Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05405
• Subject: XM_017009387.1
• Aligned Length: 1516
• Identities: 1242
• Gaps: 269

Alignment

Query    1  ATGAAAAGAAGCAAAGAATTGATAACTAAAAATCATAGTCAAGAGGAAACAAGTATTCTTCGTTGTTGGAAATG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAAAGAAGCAAAGAATTGATAACTAAAAATCATAGTCAAGAGGAAACAAGTATTCTTCGTTGTTGGAAATG  74

Query   75  TAGAAAATGTATAGCAAGCTCTGGTTGTTTTATGGAGTATCTTGAGAATCAAGTGATTAAGGATAAAGATGATT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TAGAAAATGTATAGCAAGCTCTGGTTGTTTTATGGAGTATCTTGAGAATCAAGTGATTAAGGATAAAGATGATT  148

Query  149  CAGTTGATGCTCAAAATATTTGTCATGTGTGGCACATGAATGTAGAAGCCCTTCCAGAATGGATAAGCTGCCTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAGTTGATGCTCAAAATATTTGTCATGTGTGGCACATGAATGTAGAAGCCCTTCCAGAATGGATAAGCTGCCTA  222

Query  223  ATCCAAAAAGCCCAGTGGACAGTTGGAAAACTGAATTGTCCTTTCTGTGGGGCCCGTTTAGGGGGCTTTAATTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATCCAAAAAGCCCAGTGGACAGTTGGAAAACTGAATTGTCCTTTCTGTGGGGCCCGTTTAGGGGGCTTTAATTT  296

Query  297  TGTCAGCACTCCAAAATGTTCCTGTGGCCAGCTTGCAGCTGTACATCTCTCCAAGAGCCGGACTGATTATCAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGTCAGCACTCCAAAATGTTCCTGTGGCCAGCTTGCAGCTGTACATCTCTCCAAGAGCCGGACTGATTATCAGC  370

Query  371  CAACACAGGCAGGCAGACTAATGAGACCATCAGTGAAATACTTGTCACATCCTAGAGTTCAGTCAGGTTGTGAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAACACAGGCAGGCAGACTAATGAGACCATCAGTGAAATACTTGTCACATCCTAGAGTTCAGTCAGGTTGTGAC  444

Query  445  AAGGAAGCTCTGCTGACAGGTGGTGGCTCTGAAAACAGAAATCACAGGCTTTTAAACATGGCCCGAAATAATAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAGGAAGCTCTGCTGACAGGTGGTGGCTCTGAAAACAGAAATCACAGGCTTTTAAACATGGCCCGAAATAATAA  518

Query  519  TGACCCTGGAAGATTAACAGAAGCACTCTGCCTGGAGGTGCGACCAACATATTTTGAGATGAAGAACGAAAAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGACCCTGGAAGATTAACAGAAGCACTCTGCCTGGAGGTGCGACCAACATATTTTGAGATGAAGAACGAAAAAC  592

Query  593  TGCTGTCCAAAGCATCAGAACCAAAATACCAGCTTTTTGTTCCCCAGCTTGTGACTGGCAGATGCGCTACAAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGCTGTCCAAAGCATCAGAACCAAAATACCAGCTTTTTGTTCCCCAGCTTGTGACTGGCAGATGCGCTACAAGA  666

Query  667  GCTTTTCATAGAAAATCACATAGTTTGGATCTGAACATCAGTGAGAAACTGACTTTATTACCCACTTTATATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCTTTTCATAGAAAATCACATAGTTTGGATCTGAACATCAGTGAGAAACTGACTTTATTACCCACTTTATATGA  740

Query  741  AATACATAGTAAGACTACTGCCTATTCCAGACTAAATGAAACACAGCCTATTGACCTTTCAGGCTTGCCTTTAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AATACATAGTAAGACTACTGCCTATTCCAGACTAAATGAAACACAGCCTATTGACCTTTCAGGCTTGCCTTTAC  814

Query  815  AATCTAGTAAAAATAGCTATTCCTTTCAGAATCCATCCAGTTTTGATCCTAGTATGCTGCTGCAAAGATTTTCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AATCTAGTAAAAATAGCTATTCCTTTCAGAATCCATCCAGTTTTGATCCTAGTATGCTGCTGCAAAGATTTTCA  888

Query  889  GTGGCCCCCCATGAGACCCAGACACAAAGAGGAGGAGAATTTCAGTGTGGTCTAGAAGCTGCTTCAGTGTATTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGGCCCCCCATGAGACCCAGACACAAAGAGGAGGAGAATTTCAGTGTGGTCTAGAAGCTGCTTCAGTGTATTC  962

Query  963  TGACCATACTAATACTAACAATCTGACTTTCCTGATGGACCTGCCCTCAGCTGGCAGGAGCATGCCGGAGGCCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGACCATACTAATACTAACAATCTGACTTTCCTGATGGACCTGCCCTCAGCTGGCAGGAGCATGCCGGAGGCCT  1036

Query 1037  CAGACCAGGAAGAGCACCTCTCCCCTCTGGACTTCCTGCACTCAGCCAATTTTTCATTGGGCAGCATTAATCAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGACCAGGAAGAGCACCTCTCCCCTCTGGACTTCCTGCACTCAGCCAATTTTTCATTGGGCAGCATTAATCAG  1110

Query 1111  AGGCTTAATAAGAGAGAAAGGAGCAAGTTGAAGAATCTAAGAAGGAAACAACGAAGGCGTGAAAGATGGCTACA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGCTTAATAAGAGAGAAAGGAGCAAGTTGAAGAATCTAAGAAGGAAACAACGAAGGCGTGAAAGATGGCTACA  1184

Query 1185  GAAGCAGGGTAAATACTCAGGAGTGGGATTGCTGGATCATATGGTAAGTATATATTT-----ACTT---ATA--  1248
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|...| |||.|||     ||||   |||  
Sbjct 1185  GAAGCAGGGTAAATACTCAGGAGTGGGATTGCTGGATCATATGTTTTCT-TATGTTTTGCAGACTTTGAATAAT  1257

Query 1249  --------------------------------------------------------------------------  1248
                                                                                      
Sbjct 1258  GAGATGAGTACAGATGAAGACAATGAATATGCAGAAGAAAAGGATAGCTACATCTGTGCAGTGTGTCTGGACGT  1331

Query 1249  --------------------------------------------------------------------------  1248
                                                                                      
Sbjct 1332  TTATTTCAACCCTTATATGTGTTACCCTTGCCATCACATCTTCTGTGAGCCCTGCTTACGGACTCTGGCCAAAG  1405

Query 1249  --------------------------------------------------------------------------  1248
                                                                                      
Sbjct 1406  ACAATCCTTCAAGCACTCCATGCCCATTGTGTCGGACAATTATTTCTAGAGTCTTTTTCCAAACAGAAGGAGGA  1479

Query 1249  ------------------------------------  1248
                                                
Sbjct 1480  GGAAGAGGGAGAGGAAAAGGAAGGGAAGGGAAGGAA  1515