Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05650
• Subject: XM_011518695.2
• Aligned Length: 1056
• Identities: 837
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTGCTGCTGGACATCCATCCTCTCCTTGAGAAGGACTCCCCTCAGGGAAGGGAGCTGGATGCCGGGAGGGA  74

Query    1  -------------------------------ATGACAACTACTCAGAAACACGATCTCTTCACGCCGGAGCCTC  43
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGGAGCCAGCAAGGCCAGAGTGAAAGCAAAATGACAACTACTCAGAAACACGATCTCTTCACGCCGGAGCCTC  148

Query   44  ACTATGTCCCTGGCTATGCCGGCTTCTTTCCGCAGCTGCGCTACCAGGTGGGGAACACCTATGGGCGTACCACG  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACTATGTCCCTGGCTATGCCGGCTTCTTTCCGCAGCTGCGCTACCAGGTGGGGAACACCTATGGGCGTACCACG  222

Query  118  GGGCAGCTGCTCACAGACCCCAGTGTGCAGAAGAGCCCCTGCTCTGTGCTGTCCCCCATGTCCAAACCCAAGTT  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGCAGCTGCTCACAGACCCCAGTGTGCAGAAGAGCCCCTGCTCTGTGCTGTCCCCCATGTCCAAACCCAAGTT  296

Query  192  CATTGAGGACTTCAGCCAGTCCAAGCCCCCGAGGGTTCCCTGCCAAGACCTGACGGAGCCCTACATCCCCCACT  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CATTGAGGACTTCAGCCAGTCCAAGCCCCCGAGGGTTCCCTGCCAAGACCTGACGGAGCCCTACATCCCCCACT  370

Query  266  ACACCAGTCTGAAGCCCTCTAAGAACTTTGAGATTCTGGGCCAGCTCCCACCCTTGGAGGTGGACGCCCAGGAG  339
            ||||||                                                                    
Sbjct  371  ACACCA--------------------------------------------------------------------  376

Query  340  CCGCCAGGGGTAGAGAACATACCCAGACAGATTCTGCTGCCTGCAGGCTTCACGCCCGACACCCCGCACCCTCC  413
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  377  ----------------------------------------------GCTTCACGCCCGACACCCCGCACCCTCC  404

Query  414  GTGCCCACCAGGCAGGAAGGGAGACTCCAGAGACTTGGGACACCCAGTATACGGGGAAGAGGCCTGGAAGAGCG  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  GTGCCCACCAGGCAGGAAGGGAGACTCCAGAGACTTGGGACACCCAGTATACGGGGAAGAGGCCTGGAAGAGCG  478

Query  488  CCACTCCTGTTTGCGAGGCCCCCAGGCAGCACCAGCTGTACCACTGCCAGAGGGATGAGTACCCACCCCCCGCC  561
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  CCACTCCTGTTTGCGAGGCCCCCAGGCAGCACCAGCTGTACCACTGCCAGAGGGATGAGTACCCACCCCCCGCC  552

Query  562  CGCCGCCAGCAGGAGACGCTAGATGTGGGCAGCTTCCAGCGGCTGCCGCAGCTGGACCACCCTAACCTAATCCA  635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  CGCCGCCAGCAGGAGACGCTAGATGTGGGCAGCTTCCAGCGGCTGCCGCAGCTGGACCACCCTAACCTAATCCA  626

Query  636  ACGCAAGGCCATCTCAGGCTATGCTGGCTTCATTCCCCGTTTCACCTGGGTAATGGGGTTGAATTACCGAGACG  709
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  ACGCAAGGCCATCTCAGGCTATGCTGGCTTCATTCCCCGTTTCACCTGGGTAATGGGGTTGAATTACCGAGACG  700

Query  710  GCGTCATGCAAGCCATGGACGAATTCGACAAGAGCCAGTTCCTGTTTAGAAACCCCCACTGTGACCTGGGCGAG  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  GCGTCATGCAAGCCATGGACGAATTCGACAAGAGCCAGTTCCTGTTTAGAAACCCCCACTGTGACCTGGGCGAG  774

Query  784  AAGCTGCCTGGAACACACTGGCCCAGCAACCACATCTACAGCAGCCAAGGCCTGATCCCCTTCTACATGGGGTT  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  AAGCTGCCTGGAACACACTGGCCCAGCAACCACATCTACAGCAGCCAAGGCCTGATCCCCTTCTACATGGGGTT  848

Query  858  CATCCCCGCCATGCAGGACAACTACGCCCTGACATTCGGCAACAGCACCCGGAGGGCCTACTGGAAGGAATGGG  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  CATCCCCGCCATGCAGGACAACTACGCCCTGACATTCGGCAACAGCACCCGGAGGGCCTACTGGAAGGAATGGG  922

Query  932  CAAAGCGAAACCACACACTA  951
            ||||||||||||||||||||
Sbjct  923  CAAAGCGAAACCACACACTA  942