Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05397
- Subject:
- NM_175165.3
- Aligned Length:
- 841
- Identities:
- 707
- Gaps:
- 20
Alignment
Query 1 ATGTCAACAATTGGGAGTTTTGAAGGATTCCAGGCTGTGTCTCTGAAGCAAGAGGGAGATGACCAACCCTCTGA 74
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||.|.||||||.||||||||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCAACAATTGGGAGCTTTGACGGATTCCAGCCCGTGTCTTTGAAGCAAGAGGAAGAGGACCAACCCTCTGA 74
Query 75 GACTGACCACCTATC-------GATGG------AGGAAGAGGACCC--GATGCCAAGACAGATTTCAAGGCAGT 133
.|.|||||||.|.|| ||.|| |||.| ||||||| ||| ||||...|||||||||.|||
Sbjct 75 AAATGACCACTTGTCCACAAAGGAGGGGAATTCAGGCA-AGGACCCAGGAT--CAAGGAGGATTTCAAGACAG- 144
Query 134 CA-AGTGTGACCGAATCAACTCTTTACCCCAATCCTTATCATCAGCCTTATATCTCACGGAAGTACTTTGCTAC 206
|| |||.|.||..||.|.||.||.||||||||||||||||..|||||.|||.|.||||||||||||||||.|||
Sbjct 145 CAGAGTATAACTAAAGCGACACTGTACCCCAATCCTTATCGCCAGCCCTATGTTTCACGGAAGTACTTTGTTAC 218
Query 207 ACGGCCGGGGGCCATTGAGACTGCCATGGAAGACTTGAAAGGTCACGTAGCTGAGACTTCTGGAGAGACCATTC 280
||||||.|||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||.||||..||||||||||.|||||..|||
Sbjct 219 ACGGCCAGGGGCCATTGAGACTGCTGTGGAAGACTTGAAAGGCCACATAGCACAGACTTCTGGGGAGACTGTTC 292
Query 281 AAGGCTTCTGGCTCTTGACAAAGATAGACCACTGGAACAATGAGAAGGAGAGAATTCTACTGGTCACAGACAAG 354
||||||||||||||.|||||.||||.||.||||||||||||||||||||||..||.||.||..|||||||||||
Sbjct 293 AAGGCTTCTGGCTCCTGACAGAGATTGATCACTGGAACAATGAGAAGGAGAAGATCCTGCTACTCACAGACAAG 366
Query 355 ACTCTCTTGATCTGCAAATACGACTTCATCATGCTGAGTTGTGTGCAGCTGCAGCGGATTCCTCTGAGCGCTGT 428
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||||.|.||||.||||..||..|
Sbjct 367 ACCCTCTTGATCTGCAAATACGACTTCATCATGCTCAGCTGTGTGCAGGTGCAGCAGGTTCCCCTGAATGCCAT 440
Query 429 CTATCGCATCTGCCTGGGCAAGTTCACCTTCCCTGGGATGTCCCTGGACAAGAGACAAGGAGAAGGCCTTAGGA 502
||...|||||||.|||||||||||....|||||.||||||||.|||||||||||||.||||||.|||||.||||
Sbjct 441 CTGCTGCATCTGTCTGGGCAAGTTTGTTTTCCCAGGGATGTCTCTGGACAAGAGACCAGGAGATGGCCTAAGGA 514
Query 503 TCTACTGGGGGAGTCCGGAGGAGCAGTCTCTTCTGTCCCGCTGGAACCCATGGTCCACTGAAGTTCCTTATGCT 576
|.|.|||||||||..|.||||.|..||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 515 TTTTCTGGGGGAGCACCGAGGGGTGGTCTCTACTGTCTCGTTGGAACCCGTGGTCCACTGAAGTTCCCTATGCC 588
Query 577 ACTTTCACTGAGCATCCTATGAAATACACCAGTGAGAAATTCCTTGAAATTTGCAAGTTGTCTGGGTTCATGTC 650
||.|||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||.|||||..||
Sbjct 589 ACCTTCACAGAGCATCCTATGAAACAGACCAGTGAGAAGTTCCTTGAGATCTGCAAGTTGTCTGAGTTCACCTC 662
Query 651 TAAGCTTGTTCCAGCTATCCAGAATGCCCACAAGAATTCAACTGGATCTGGAAGAGGAAAGAAACTGATGGTGT 724
|||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||.|||||.||||||
Sbjct 663 TAAGCTTGTTCCAGCCATCGAGAATGCCCACAAGAATTCTGCTGGATCTGGAAGTGGAAAGGAACTGGTGGTGT 736
Query 725 TAACTGAACCCATTTTGATTGAGACCTACACAGGGCTGATGTCATTCATTGGAAACCGCAACAAACTTGGCTAT 798
||||..||||.||..||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 TAACCCAACCTATACTGATTGAGACCTACACAGGGCTCATGTCATTCATTGGAAACCGCAACAAACTTGGCTAT 810
Query 799 TCCCTTGCCCGTGGGAGTATTGGTTTT 825
||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 811 TCCCTTGCTCGTGGGAGTATTGGCTTT 837