Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05670
• Subject: NM_001206650.2
• Aligned Length: 1278
• Identities: 845
• Gaps: 387

Alignment

Query    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||..||.||||||||.||||||||||||||||          
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCATATAACCTGGAAAGGGCTCCTGCTCACAG----------  64

Query   75  AAACTTCTGGAACCCACCCACGACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCAACCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  297  AACAATATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCAGGAAGACGCAGGATCCTACACCTTACACA  370
                                                                                      
Sbjct   65  --------------------------------------------------------------------------  64

Query  371  TCATAATGGGAGGTGATGAGAATAGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATATCTGGAGACTCCCAAG  444
                                                                        |||||||||||||.
Sbjct   65  ------------------------------------------------------------TGGAGACTCCCAAA  78

Query  445  CCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGAC  518
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||||||||
Sbjct   79  CCCTCCATCTCCAGCAGCAATTTCAACCCCAGGGAGGCCACGGAGGCTGTGATTTTAACCTGTGATCCTGAGAC  152

Query  519  TCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAAA  592
            |||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||
Sbjct  153  TCCAGATGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGACTCACAGCTTGCAGCTGTCTGAAA  226

Query  593  CCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  666
            |||||||||||||||..|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  227  CCAACAGGACCCTCTACCTATTTGGTGTCACAAACTATACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCCA  300

Query  667  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  740
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  GTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCAA  374

Query  741  CAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  814
            .||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  375  TAACTTAAACCCCAGGGAGAATAAGGATGTCTCAACCTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTACA  448

Query  815  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCATT  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  449  TTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACGCATTGAAAACAGGATCCTCATT  522

Query  889  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  523  CTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATACGGGACCGATATGGTGGCATCCGCAG  596

Query  963  TTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGTT  1036
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  597  TGACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCATT  670

Query 1037  CAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTGTTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  1110
            |||||.||..|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  CAGGACAAAACCTCTACTTGTCCTGCTTTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATGGG  744

Query 1111  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  AAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTTTCTATCCCCCAGATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGCTC  818

Query 1185  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGGTAAGCGGATCCCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|.||||||||   |..|||   ||.
Sbjct  819  TGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCGTGACAGTCAGAGTCTCTG---ACTGGA---CAT  886

Query 1259  TATCCTTGGCAATAGGGATT  1278
            ||.||               
Sbjct  887  TACCC---------------  891