Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05670
• Subject: NM_001031850.4
• Aligned Length: 1288
• Identities: 1186
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||.|.|||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGACCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACTCAGCACATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCCACCCACGACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCAACCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
            ||||||||||||||..|||||.|||||||||||.|..|||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCTGCCCACCACTGCCCAAGTAATAATTGAAGCCAAGCCACCCAAAGTTTCCGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||   ||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTACACGGTCA---AATTATATATGGGCCTGCCTACAGTGGACGAGA  293

Query  297  AACAATATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCAGGAAGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  AACAGTATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACACAGGAGGATGCAGGATCCTACACCTTACACA  367

Query  371  TCATAATGGGAGGTGATGAGAATAGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATATCT-GGAGACTCCCAA  443
            ||||||.|.||||.||||.||.|.||||||||||||||.|||||||..|||||||||| || ||||||||||||
Sbjct  368  TCATAAAGCGAGGCGATGGGACTGGAGGAGTAACTGGATATTTCACTGTCACCTTATA-CTCGGAGACTCCCAA  440

Query  444  GCCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGA  517
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  441  GCCCTCCATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGTCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGA  514

Query  518  CTCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAA  591
            |||||||.||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.||||..||
Sbjct  515  CTCCGGATGCAAGCTACCTGTGGTTGCTGAATGGTCAGAACCTCCCTATGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAA  588

Query  592  ACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCC  665
            ||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  ACCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCC  662

Query  666  AGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCA  739
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||
Sbjct  663  AGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCATGCCTTACATCACCATCA  736

Query  740  ACAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTAC  813
            ||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||..||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct  737  ACAACTTAAACCCCAGGGAGAAGAAGGATGTGTTAGCCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTCGGAACTACACCTAC  810

Query  814  ATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCAT  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  811  ATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCGAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATACTCAT  884

Query  888  TCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCA  961
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  885  TCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCA  958

Query  962  GTTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGT  1035
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  GTAACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGT  1032

Query 1036  TCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGG  1109
            |||||||||..||||.||||||||||.|.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  TCAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCAGAGTATTCTTGGACAATTAATGG  1106

Query 1110  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT  1183
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  GAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGCT  1180

Query 1184  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGGTAAGCGGATCCCA  1257
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.|||||||||||        ||||.
Sbjct 1181  CTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGATAGTCAAAGTCTCTGG--------TCCCT  1246

Query 1258  GTATCCTTGGCA-----ATAGGG----ATT  1278
            |   ||.|||.|     |.||.|    || 
Sbjct 1247  G---CCATGGAAACCAGACAGAGTCTCAT-  1272