGTGGATAGCTGTGAGGCATGAAGCCACTTTGTTGCCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGACCAGGATTGGCTAATGTTTGTCAGTACGATGAGTGGATAGCTGTGAGGCATGAAGCCACTTTGTTGCCCA  148

Query  149  TGCAAGAAGATCTGTCAATCTGGTTATCTGGTTTATTAGGTATTAAAGTTAAGGCAGAAAAATTATTGGAAGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TGCAAGAAGATCTGTCAATCTGGTTATCTGGTTTATTAGGTATTAAAGTTAAGGCAGAAAAATTATTGGAAGAA  222

Query  223  CTTGATAATGGAGTACTATTATGTCAACTGATTGATGTTCTTCAAAACATGGTGAAAACATGCAACTCTGAAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTTGATAATGGAGTACTATTATGTCAACTGATTGATGTTCTTCAAAACATGGTGAAAACATGCAACTCTGAAGA  296

Query  297  ATCAGGGAATTTTCCAATGAGAAAAGTGCCCTGTAAGAAAGATGCTGCATCAGGTTCATTCTTTGCTCGGGACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATCAGGGAATTTTCCAATGAGAAAAGTGCCCTGTAAGAAAGATGCTGCATCAGGTTCATTCTTTGCTCGGGACA  370

Query  371  ATACCGCAAACTTCCTTCACTGGTGTAGGGACATTGGGGTTGATGAAACTTACCTCTTTGAATCTGAAGGTTTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATACCGCAAACTTCCTTCACTGGTGTAGGGACATTGGGGTTGATGAAACTTACCTCTTTGAATCTGAAGGTTTA  444

Query  445  GTTTTGCACAAAGATCCAAGACAGGTGTATCTTTGTCTTCTTGAAATTGGTCGAATTGTGTCAAGATACGGGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTTTGCACAAAGATCCAAGACAGGTGTATCTTTGTCTTCTTGAAATTGGTCGAATTGTGTCAAGATACGGGGT  518

Query  519  TGAGCCACCAGTGTTAGTAAAACTTGAGAAAGAAATTGAGTTAGAAGAGACTTTGCTTAATACTTCTGGGCCTG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAGCCACCAGTGTTAGTAAAACTTGAGAAAGAAATTGAGTTAGAAGAGACTTTGCTTAATACTTCTGGGCCTG  592

Query  593  AAGATTCCATCAGCATTCCAAAATCATGCTGTCGGCATGAAGAGCTACATGAAGCTGTTAAACATATTGCTGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGATTCCATCAGCATTCCAAAATCATGCTGTCGGCATGAAGAGCTACATGAAGCTGTTAAACATATTGCTGAG  666

Query  667  GACCCTCCTTGTAGTTGTTCTCATCGATTTTCTATTGAGTATTTATCTGAAGGACGGTACCGACTAGGGGATAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACCCTCCTTGTAGTTGTTCTCATCGATTTTCTATTGAGTATTTATCTGAAGGACGGTACCGACTAGGGGATAA  740

Query  741  AATACTCTTTATAAGAATGCTTCATGGAAAACATGTCATGGTTCGCGTTGGTGGAGGCTGGGATACTCTTCAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AATACTCTTTATAAGAATGCTTCATGGAAAACATGTCATGGTTCGCGTTGGTGGAGGCTGGGATACTCTTCAAG  814

Query  815  GATTTTTGCTTAAATATGACCCCTGTCGAATATTACAGTTTGCCACACTAGAACAAAAAATTTTAGCATTTCAA  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GATTTTTGCTTAAATATGACCCCTGTCGAATATTACAGTTTGCCACATTAGAACAAAAAATTTTAGCATTTCAA  888

Query  889  AAAGGAGTTTCTAATGAAAGTGTACCTGATTCGCCTGCCAGAACACCTCAGCCTCCTGAAATGAATCCTTTGTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAGGAGTTTCTAATGAAAGTGTACCTGATTCGCCTGCCAGAACACCTCAGCCTCCTGAAATGAATCCTTTGTC  962

Query  963  AGCAGTTAACATGTTTCAGAAACAAAATTCAAAACCCAGCGTGCCAGTTAGTATTCCAAAAAGCAAAGAAAAAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGCAGTTAACATGTTTCAGAAACAAAATTCAAAACCCAGCGTGCCAGTTAGTATTCCAAAAAGCAAAGAAAAAC  1036

Query 1037  AGGGACGTCCACCAGGTGCATTGGTGCCAGCATCTTCACTGAAAGGAGGTAATCTGGGCTCTATGTCAGTCCGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGGGACGTCCACCAGGTGCATTGGTGCCAGCATCTTCACTGAAAGGAGGTAATCTGGGCTCTATGTCAGTCCGT  1110

Query 1111  TCTAAATTGCCAAATTCTCCAGCAGCATCTTCTCATCCCAAGCTCAAGTCTTCAAAAGGCATAACGAAGAAACC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TCTAAATTGCCAAATTCTCCAGCAGCATCTTCTCATCCCAAGCTCAAGTCTTCAAAAGGCATAACGAAGAAACC  1184

Query 1185  GCAGGCTCCTTCAAACAATGCATCATCTTCACTTGCTTCATTAAATCCAGTAGGTAAAAACACTTCTTCACCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGGCTCCTTCAAACAATGCATCATCTTCACTTGCTTCATTAAATCCAGTAGGTAAAAACACTTCTTCACCAG  1258

Query 1259  CTTTACCAAGAACTGCACCTTGTATATCTGAGTCACCGAGAAAATGTATTTCATCCCCCAATACCCCCAAGGCC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTTTACCAAGAACTGCACCTTGTATATCTGAGTCACCGAGAAAATGTATTTCATCCCCCAATACCCCCAAGGCC  1332

Query 1333  AAGGTTATTCCAGCCCAGAATTCAGCAGATCTGCCCGAGTCCACACTTTTGCCAAATAAGTGTTCAGGAAAAAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGGTTATTCCAGCCCAGAATTCAGCAGATCTGCCCGAGTCCACACTTTTGCCAAATAAGTGTTCAGGAAAAAC  1406

Query 1407  TCAACCTAAGTATTTGAAACATAATCATATTTCTTCCAGAGATAATGCAGTATCTCACTTAGCTGCACATTCAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCAACCTAAGTATTTGAAACATAATCATATTTCTTCCAGAGATAATGCAGTATCTCACTTAGCTGCACATTCAA  1480

Query 1481  ATTCATCCTCAAAATGTCCCAAGCTGCCTAAAGCAAATATACCTGTAAGACCTAAACCTTCTTTCCAGTCCTCT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATTCATCCTCAAAATGTCCCAAGCTGCCTAAAGCAAATATACCTGTAAGACCTAAACCTTCTTTCCAGTCCTCT  1554

Query 1555  GCAAAAATGACAAAAACCAGTTCCAAAACCATAGCCACGGGTCTAGGAACACAGTCTCAACCATCCGATGGAGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCAAAAATGACAAAAACCAGTTCCAAAACCATAGCCACGGGTCTAGGAACACAGTCTCAACCATCCGATGGAGC  1628

Query 1629  CCCACAAGCAAAGCCAGTCCCAGCACAGAAACTTAAATCGGCCTTGAATTTAAATCAGCCAGTTTCTGTGTCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CCCACAAGCAAAGCCAGTCCCAGCACAGAAACTTAAATCGGCCTTGAATTTAAATCAGCCAGTTTCTGTGTCCT  1702

Query 1703  CAGTTTCTCCTGTAAAAGCCACACAGAAATCAAAAGATAAGAATATAGTTTCAGCTACCAAAAAGCAGCCTCAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CAGTTTCTCCTGTAAAAGCCACACAGAAATCAAAAGATAAGAATATAGTTTCAGCTACCAAAAAGCAGCCTCAG  1776

Query 1777  AATAAAAGTGCATTTCAGAAGACAGGACCCAGCTCCTTGAAGTCTCCTGGCCGTACCCCACTGTCCATCGTGAG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AATAAAAGTGCATTTCAGAAGACAGGACCCAGCTCCTTGAAGTCTCCTGGCCGTACCCCACTGTCCATCGTGAG  1850

Query 1851  CCTACCCCAGTCTTCTACCAAAACACAAACTGCACCGAAGTCAGCACAGACTGTCGCTAAGAGCCAGCATTCAA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTACCCCAGTCTTCTACCAAAACACAAACTGCACCGAAGTCAGCACAGACTGTCGCTAAGAGCCAGCATTCAA  1924

Query 1925  CTAAAGGGCCTCCCAGAAGTGGCAAAACCCCAGCTTCAATCAGGAAACCACCCTCATCTGTTAAGGATGCAGAT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTAAAGGGCCTCCCAGAAGTGGCAAAACCCCAGCTTCAATCAGGAAACCACCCTCATCTGTTAAGGATGCAGAT  1998

Query 1999  AGTGGAGATAAAAAACCTACTGCAAAGAAAAAGGAAGATGATGACCATTATTTTGTCATGACTGGAAGTAAGAA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGTGGAGATAAAAAACCTACTGCAAAGAAAAAGGAAGATGATGACCATTATTTTGTCATGACTGGAAGTAAGAA  2072

Query 2073  ACCTAGAAAA  2082
            ||||||||||
Sbjct 2073  ACCTAGAAAA  2082