Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05463
- Subject:
- XM_005263657.4
- Aligned Length:
- 1176
- Identities:
- 828
- Gaps:
- 348
Alignment
Query 1 ATGTCTCGGGAACCCACCCCACCTCTACCTGGAGATATGTCTACTGGTCCCATAGCAGAAAGCTGGTGTTACAC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 ACAGGTTAAAGTAGTAAAATTTTCCTATATGTGGACCATTAATAACTTCAGTTTTTGTCGAGAGGAAATGGGTG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AAGTGTTAAAAAGTTCAACATTTTCATCTGGCCCAAGTGACAAAATGAAATGGTGCCTGAGGGTAAACCCAAAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GGATTAGATGATGAAAGTAAAGACTACTTGTCCTTATATTTGCTTTTAGTCAGCTGCCCCAAAAGTGAAGTTCG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 AGCAAAATTCAAATTTTCCCTTCTGAATGCTAAAAGGGAAGAAACAAAAGCAATGGAAAGCCAAAGAGCATATC 370
||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------ATGGAAAGCCAAAGAGCATATC 22
Query 371 GATTTGTGCAAGGGAAGGACTGGGGTTTTAAAAAATTCATTAGAAGGGACTTTTTGCTTGATGAAGCTAATGGT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 23 GATTTGTGCAAGGGAAGGACTGGGGTTTTAAAAAATTCATTAGAAGGGACTTTTTGCTTGATGAAGCTAATGGT 96
Query 445 CTTTTACCAGATGACAAGCTTACATTATTTTGTGAGGTGAGTGTGGTCCAAGATTCAGTAAACATATCAGGACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 97 CTTTTACCAGATGACAAGCTTACATTATTTTGTGAGGTGAGTGTGGTCCAAGATTCAGTAAACATATCAGGACA 170
Query 519 TACTAATACAAATACTTTGAAGGTGCCTGAGTGTCGTCTAGCAGAAGATTTAGGTAATCTCTGGGAAAACACAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 171 TACTAATACAAATACTTTGAAGGTGCCTGAGTGTCGTCTAGCAGAAGATTTAGGTAATCTCTGGGAAAACACAA 244
Query 593 GATTTACAGACTGCAGTTTTTTCGTGAGAGGACAAGAATTTAAAGCTCATAAATCTGTGCTTGCAGCTCGATCT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 245 GATTTACAGACTGCAGTTTTTTCGTGAGAGGACAAGAATTTAAAGCTCATAAATCTGTGCTTGCAGCTCGATCT 318
Query 667 CCAGTTTTTAACGCCATGTTTGAACATGAAATGGAAGAAAGCAAAAAGAATCGAGTGGAAATAAATGATTTAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 319 CCAGTTTTTAACGCCATGTTTGAACATGAAATGGAAGAAAGCAAAAAGAATCGAGTGGAAATAAATGATTTAGA 392
Query 741 CCCTGAAGTTTTTAAAGAAATGATGAGATTCATTTACACAGGGAGAGCACCAAACCTTGACAAAATGGCTGACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 393 CCCTGAAGTTTTTAAAGAAATGATGAGATTCATTTACACAGGGAGAGCACCAAACCTTGACAAAATGGCTGACA 466
Query 815 ACTTGTTGGCAGCTGCAGACAAATATGCACTGGAACGGCTGAAGGTCATGTGCGAAGAAGCTTTGTGTAGTAAC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 467 ACTTGTTGGCAGCTGCAGACAAATATGCACTGGAACGGCTGAAGGTCATGTGCGAAGAAGCTTTGTGTAGTAAC 540
Query 889 CTCTCAGTAGAGAATGTTGCAGATACCCTTGTCCTTGCAGATTTGCACAGTGCAGAACAGTTGAAAGCACAAGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 541 CTCTCAGTAGAGAATGTTGCAGATACCCTTGTCCTTGCAGATTTGCACAGTGCAGAACAGTTGAAAGCACAAGC 614
Query 963 CATAGACTTTATTAATAGGTGCAGTGTACTTCGACAACTTGGGTGTAAAGATGGGAAAAACTGGAACAGCAACC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 615 CATAGACTTTATTAATAGGTGCAGTGTACTTCGACAACTTGGGTGTAAAGATGGGAAAAACTGGAACAGCAACC 688
Query 1037 AAGCAACCGACATAATGGAAACATCAGGGTGGAAGTCCATGATTCAGTCTCACCCTCATTTAGTAGCAGAAGCC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 689 AAGCAACCGACATAATGGAAACATCAGGGTGGAAGTCCATGATTCAGTCTCACCCTCATTTAGTAGCAGAAGCC 762
Query 1111 TTTCGAGCACTAGCATCTGCACAGTGTCCACAGTTTGGCATTCCACGCAAACGGCTAAAACAGTCC 1176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 763 TTTCGAGCACTAGCATCTGCACAGTGTCCACAGTTTGGCATTCCACGCAAACGGCTAAAACAGTCC 828