Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05771
- Subject:
- NM_001024837.2
- Aligned Length:
- 2136
- Identities:
- 1848
- Gaps:
- 36
Alignment
Query 1 ATGGATATAGAAGATGAAGAAAACATGAGTTCCAGCAGCACTGATGTGAAGGAAAACCGCAATCTGGACAACGT 74
||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1 ATGGATATAGAAGATGAAGAGAATATGAGTTCCAGCAGCACTGATATTAAAGAAAACCGCAATCTGGACAACAT 74
Query 75 GTCCCCCAAGGATGGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGCTCTCAGCTCTCCAATGGGGGTGGTGGTGGCCCCG 148
|.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||...||.|||||||||.||||||||||||.||.||.
Sbjct 75 GCCCCCCAAGGACAGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGTATTCCGCTCTCCAACGGGGGTGGTGGTAGCACCA 148
Query 149 GCAGAAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGCCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAAAGGAGGAAAACACCA 222
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct 149 GCAGGAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGTCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAGCGAAGGAAAACACCA 222
Query 223 GGGCCCGTCCTCCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAATGAGATCAAGCCTGGTTTGCAGTACACACTCCTGTC 296
|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||..||.|||||
Sbjct 223 GGGCCTGTTCTGCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAACGAGATCAAACCTGGCTTACAGTACATGCTGCTGTC 296
Query 297 CCAGACTGGGCCCGTGCACGCGCCTTTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTGAATGGCCAGGTTTTTGAGGGCTCTG 370
||||||.||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCAGACAGGACCCGTGCATGCACCTCTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTAAACGGGCAGGTTTTTGAGGGCTCTG 370
Query 371 GTCCCACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCTTGAGGTCTTTCGTTCAGTTTCCTAATGCC 444
|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 371 GCCCTACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCCTGAGGTCTTTTGTCCAGTTTCCCAACGCC 444
Query 445 TCTGAGGCCCACCTGGCCATGGGGAGGACCCTGTCTGTCAACACGGACTTCACATCTGACCAGGCCGACTTCCC 518
||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 445 TCCGAGGCCCACCTAGCCATGGGAAGGACCCTCTCTGTGAACACAGACTTCACGTCTGACCAGGCTGACTTCCC 518
Query 519 TGACACGCTCTTCAATGGTTTTGAAACTCCTGACAAGGCGGAGCCTCCCTTTTACGTGGGCTCCAATGGGGATG 592
||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct 519 TGACACACTCTTCAATGGCTTCGAGACTCCAGACAAGTCAGAGCCACCCTTCTACGTAGGCTCCAACGGGGATG 592
Query 593 ACTCCTTCAGTTCCAGCGGGGACCTCAGCTTGTCTGCTTCCCCGGTGCCTGCCAGCCTAGCCCAGCCTCCTCT- 665
||||.|||||.||.||.||.||..|||||.|.||.||.|||||.||||||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 593 ACTCGTTCAGCTCAAGTGGAGATGTCAGCCTATCGGCCTCCCCAGTGCCTGCCAGCCTTACCCAGCCTCCTCTG 666
Query 666 -CCCTGCCTTACCACCATTCCCACCCCCGAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAACGAACTGCGCCCAGGA 738
||.|.|| ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct 667 CCCATCCC--ACCACCATTCCCACCCCCAAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAATGAGCTACGCCCAGGG 738
Query 739 CTCAAGTATGACTTCCTCTCCGAGAGCGGGGAGAGCCATGCCAAGAGCTTCGTCATGTCTGTGGTCGTGGATGG 812
||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 739 CTGAAGTATGACTTCCTCTCTGAGAGTGGGGAGAGCCACGCCAAGAGCTTCGTCATGTCCGTGGTGGTAGATGG 812
Query 813 TCAGTTCTTTGAAGGCTCGGGGAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCGCAGTCTGCCCTGGCCGCCA 886
.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|..
Sbjct 813 CCAGTTCTTTGAGGGCTCAGGAAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCACAGTCTGCCTTGGCTACTG 886
Query 887 TTTTTAACTTGCACTTGGATCAGACGCCATCTCGCCAGCCTATTCCCAGTGAGGGTCTTCAGCTGCATTTACCG 960
|.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.|.||||||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct 887 TCTTCAATTTGCACTTGGACCAAACACCATCTCGCCAGCCTGTCCTCAGTGAGGGTCTTCAGTTGCATTTGCCA 960
Query 961 CAGGTTTTAGCTGACGCTGTCTCACGCCTGGTCCTGGGTAAGTTTGGTGACCTGACCGACAACTTCTCCTCCCC 1034
|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 961 CAGGTATTGGCAGATGCTGTCTCCCGCCTGGTCCTGGGTAAGTTCAGTGACCTGACAGACAACTTTTCCTCCCC 1034
Query 1035 TCACGCTCGCAGAAAAGTGCTGGCTGGAGTCGTCATGACAACAGGCACAGATGTTAAAGATGCCAAGGTGATAA 1108
|||.||.||.||.||||||||..|||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1035 TCATGCACGAAGGAAAGTGCTCTCTGGAGTAGTGATGACCACAGGTACAGATGTCAAAGATGCCAAGGTGATAA 1108
Query 1109 GTGTTTCTACAGGAACAAAATGTATTAATGGTGAATACATGAGTGATCGTGGCCTTGCATTAAATGACTGCCAT 1182
|||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.
Sbjct 1109 GTGTTTCGACAGGGACGAAGTGTATCAACGGTGAATACATGAGTGACCGTGGCCTCGCACTCAATGACTGCCAC 1182
Query 1183 GCAGAAATAATATCTCGGAGATCCTTGCTCAGATTTCTTTATACACAACTTGAGCTTTACTTAAATAACAAAGA 1256
|||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1183 GCAGAGATAATCTCCCGAAGGTCCCTGCTCAGGTTTCTTTATGCACAGCTCGAGCTTTATTTAAATAACAAAGA 1256
Query 1257 TGATCA-AAAAAGATCCATCTTTCAGAAATCAGAGCGAGGGGGGTTTAGGCTGAAGGAGAATGTCCAGTTTCAT 1329
.||.|| |||||| |||||.||||||||.||||||||.||.|||||..||||||||||.|..||.|||||.||.
Sbjct 1257 AGACCAGAAAAAG-TCCATATTTCAGAAGTCAGAGCGGGGTGGGTTCCGGCTGAAGGATACCGTGCAGTTCCAC 1329
Query 1330 CTGTACATCAGCACCTCTCCCTGTGGAGATGCCAGAATCTTCTCACCACATGAGCCAATCCTGGA--------- 1394
|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||
Sbjct 1330 CTGTACATCAGCACCTCGCCCTGCGGAGACGCCAGAATATTCTCTCCCCACGAGCCCGTGCTAGAGGGTATGAC 1403
Query 1395 ---------------------AGAACCAGCAGATAGACACCCAAATCGTAAAGCAAGAGGACAGCTACGGACCA 1447
||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1404 GCCAGACTCTCACCAGCTGACAGAACCAGCAGATAGACATCCGAATCGCAAAGCAAGGGGACAGCTACGGACGA 1477
Query 1448 AAATAGAGTCTGGTGAGGGGACGATTCCAGTGCGCTCCAATGCGAGCATCCAAACGTGGGACGGGGTGCTGCAA 1521
|||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1478 AAATAGAGTCTGGCGAGGGGACAATCCCTGTGCGCTCAAATGCCAGCATCCAGACCTGGGACGGGGTGCTGCAG 1551
Query 1522 GGGGAGCGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGTGACAAGATTGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGATCCCT 1595
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1552 GGGGAACGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGTGACAAGATAGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGGTCCCT 1625
Query 1596 GCTCAGCATTTTCGTGGAGCCCATTTACTTCTCGAGCATCATCCTGGGCAGCCTTTACCACGGGGACCACCTTT 1669
||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1626 GCTCAGCATTTTCGTGGAACCCATCTACTTCTCCAGCATCATCTTGGGCAGCCTGTACCACGGGGACCACCTCT 1699
Query 1670 CCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACATAGAGGACCTGCCACCTCTCTACACCCTCAACAAGCCTTTGCTC 1743
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 1700 CCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACATAGAGGACCTGCCACCGCTCTACACTCTCAACAAGCCCCTGCTC 1773
Query 1744 AGTGGCATCAGCAATGCAGAAGCACGGCAGCCAGGGAAGGCCCCCAACTTCAGTGTCAACTGGACGGTAGGCGA 1817
||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1774 AGCGGCATCAGCAATGCAGAGGCACGGCAGCCAGGGAAGGCACCCAACTTCAGTGTCAACTGGACAGTGGGTGA 1847
Query 1818 CTCCGCTATTGAGGTCATCAACGCCACGACTGGGAAGGATGAGCTGGGCCGCGCGTCCCGCCTGTGTAAGCACG 1891
|.||.|.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 1848 CGCCACCATTGAGGTCATCAATGCCACAACAGGGAAGGATGAGCTTGGCCGCCCATCCCGCCTGTGTAAGCACG 1921
Query 1892 CGTTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTGCACGGCAAGGTTCCCTCCCACTTACTACGCTCCAAGATTACCAAACCC 1965
||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|.||.|||.|||||||.||.||.||.
Sbjct 1922 CGCTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTACACGGCAAGGTTCCCCCCCACCTGCTGCGCACCAAGATCACTAAGCCT 1995
Query 1966 AACGTGTACCATGAGTCCAAGCTGGCGGCAAAGGAGTACCAGGCCGCCAAGGCGCGTCTGTTCACAGCCTTCAT 2039
|.|...|||||.||||||||||||||.||.|.||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1996 ACCACATACCACGAGTCCAAGCTGGCAGCGAGGGAGTACCAGGCTGCCAAGGCCCGTCTGTTCACTGCCTTCAT 2069
Query 2040 CAAGGCGGGGCTGGGGGCCTGGGTGGAGAAGCCCACCGAGCAGGACCAGTTCTCACTCACGCCC 2103
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||.|||
Sbjct 2070 CAAGGCGGGGCTGGGCGCCTGGGTGGAGAAGCCCACAGAGCAGGACCAGTTCTCCTTCACTCCC 2133