Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05650
• Subject: XM_006717108.3
• Aligned Length: 1056
• Identities: 798
• Gaps: 258

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTGCTGCTGGACATCCATCCTCTCCTTGAGAAGGACTCCCCTCAGGGAAGGGAGCTGGATGCCGGGAGGGA  74

Query    1  -------------------------------ATGACAACTACTCAGAAACACGATCTCTTCACGCCGGAGCCTC  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGGAGCCAGCAAGGCCAGAGTGAAAGCAAAATGACAACTACTCAGAAACACGATCTCTTCACGCCGGAGCCTC  148

Query   44  ACTATGTCCCTGGCTATGCCGGCTTCTTTCCGCAGCTGCGCTACCAGGTGGGGAACACCTATGGGCGTACCACG  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTATGTCCCTGGCTATGCCGGCTTCTTTCCGCAGCTGCGCTACCAGGTGGGGAACACCTATGGGCGTACCACG  222

Query  118  GGGCAGCTGCTCACAGACCCCAGTGTGCAGAAGAGCCCCTGCTCTGTGCTGTCCCCCATGTCCAAACCCAAGTT  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGCAGCTGCTCACAGACCCCAGTGTGCAGAAGAGCCCCTGCTCTGTGCTGTCCCCCATGTCCAAACCCAAGTT  296

Query  192  CATTGAGGACTTCAGCCAGTCCAAGCCCCCGAGGGTTCCCTGCCAAGACCTGACGGAGCCCTACATCCCCCACT  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATTGAGGACTTCAGCCAGTCCAAGCCCCCGAGGGTTCCCTGCCAAGACCTGACGGAGCCCTACATCCCCCACT  370

Query  266  ACACCAGTCTGAAGCCCTCTAAGAACTTTGAGATTCTGGGCCAGCTCCCACCCTTGGAGGTGGACGCCCAGGAG  339
            ||||||                                                                    
Sbjct  371  ACACCA--------------------------------------------------------------------  376

Query  340  CCGCCAGGGGTAGAGAACATACCCAGACAGATTCTGCTGCCTGCAGGCTTCACGCCCGACACCCCGCACCCTCC  413
                                                                                      
Sbjct  377  --------------------------------------------------------------------------  376

Query  414  GTGCCCACCAGGCAGGAAGGGAGACTCCAGAGACTTGGGACACCCAGTATACGGGGAAGAGGCCTGGAAGAGCG  487
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  377  -----------GCAGGAAGGGAGACTCCAGAGACTTGGGACACCCAGTATACGGGGAAGAGGCCTGGAAGAGCG  439

Query  488  CCACTCCTGTTTGCGAGGCCCCCAGGCAGCACCAGCTGTACCACTGCCAGAGGGATGAGTACCCACCCCCCGCC  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  440  CCACTCCTGTTTGCGAGGCCCCCAGGCAGCACCAGCTGTACCACTGCCAGAGGGATGAGTACCCACCCCCCGCC  513

Query  562  CGCCGCCAGCAGGAGACGCTAGATGTGGGCAGCTTCCAGCGGCTGCCGCAGCTGGACCACCCTAACCTAATCCA  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  514  CGCCGCCAGCAGGAGACGCTAGATGTGGGCAGCTTCCAGCGGCTGCCGCAGCTGGACCACCCTAACCTAATCCA  587

Query  636  ACGCAAGGCCATCTCAGGCTATGCTGGCTTCATTCCCCGTTTCACCTGGGTAATGGGGTTGAATTACCGAGACG  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  588  ACGCAAGGCCATCTCAGGCTATGCTGGCTTCATTCCCCGTTTCACCTGGGTAATGGGGTTGAATTACCGAGACG  661

Query  710  GCGTCATGCAAGCCATGGACGAATTCGACAAGAGCCAGTTCCTGTTTAGAAACCCCCACTGTGACCTGGGCGAG  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  662  GCGTCATGCAAGCCATGGACGAATTCGACAAGAGCCAGTTCCTGTTTAGAAACCCCCACTGTGACCTGGGCGAG  735

Query  784  AAGCTGCCTGGAACACACTGGCCCAGCAACCACATCTACAGCAGCCAAGGCCTGATCCCCTTCTACATGGGGTT  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  736  AAGCTGCCTGGAACACACTGGCCCAGCAACCACATCTACAGCAGCCAAGGCCTGATCCCCTTCTACATGGGGTT  809

Query  858  CATCCCCGCCATGCAGGACAACTACGCCCTGACATTCGGCAACAGCACCCGGAGGGCCTACTGGAAGGAATGGG  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  810  CATCCCCGCCATGCAGGACAACTACGCCCTGACATTCGGCAACAGCACCCGGAGGGCCTACTGGAAGGAATGGG  883

Query  932  CAAAGCGAAACCACACACTA  951
            ||||||||||||||||||||
Sbjct  884  CAAAGCGAAACCACACACTA  903