Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05771
- Subject:
- NM_001346687.2
- Aligned Length:
- 790
- Identities:
- 630
- Gaps:
- 146
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------MDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNV 25
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Sbjct 1 MASSTTGPLHMGTFFSIMGRRYKRRRKKRSERKDRNSLRQSRNPQKYFAMDIEDEENMSSSSTDVKENRNLDNV 74
Query 26 SPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLS 99
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Sbjct 75 SPKDGSTPGPGEGSQLSNGGGGGPGRKRPLEEGSNGHSKYRLKKRRKTPGPVLPKNALMQLNEIKPGLQYTLLS 148
Query 100 QTGPVHAPLFVMSVEVNGQVFEGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFP 173
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Sbjct 149 QTGPVHAPLFVMSVEVNGQVFEGSGPTKKKAKLHAAEKALRSFVQFPNASEAHLAMGRTLSVNTDFTSDQADFP 222
Query 174 DTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPALPPFPPPSGKNPVMILNELRPGL 247
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Sbjct 223 DTLFNGFETPDKAEPPFYVGSNGDDSFSSSGDLSLSASPVPASLAQPPLPVLPPFPPPSGKNPVMILNELRPGL 296
Query 248 KYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLHLDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQ 321
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Sbjct 297 KYDFLSESGESHAKSFVMSVVVDGQFFEGSGRNKKLAKARAAQSALAAIFNLHLDQTPSRQPIPSEGLQLHLPQ 370
Query 322 VLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTGTDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHA 395
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Sbjct 371 VLADAVSRLVLGKFGDLTDNFSSPHARRKVLAGVVMTTGTDVKDAKVISVSTGTKCINGEYMSDRGLALNDCHA 444
Query 396 EIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILE---- 465
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Sbjct 445 EIISRRSLLRFLYTQLELYLNNKDDQKRSIFQKSERGGFRLKENVQFHLYISTSPCGDARIFSPHEPILEGSRS 518
Query 466 ------------------------------------EPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWD 503
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Sbjct 519 YTQAGVQWCNHGSLQPRPPGLLSDPSTSTFQGAGTTEPADRHPNRKARGQLRTKIESGEGTIPVRSNASIQTWD 592
Query 504 GVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAMYQRISNIEDLPPLYTLN 577
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Sbjct 593 GVLQGERLLTMSCSDKIARWNVVGIQGSLLSIFVEPIYFSSIILGSLYHGDHLSRAMYQRISNIEDLPPLYTLN 666
Query 578 KPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDELGRASRLCKHALYCRWMRVHGKVPSHLLRSK 651
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Sbjct 667 KPLLSGISNAEARQPGKAPNFSVNWTVGDSAIEVINATTGKDELGRASRLCSLPLTTLQDYQAQRVP------- 733
Query 652 ITKPNVYHESKLAAKEYQAAKARLFTAFIKAGLGAWVEKPTEQDQFSLTP 701
Sbjct 734 -------------------------------------------------- 733