Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05771
• Subject: XM_006513062.3
• Aligned Length: 2328
• Identities: 1848
• Gaps: 228

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCTTGGGACTAGCAGGGGCTGTCAGCCACTCATCGGTCCACATGGCATCTCTAGGCTTGGGAACTTTGAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGTGGGTGCCTTCTTCAGCTTCGTGGGGCGTCGGTATAAAAGGAGGCGCAAGAAGCGCTCTGAAAGGAAAGACA  148

Query    1  --------------------------------------------ATGGATATAGAAGATGAAGAAAACATGAGT  30
                                                        ||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  149  AAAGAGGTCTCCGCCAGTCAAGAAGCCCTCAAAAGTGTTTTACCATGGATATAGAAGATGAAGAGAATATGAGT  222

Query   31  TCCAGCAGCACTGATGTGAAGGAAAACCGCAATCTGGACAACGTGTCCCCCAAGGATGGCAGCACACCTGGGCC  104
            |||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||.||.||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCAGCAGCACTGATATTAAAGAAAACCGCAATCTGGACAACATGCCCCCCAAGGACAGCAGCACACCTGGGCC  296

Query  105  TGGCGAGGGCTCTCAGCTCTCCAATGGGGGTGGTGGTGGCCCCGGCAGAAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCA  178
            |||||||||...||.|||||||||.||||||||||||.||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGCGAGGGTATTCCGCTCTCCAACGGGGGTGGTGGTAGCACCAGCAGGAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCA  370

Query  179  ATGGCCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAAAGGAGGAAAACACCAGGGCCCGTCCTCCCCAAGAACGCCCTGATG  252
            ||||.|||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGGTCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAGCGAAGGAAAACACCAGGGCCTGTTCTGCCCAAGAACGCCCTGATG  444

Query  253  CAGCTGAATGAGATCAAGCCTGGTTTGCAGTACACACTCCTGTCCCAGACTGGGCCCGTGCACGCGCCTTTGTT  326
            ||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||..||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||.||||
Sbjct  445  CAGCTGAACGAGATCAAACCTGGCTTACAGTACATGCTGCTGTCCCAGACAGGACCCGTGCATGCACCTCTGTT  518

Query  327  TGTCATGTCTGTGGAGGTGAATGGCCAGGTTTTTGAGGGCTCTGGTCCCACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATG  400
            ||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTCATGTCTGTGGAGGTAAACGGGCAGGTTTTTGAGGGCTCTGGCCCTACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATG  592

Query  401  CTGCTGAGAAGGCCTTGAGGTCTTTCGTTCAGTTTCCTAATGCCTCTGAGGCCCACCTGGCCATGGGGAGGACC  474
            ||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  CTGCTGAGAAGGCCCTGAGGTCTTTTGTCCAGTTTCCCAACGCCTCCGAGGCCCACCTAGCCATGGGAAGGACC  666

Query  475  CTGTCTGTCAACACGGACTTCACATCTGACCAGGCCGACTTCCCTGACACGCTCTTCAATGGTTTTGAAACTCC  548
            ||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  667  CTCTCTGTGAACACAGACTTCACGTCTGACCAGGCTGACTTCCCTGACACACTCTTCAATGGCTTCGAGACTCC  740

Query  549  TGACAAGGCGGAGCCTCCCTTTTACGTGGGCTCCAATGGGGATGACTCCTTCAGTTCCAGCGGGGACCTCAGCT  622
            .||||||.|.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||..|||||.
Sbjct  741  AGACAAGTCAGAGCCACCCTTCTACGTAGGCTCCAACGGGGATGACTCGTTCAGCTCAAGTGGAGATGTCAGCC  814

Query  623  TGTCTGCTTCCCCGGTGCCTGCCAGCCTAGCCCAGCCTCCTCT--CCCTGCCTTACCACCATTCCCACCCCCGA  694
            |.||.||.|||||.||||||||||||||..|||||||||||||  ||.|.||  ||||||||||||||||||.|
Sbjct  815  TATCGGCCTCCCCAGTGCCTGCCAGCCTTACCCAGCCTCCTCTGCCCATCCC--ACCACCATTCCCACCCCCAA  886

Query  695  GTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAACGAACTGCGCCCAGGACTCAAGTATGACTTCCTCTCCGAGAGCGGG  768
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  887  GTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAATGAGCTACGCCCAGGGCTGAAGTATGACTTCCTCTCTGAGAGTGGG  960

Query  769  GAGAGCCATGCCAAGAGCTTCGTCATGTCTGTGGTCGTGGATGGTCAGTTCTTTGAAGGCTCGGGGAGAAACAA  842
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  961  GAGAGCCACGCCAAGAGCTTCGTCATGTCCGTGGTGGTAGATGGCCAGTTCTTTGAGGGCTCAGGAAGAAACAA  1034

Query  843  GAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCGCAGTCTGCCCTGGCCGCCATTTTTAACTTGCACTTGGATCAGACGCCAT  916
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|..|.||.||.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1035  GAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCACAGTCTGCCTTGGCTACTGTCTTCAATTTGCACTTGGACCAAACACCAT  1108

Query  917  CTCGCCAGCCTATTCCCAGTGAGGGTCTTCAGCTGCATTTACCGCAGGTTTTAGCTGACGCTGTCTCACGCCTG  990
            |||||||||||.|.|.||||||||||||||||.|||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1109  CTCGCCAGCCTGTCCTCAGTGAGGGTCTTCAGTTGCATTTGCCACAGGTATTGGCAGATGCTGTCTCCCGCCTG  1182

Query  991  GTCCTGGGTAAGTTTGGTGACCTGACCGACAACTTCTCCTCCCCTCACGCTCGCAGAAAAGTGCTGGCTGGAGT  1064
            ||||||||||||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||..|||||||
Sbjct 1183  GTCCTGGGTAAGTTCAGTGACCTGACAGACAACTTTTCCTCCCCTCATGCACGAAGGAAAGTGCTCTCTGGAGT  1256

Query 1065  CGTCATGACAACAGGCACAGATGTTAAAGATGCCAAGGTGATAAGTGTTTCTACAGGAACAAAATGTATTAATG  1138
            .||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 1257  AGTGATGACCACAGGTACAGATGTCAAAGATGCCAAGGTGATAAGTGTTTCGACAGGGACGAAGTGTATCAACG  1330

Query 1139  GTGAATACATGAGTGATCGTGGCCTTGCATTAAATGACTGCCATGCAGAAATAATATCTCGGAGATCCTTGCTC  1212
            ||||||||||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||.|||||
Sbjct 1331  GTGAATACATGAGTGACCGTGGCCTCGCACTCAATGACTGCCACGCAGAGATAATCTCCCGAAGGTCCCTGCTC  1404

Query 1213  AGATTTCTTTATACACAACTTGAGCTTTACTTAAATAACAAAGATGATCA-AAAAAGATCCATCTTTCAGAAAT  1285
            ||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|| |||||| |||||.||||||||.|
Sbjct 1405  AGGTTTCTTTATGCACAGCTCGAGCTTTATTTAAATAACAAAGAAGACCAGAAAAAG-TCCATATTTCAGAAGT  1477

Query 1286  CAGAGCGAGGGGGGTTTAGGCTGAAGGAGAATGTCCAGTTTCATCTGTACATCAGCACCTCTCCCTGTGGAGAT  1359
            |||||||.||.|||||..||||||||||.|..||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1478  CAGAGCGGGGTGGGTTCCGGCTGAAGGATACCGTGCAGTTCCACCTGTACATCAGCACCTCGCCCTGCGGAGAC  1551

Query 1360  GCCAGAATCTTCTCACCACATGAGCCAATCCTGGA------------------------------AGAACCAGC  1403
            ||||||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||                              |||||||||
Sbjct 1552  GCCAGAATATTCTCTCCCCACGAGCCCGTGCTAGAGGGTATGACGCCAGACTCTCACCAGCTGACAGAACCAGC  1625

Query 1404  AGATAGACACCCAAATCGTAAAGCAAGAGGACAGCTACGGACCAAAATAGAGTCTGGTGAGGGGACGATTCCAG  1477
            |||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|
Sbjct 1626  AGATAGACATCCGAATCGCAAAGCAAGGGGACAGCTACGGACGAAAATAGAGTCTGGCGAGGGGACAATCCCTG  1699

Query 1478  TGCGCTCCAATGCGAGCATCCAAACGTGGGACGGGGTGCTGCAAGGGGAGCGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGT  1551
            |||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  TGCGCTCAAATGCCAGCATCCAGACCTGGGACGGGGTGCTGCAGGGGGAACGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGT  1773

Query 1552  GACAAGATTGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGATCCCTGCTCAGCATTTTCGTGGAGCCCATTTACTT  1625
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1774  GACAAGATAGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGGTCCCTGCTCAGCATTTTCGTGGAACCCATCTACTT  1847

Query 1626  CTCGAGCATCATCCTGGGCAGCCTTTACCACGGGGACCACCTTTCCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACA  1699
            |||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  CTCCAGCATCATCTTGGGCAGCCTGTACCACGGGGACCACCTCTCCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACA  1921

Query 1700  TAGAGGACCTGCCACCTCTCTACACCCTCAACAAGCCTTTGCTCAGTGGCATCAGCAATGCAGAAGCACGGCAG  1773
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1922  TAGAGGACCTGCCACCGCTCTACACTCTCAACAAGCCCCTGCTCAGCGGCATCAGCAATGCAGAGGCACGGCAG  1995

Query 1774  CCAGGGAAGGCCCCCAACTTCAGTGTCAACTGGACGGTAGGCGACTCCGCTATTGAGGTCATCAACGCCACGAC  1847
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||.|.||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1996  CCAGGGAAGGCACCCAACTTCAGTGTCAACTGGACAGTGGGTGACGCCACCATTGAGGTCATCAATGCCACAAC  2069

Query 1848  TGGGAAGGATGAGCTGGGCCGCGCGTCCCGCCTGTGTAAGCACGCGTTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTGCACG  1921
            .||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2070  AGGGAAGGATGAGCTTGGCCGCCCATCCCGCCTGTGTAAGCACGCGCTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTACACG  2143

Query 1922  GCAAGGTTCCCTCCCACTTACTACGCTCCAAGATTACCAAACCCAACGTGTACCATGAGTCCAAGCTGGCGGCA  1995
            |||||||||||.|||||.|.||.|||.|||||||.||.||.||.|.|...|||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 2144  GCAAGGTTCCCCCCCACCTGCTGCGCACCAAGATCACTAAGCCTACCACATACCACGAGTCCAAGCTGGCAGCG  2217

Query 1996  AAGGAGTACCAGGCCGCCAAGGCGCGTCTGTTCACAGCCTTCATCAAGGCGGGGCTGGGGGCCTGGGTGGAGAA  2069
            |.||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2218  AGGGAGTACCAGGCTGCCAAGGCCCGTCTGTTCACTGCCTTCATCAAGGCGGGGCTGGGCGCCTGGGTGGAGAA  2291

Query 2070  GCCCACCGAGCAGGACCAGTTCTCACTCACGCCC  2103
            ||||||.|||||||||||||||||..||||.|||
Sbjct 2292  GCCCACAGAGCAGGACCAGTTCTCCTTCACTCCC  2325