Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05603
• Subject: XM_011535818.3
• Aligned Length: 774
• Identities: 747
• Gaps: 24

Alignment

Query   1  -----------------------AT-GGCCGAAGGCGGGGCTAGCAAAGGTGGTGGAGAAGAGCCCGGGAAGCT  50
                                  || .|||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGAGGTCATTCAACCAGGTTTCATCAGCCCCAGGCGGGGCTAGCAAAGGTGGTGGAGAAGAGCCCGGGAAGCT  74

Query  51  GCCGGAGCCGGCAGAGGAGGAATCCCAGGTTTTGCGCGGAACTGGCCACTGTAAGTGGTTCAATGTGCGCATGG  124
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GCCGGAGCCGGCAGAGGAGGAATCCCAGGTTTTGCGCGGAACTGGCCACTGTAAGTGGTTCAATGTGCGCATGG  148

Query 125  GATTTGGATTCATCTCCATGATAAACCGAGAGGGAAGCCCCTTGGATATTCCAGTCGATGTATTTGTACACCAA  198
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GATTTGGATTCATCTCCATGATAAACCGAGAGGGAAGCCCCTTGGATATTCCAGTCGATGTATTTGTACACCAA  222

Query 199  AGCAAACTATTCATGGAAGGATTTAGAAGCCTAAAAGAAGGAGAACCAGTGGAATTCACATTTAAAAAATCTTC  272
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AGCAAACTATTCATGGAAGGATTTAGAAGCCTAAAAGAAGGAGAACCAGTGGAATTCACATTTAAAAAATCTTC  296

Query 273  CAAAGGCCTTGAGTCAATACGGGTAACAGGACCTGGTGGGAGCCCCTGTTTAGGAAGTGAAAGAAGACCCAAAG  346
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CAAAGGCCTTGAGTCAATACGGGTAACAGGACCTGGTGGGAGCCCCTGTTTAGGAAGTGAAAGAAGACCCAAAG  370

Query 347  GGAAGACACTACAGAAAAGAAAACCAAAGGGAGATAGATGCTACAACTGTGGTGGCCTTGATCATCATGCTAAG  420
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  GGAAGACACTACAGAAAAGAAAACCAAAGGGAGATAGATGCTACAACTGTGGTGGCCTTGATCATCATGCTAAG  444

Query 421  GAATGTAGTCTACCTCCTCAGCCAAAGAAGTGCCATTACTGTCAGAGCATCATGCACATGGTGGCAAACTGCCC  494
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GAATGTAGTCTACCTCCTCAGCCAAAGAAGTGCCATTACTGTCAGAGCATCATGCACATGGTGGCAAACTGCCC  518

Query 495  ACATAAAAATGTTGCACAGCCACCCGCGAGTTCTCAGGGAAGACAGGAAGCAGAATCCCAGCCATGCACTTCAA  568
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519  ACATAAAAATGTTGCACAGCCACCCGCGAGTTCTCAGGGAAGACAGGAAGCAGAATCCCAGCCATGCACTTCAA  592

Query 569  CTCTCCCTCGAGAAGTGGGAGGCGGGCATGGCTGTACATCACCACCGTTTCCTCAGGAGGCTAGGGCAGAGATC  642
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593  CTCTCCCTCGAGAAGTGGGAGGCGGGCATGGCTGTACATCACCACCGTTTCCTCAGGAGGCTAGGGCAGAGATC  666

Query 643  TCAGAACGGTCAGGCAGGTCACCTCAAGAAGCTTCCTCCACGAAGTCATCTATAGCACCAGAAGAGCAAAGCAA  716
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667  TCAGAACGGTCAGGCAGGTCACCTCAAGAAGCTTCCTCCACGAAGTCATCTATAGCACCAGAAGAGCAAAGCAA  740

Query 717  AAAGGGGCCTTCAGTTCAAAAAAGGAAAAAGACA  750
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741  AAAGGGGCCTTCAGTTCAAAAAAGGAAAAAGACA  774