Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05602
• Subject: XM_011514597.2
• Aligned Length: 1956
• Identities: 1953
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGAGAATCCAAGGTGCCCAAGGAGGCCCCTGGCGGAGAAGAAAGCCAGGTCTCTGGACAGGCCGCAGGCCCC  74
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Sbjct    1  ATGGAGAATCCAAGGTGCCCAAGGAGGCCCCTGGCGGAGAAGAAAGCCAGGTCTCTGGACAGGCCGCAGGCCCC  74

Query   75  CGGGAAAGGCTCGGAGTCGTGGGACTGCCATTGGCTCTCCCTGCCCACTGCCCCCTCCAGGAAGGCGCTTCACT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGGAAAGGCTCGGAGTCGTGGGACTGCCATTGGCTCTCCCTGCCCACTGCCCCCTCCAGGAAGGCGCTTCACT  148

Query  149  GGACGACCAGTGATTGGGCCAGACATTCAGACAGCCCAGCTCCATCTGCAGAGGCTCACTGCACCACCGCTGCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGACGACCAGTGATTGGGCCAGACATTCAGACAGCCCAGCTCCATCTGCAGAGGCTCACTGCACCACCGCTGCA  222

Query  223  GCCCCCACTCCCGAGGAGACCGGAGATTTTCTCCCCAGCGAGCAGAGGCCTTCGCAAGACACCAAGAAGGGGTG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCCCCCACTCCCGAGGAGACCGGAGATTTTCTCCCCAGCGAGCAGAGGCCTTCGCAAGACACCAAGAAGGGGTG  296

Query  297  GCTGAAGACCATGCTGAACTTCTTCGTGAGGACGGGCCCTGAGGAGCCCAGAGAAAAGGCCAGCAGGAGGCCAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGAAGACCATGCTGAACTTCTTCGTGAGGACGGGCCCTGAGGAGCCCAGAGAAAAGGCCAGCAGGAGGCCAA  370

Query  371  GGGGGAAGGAGGGTATCTCCCAGCATCCGGAGCCCCTGGAAGCAGCAGGGGAGCCAGCCCTCAGGAAGAAAGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGGGGAAGGAGGGTATCTCCCAGCATCCGGAGCCCCTGGAAGCAGCAGGGGAGCCAGCCCTCAGGAAGAAAGCC  444

Query  445  CACCACGACAAGAAGCCCAGCCGCAAGAAGCAAGGTCACAAGAAACACGCGGCCGAGGTGACTAAGGCAGCTCA  518
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Sbjct  445  CACCACGACAAGAAGCCCAGCCGCAAGAAGCAAGGTCACAAGAAACACGCGGCCGAGGTGACTAAGGCAGCTCA  518

Query  519  AGACCAGGAGGCCAGAGGCCGAGAGGAAGGGTTGTCCAAGGCAGCTGCTGCCTTGCGCTCCGGGGAGGCTGACC  592
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Sbjct  519  AGACCAGGAGGCCAGAGGCCGAGAGGAAGGGTTGTCCAAGGCAGCTGCTGCCTTGCGCTCCGGGGAGGCTGACC  592

Query  593  TGGGCCCAGCTCGCAGGGGTGGGGAAGATTCTGATCACCAGTCCTTCCTCATCAAAGTGGATGGTACTGGAGCT  666
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Sbjct  593  TGGGCCCAGCTCGCAGGGGTGGGGAAGATTCTGATCACCAGTCCTTCCTCATCAAAGTGGATGGTACTGGAGCT  666

Query  667  TTGGATGTTTCTCCCCATGCCACAGGTCATCAGCAAGAAGAGGAGCTCAAAAAGCCTGACCAGGATGCTATCAT  740
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Sbjct  667  TTGGATGTTTCTCCCCATGCCACAGGTCATCAGCAAGAAGAGGAGCTCAAAAAGCCTGACCAGGATGCTATCAT  740

Query  741  TCAGATGATAGTGGAATTGCTCAAAAGAGTGGGAGACCAGTGGGAAGAAGAGCAATCTCTGGCCTCACAGCTGG  814
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Sbjct  741  TCAGATGATAGTGGAATTGCTCAAAAGAGTGGGAGACCAGTGGGAAGAAGAGCAATCTCTGGCCTCACAGCTGG  814

Query  815  GGGTGGCCCTGCCAAACCCAGCACCAGCTGTTAGGAAGAAATCCCAAGAGAAAAAGACAAGCCTCAAGAGAACC  888
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Sbjct  815  GGGTGGCCCTGCCAAACCCAGCACCAGCTGTTAGGAAGAAATCCCAAGAGAAAAAGACAAGCCTCAAGAGAACC  888

Query  889  TCAAAGACAAACCCCAAGAAACACGGCTCCGAGGAGGCCAAGAGGGGGGCTGCAGATGTTTCCAGTCCAGAGGC  962
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Sbjct  889  TCAAAGACAAACCCCAAGAAACACGGCTCCGAGGAGGCCAAGAGGGGGGCTGCAGATGTTTCCAGTCCAGAGGC  962

Query  963  CTGGCCACCCAAGAAGTCCAGCTTTCTGCCCCTGTGTGTCAGCGGCCATCGGCCTTCCATCTCCAGCAGCTATG  1036
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Sbjct  963  CTGGCCACCCAAGAAGTCCAGCTTTCTGCCCCTGTGTGTCAGCGGCCATCGGCCTTCCATCTCCAGCAGCTATG  1036

Query 1037  GCTTGGAAGAACCTAAAGTCCAGGAGGCCCCATCTACAGAGGCTGGGGCTCCAGGTCCCTCCGTGCTTCCCACC  1110
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Sbjct 1037  GCTTGGAAGAACCTAAAGTCCAGGAGGCCCCATCTACAGAGGCTGGGGCTCCAGGTCCCTCCGTGCTTCCCACC  1110

Query 1111  CCATCAGAGAGCCAGGAACCTGGAGAGGAGCTTCCGCTGGACAGAGCCTCGGAATACAAAGAATTCATTCAGAA  1184
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Sbjct 1111  CCATCAGAGAGCCAGGAACCTGGAGAGGAGCTTCCGCTGGACAGAGCCTCGGAATACA---AATTCATTCAGAA  1181

Query 1185  GATCATTTCCATGCTCCAAGATGCAGAAGAACAGCAAGGAGAGGAGCAACCTCAAGTCCAGCAGGAAGAGGTGG  1258
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Sbjct 1182  GATCATTTCCATGCTCCAAGATGCAGAAGAACAGCAAGGAGAGGAGCAACCTCAAGTCCAGCAGGAAGAGGTGG  1255

Query 1259  GTGTAGAAAACCCGGCCCCACACTGCAGAAGGAAATCTCAAGAAAAAAGGTCGAGCTTCAGGAGAGCGTTTTAC  1332
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Sbjct 1256  GTGTAGAAAACCCGGCCCCACACTGCAGAAGGAAATCTCAAGAAAAAAGGTCGAGCTTCAGGAGAGCGTTTTAC  1329

Query 1333  CATAAGAAACACACCTCCAAGGAACCCAGAAGAGCGGGGGCAGCAGGGGCTGCCAGCCCAGAGGCCCGACGACC  1406
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Sbjct 1330  CATAAGAAACACACCTCCAAGGAACCCAGAAGAGCGGGGGCAGCAGGGGCTGCCAGCCCAGAGGCCCGACGACC  1403

Query 1407  CAAGAGGCCCAGCTTTCTGCCCCTGTGTGTTGGTGGCCATCGGCCCTCCACCTCCAGCAGCCTTGATCCAGAAG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404  CAAGAGGCCCAGCTTTCTGCCCCTGTGTGTTGGTGGCCATCGGCCCTCCACCTCCAGCAGCCTTGATCCAGAAG  1477

Query 1481  ATCTCGAGTGCCGGGAGCCCCTGCCCGCAGAAGGGGAGCCAGTTGTGATCTCAGAAGCACCCTCCCAGGCTAGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  ATCTCGAGTGCCGGGAGCCCCTGCCCGCAGAAGGGGAGCCAGTTGTGATCTCAGAAGCACCCTCCCAGGCTAGA  1551

Query 1555  GGCCACACGCCAGAAGGGGCACCTCAGCTGAGTGGAGCATGTGAATCTAAGGAGATCATCATCCAGAAGCTTGT  1628
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Sbjct 1552  GGCCACACGCCAGAAGGGGCACCTCAGCTGAGTGGAGCATGTGAATCTAAGGAGATCATCATCCAGAAGCTTGT  1625

Query 1629  GGCACTTCTCCAAGAAGTGGATGGCCAACTGGGGCAGCAGATCAGGCGCCACCCCAGCTTTAAGAGGTTTTTTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  GGCACTTCTCCAAGAAGTGGATGGCCAACTGGGGCAGCAGATCAGGCGCCACCCCAGCTTTAAGAGGTTTTTTT  1699

Query 1703  ACGAGTTCTCGGACTCCTCCCTCAGCAAGCTGGTAGCCACCCTGCGCAGCCAGGTGGCTCACTCCTCTAAGCTG  1776
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Sbjct 1700  ACGAGTTCTCGGACTCCTCCCTCAGCAAGCTGGTAGCCACCCTGCGCAGCCAGGTGGCTCACTCCTCTAAGCTG  1773

Query 1777  GACAGGAACCGCGCCAGGAGACTCTACCAGTTTGACGTTAGCTTAGCTAACAAATTTGCTGGCAGCAACAGCCA  1850
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Sbjct 1774  GACAGGAACCGCGCCAGGAGACTCTACCAGTTTGACGTTAGCTTAGCTAACAAATTTGCTGGCAGCAACAGCCA  1847

Query 1851  TGCCATGTGCATCCTCATGGGCCTAAGAGACCACTACAATTGCACCCAGTTCCCATACAGGGAGGACCAGCCGA  1924
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Sbjct 1848  TGCCATGTGCATCCTCATGGGCCTAAGAGACCACTACAATTGCACCCAGTTCCCATACAGGGAGGACCAGCCGA  1921

Query 1925  ACATCACAAGTCCTAAGGTTGAAAGTCCAGAT  1956
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Sbjct 1922  ACATCACAAGTCCTAAGGTTGAAAGTCCAGAT  1953