Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05423
- Subject:
- NM_175738.5
- Aligned Length:
- 681
- Identities:
- 588
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 AT-GACGGGCACGCCAGGCGCCG-TTGCCACCCGGGATGGCGAGGCCCCCGAGCGCT-------CCCCGCCCTG 65
|| |||..||| .||.| ||| ||.|.|||.|||| ||.|..|.|||.|| || ||.||.||||
Sbjct 1 ATGGACCTGCA---GAGAC-CCGATTCCTACCAGGGA-GGAGCTGGCCCTGA---CTTCAACGACCACGTCCTG 66
Query 66 CAGTCCGAGCTACGACCTCACGGGCAAGGTGATGCTTCTGGGAGACACAGGCGTCGGCAAAACATGTTTCCTGA 139
|| ||.|||| ||.||..||||.||||..||.||.||.||.||.|.|.|.|||.
Sbjct 67 CA--------TAAGACC--------------ATCCTGGTGGGTGACAGTGGTGTGGGAAAGACGTCTCTGCTGG 118
Query 140 TCCAATTCAAAGA-CGGGGC--CTTCCTGTCCGGAACCTTCATAGCCACCGTCGGCATAGACTTCAGGAACAAG 210
|.||.||| || |.|||| .|||.|..||||..|||||...|||||.||.|||||.|..||||.|||||||
Sbjct 119 TTCAGTTC---GATCAGGGCAAGTTCATCCCCGGCTCCTTCTCGGCCACTGTGGGCATCGGATTCACGAACAAG 189
Query 211 GTGGTGACTGTGGATGGCGTGAGAGTGAAGCTGCAGATCTGGGACACCGCTGGGCAGGAACGGTTCCGAAGCGT 284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190 GTGGTGACTGTGGATGGCGTGAGAGTGAAGCTGCAGATCTGGGACACCGCTGGGCAGGAACGGTTCCGAAGCGT 263
Query 285 CACCCATGCTTATTACAGAGATGCTCAGGCCTTGCTTCTGCTGTATGACATCACCAACAAATCTTCTTTCGACA 358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264 CACCCATGCTTATTACAGAGATGCTCAGGCCTTGCTTCTGCTGTATGACATCACCAACAAATCTTCTTTCGACA 337
Query 359 ACATCAGGGCCTGGCTCACTGAGATTCATGAGTATGCCCAGAGGGACGTGGTGATCATGCTGCTAGGCAACAAG 432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338 ACATCAGGGCCTGGCTCACTGAGATTCATGAGTATGCCCAGAGGGACGTGGTGATCATGCTGCTAGGCAACAAG 411
Query 433 GCGGATATGAGCAGCGAAAGAGTGATCCGTTCCGAAGACGGAGAGACCTTGGCCAGGGAGTACGGTGTTCCCTT 506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412 GCGGATATGAGCAGCGAAAGAGTGATCCGTTCCGAAGACGGAGAGACCTTGGCCAGGGAGTACGGTGTTCCCTT 485
Query 507 CCTGGAGACCAGCGCCAAGACTGGCATGAATGTGGAGTTAGCCTTTCTGGCCATCGCCAAGGAACTGAAATACC 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486 CCTGGAGACCAGCGCCAAGACTGGCATGAATGTGGAGTTAGCCTTTCTGGCCATCGCCAAGGAACTGAAATACC 559
Query 581 GGGCCGGGCATCAGGCGGATGAGCCCAGCTTCCAGATCCGAGACTATGTAGAGTCCCAGAAGAAGCGCTCCAGC 654
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560 GGGCCGGGCATCAGGCGGATGAGCCCAGCTTCCAGATCCGAGACTATGTAGAGTCCCAGAAGAAGCGCTCCAGC 633
Query 655 TGCTGCTCCTTCATG 669
|||||||||||||||
Sbjct 634 TGCTGCTCCTTCATG 648