Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05670
• Subject: XM_005259075.4
• Aligned Length: 1487
• Identities: 931
• Gaps: 490

Alignment

Query    1  ATGGGGCTCCTCTCAGCCCCTCCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74
            |||||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCCCCTCCCAGCCCCTTCCTGCACACAGCGCATCACCTGGAAGGGGCTCCTGCTCACAGCATCACTTTT  74

Query   75  AAACTTCTGGAACCCACCCACGACTGCCCAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCAACCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148
            |||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAACTTCTGGAACCCGCCCACCACTGCCGAAGTCACGATTGAAGCCCAGCCACCCAAAGTTTCTGAGGGGAAGG  148

Query  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTACTGGCTACATCTGGTACAAAGGGCAAATCAGGGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||.|.||||
Sbjct  149  ATGTTCTTCTACTTGTCCACAATTTGCCCCAGAATCTTCCTGGCTACTTCTGGTACAAAGGGGAAATGACGGAC  222

Query  223  CTCTACCATTACATTACATCATATGTAGTAGACGGTCAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGACGAGA  296
            ||||||||||||||||.|||.|||.||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  223  CTCTACCATTACATTATATCGTATATAGTTGATGGTAAAATAATTATATATGGGCCTGCATACAGTGGAAGAGA  296

Query  297  AACAATATATTCCAATGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCCAGGAA-GACGCAGGATCCTACACCTTACAC  369
            ||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||| |||| ||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  297  AACAGTATATTCCAACGCATCCCTGCTGATCCAGAATGTCACCC-GGAAGGATGCAGGAACCTACACCTTACAC  369

Query  370  ATCATAATGGGAGGTGATGAGAATAGAGGAGTAACTGGACATTTCACCTTCACCTTATATCTGGAGACTCCCAA  443
            |||||||.|.||||||||||||.|||||.||.||.|.||||||||||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct  370  ATCATAAAGCGAGGTGATGAGACTAGAGAAGAAATTCGACATTTCACCTTCACCTTATACTTGGAGACTCCCAA  443

Query  444  GCCCTCCATCTCCAGCAGCAAATTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGAGCTTAACCTGTGATCCTGAGA  517
            |||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  444  GCCCTACATCTCCAGCAGCAACTTAAACCCCAGGGAGGCCATGGAGGCTGTGCGCTTAATCTGTGATCCTGAGA  517

Query  518  CTCCGGACGCAAGCTACCTGTGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTATGTCTCACAGGTTGCAGTTGTCTGAA  591
            |||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||..||
Sbjct  518  CTCTGGACGCAAGCTACCTATGGTGGATGAATGGTCAGAGCCTCCCTGTGACTCACAGGTTGCAGCTGTCCAAA  591

Query  592  ACCAACAGGACCCTCTTTCTATTGGGTGTCACAAAGTACACTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCC  665
            ||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  ACCAACAGGACCCTCTATCTATTTGGTGTCACAAAGTATATTGCAGGACCCTATGAATGTGAAATACGGAACCC  665

Query  666  AGTGAGTGCCAGCCGCAGTGACCCATTCACCCTGAATCTCCTCCCGAAGCTGCCCAAGCCCTACATCACCATCA  739
            ||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||                              
Sbjct  666  AGTGAGTGCCAGTCGCAGTGACCCAGTCACCCTGAATCTCCTCC------------------------------  709

Query  740  ACAACTTAAAACCCAGGGAGAATAAGGATGTCTTAAACTTCACCTGTGAACCTAAGAGTGAGAACTACACCTAC  813
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  814  ATTTGGTGGCTAAATGGTCAGAGCCTCCCGGTCAGTCCCAGGGTAAAGCGACCCATTGAAAACAGGATCCTCAT  887
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  888  TCTACCCAGTGTCACGAGAAATGAAACAGGACCCTATCAATGTGAAATAAGGGACCAATATGGTGGCATCCGCA  961
                                                                                      
Sbjct  710  --------------------------------------------------------------------------  709

Query  962  GTTACCCAGTCACCCTGAATGTCCTCTATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGT  1035
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  710  ---------------------------ATGGTCCAGACCTCCCCAGAATTTACCCTTCATTCACCTATTACCGT  756

Query 1036  TCAGGAGAAGTCCTCTACTTGTCCTG-TTCTGCGGACTCTAACCCACCGGCACAGTATTCTTGGACAATTAATG  1108
            |||||||||..||||.|||||||||| ||| .||||.|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  757  TCAGGAGAAAACCTCGACTTGTCCTGCTTC-ACGGAATCTAACCCACCGGCAGAGTATTTTTGGACAATTAATG  829

Query 1109  GGAAGTTTCAGCTATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTACAAAGCATAGCGGGCTCTATGCTTGC  1182
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  830  GGAAGTTTCAGCAATCAGGACAAAAGCTCTTTATCCCCCAAATTACTAGAAATCATAGCGGGCTCTATGCTTGC  903

Query 1183  TCTGTTCGTAACTCAGCCACTGGCAAGGAAAGCTCCAAATCCATGACAGTAAAAGTCTCTGGTAAGCGGATCCC  1256
            |||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||
Sbjct  904  TCTGTTCATAACTCAGCCACTGGCAAGGAAATCTCCAAATCCATGACAGTCAAAGTCTCTGGTAAGTGGATCCC  977

Query 1257  AGTATCCTTGGCAATAGGGATT----------------------------------------------------  1278
            ||.||||||||||.|||||.||                                                    
Sbjct  978  AGCATCCTTGGCAGTAGGGTTTTATGTGGAGTCTATCTGGCTTTCAGAGAAGAGTCAGGAAAACATTTTTATTC  1051

Query 1279  --------------------------------------------------------------------------  1278
                                                                                      
Sbjct 1052  CCAGCCTGTGTCCCATGGGCACAAGCAAATCCCAAATTCTCCTCCTGAACCCTCCCAATTTGTCTCTACAGACT  1125

Query 1279  --------------------------------------------------------------------------  1278
                                                                                      
Sbjct 1126  CTCTTCTCCTTGTTTTTCTGTTTTCTTATGGCTGACCTTGTGTCTGGCCTGAAAAAGGTAGGGAGGGGGCTTTA  1199

Query 1279  -------  1278
                   
Sbjct 1200  TCAGCCC  1206