Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05771
• Subject: XM_006513063.3
• Aligned Length: 2298
• Identities: 1847
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCTTGGGACTAGCAGGGGCTGTCAGCCACTCATCGGTCCACATGGCATCTCTAGGCTTGGGAACTTTGAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGTGGGTGCCTTCTTCAGCTTCGTGGGGCGTCGGTATAAAAGGAGGCGCAAGAAGCGCTCTGAAAGGAAAGACA  148

Query    1  --------------------------------------------ATGGATATAGAAGATGAAGAAAACATGAGT  30
                                                        ||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  149  AAAGAGGTCTCCGCCAGTCAAGAAGCCCTCAAAAGTGTTTTACCATGGATATAGAAGATGAAGAGAATATGAGT  222

Query   31  TCCAGCAGCACTGATGTGAAGGAAAACCGCAATCTGGACAACGTGTCCCCCAAGGATGGCAGCACACCTGGGCC  104
            |||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||.||.||||||||||..||||||||||||||||
Sbjct  223  TCCAGCAGCACTGATATTAAAGAAAACCGCAATCTGGACAACATGCCCCCCAAGGACAGCAGCACACCTGGGCC  296

Query  105  TGGCGAGGGCTCTCAGCTCTCCAATGGGGGTGGTGGTGGCCCCGGCAGAAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCA  178
            |||||||||...||.|||||||||.||||||||||||.||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGGCGAGGGTATTCCGCTCTCCAACGGGGGTGGTGGTAGCACCAGCAGGAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCA  370

Query  179  ATGGCCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAAAGGAGGAAAACACCAGGGCCCGTCCTCCCCAAGAACGCCCTGATG  252
            ||||.|||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATGGTCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAGCGAAGGAAAACACCAGGGCCTGTTCTGCCCAAGAACGCCCTGATG  444

Query  253  CAGCTGAATGAGATCAAGCCTGGTTTGCAGTACACACTCCTGTCCCAGACTGGGCCCGTGCACGCGCCTTTGTT  326
            ||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||..||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||.||||
Sbjct  445  CAGCTGAACGAGATCAAACCTGGCTTACAGTACATGCTGCTGTCCCAGACAGGACCCGTGCATGCACCTCTGTT  518

Query  327  TGTCATGTCTGTGGAGGTGAATGGCCAGGTTTTTGAGGGCTCTGGTCCCACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATG  400
            ||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTCATGTCTGTGGAGGTAAACGGGCAGGTTTTTGAGGGCTCTGGCCCTACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATG  592

Query  401  CTGCTGAGAAGGCCTTGAGGTCTTTCGTTCAGTTTCCTAATGCCTCTGAGGCCCACCTGGCCATGGGGAGGACC  474
            ||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct  593  CTGCTGAGAAGGCCCTGAGGTCTTTTGTCCAGTTTCCCAACGCCTCCGAGGCCCACCTAGCCATGGGAAGGACC  666

Query  475  CTGTCTGTCAACACGGACTTCACATCTGACCAGGCCGACTTCCCTGACACGCTCTTCAATGGTTTTGAAACTCC  548
            ||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  667  CTCTCTGTGAACACAGACTTCACGTCTGACCAGGCTGACTTCCCTGACACACTCTTCAATGGCTTCGAGACTCC  740

Query  549  TGACAAGGCGGAGCCTCCCTTTTACGTGGGCTCCAATGGGGATGACTCCTTCAGTTCCAGCGGGGACCTCAGCT  622
            .||||||.|.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||..|||||.
Sbjct  741  AGACAAGTCAGAGCCACCCTTCTACGTAGGCTCCAACGGGGATGACTCGTTCAGCTCAAGTGGAGATGTCAGCC  814

Query  623  TGTCTGCTTCCCCGGTGCCTGCCAGCCTAGCCCAGCCTCCTCT--CCCTGCCTTACCACCATTCCCACCCCCGA  694
            |.||.||.|||||.||||||||||||||..|||||||||||||  ||.|.||  ||||||||||||||||||.|
Sbjct  815  TATCGGCCTCCCCAGTGCCTGCCAGCCTTACCCAGCCTCCTCTGCCCATCCC--ACCACCATTCCCACCCCCAA  886

Query  695  GTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAACGAACTGCGCCCAGGACTCAAGTATGACTTCCTCTCCGAGAGCGGG  768
            ||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  887  GTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAATGAGCTACGCCCAGGGCTGAAGTATGACTTCCTCTCTGAGAGTGGG  960

Query  769  GAGAGCCATGCCAAGAGCTTCGTCATGTCTGTGGTCGTGGATGGTCAGTTCTTTGAAGGCTCGGGGAGAAACAA  842
            ||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  961  GAGAGCCACGCCAAGAGCTTCGTCATGTCCGTGGTGGTAGATGGCCAGTTCTTTGAGGGCTCAGGAAGAAACAA  1034

Query  843  GAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCGCAGTCTGCCCTGGCCGCCATTTTTAACTTGCACTTGGATCAGACGCCAT  916
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|..|.||.||.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1035  GAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCACAGTCTGCCTTGGCTACTGTCTTCAATTTGCACTTGGACCAAACACCAT  1108

Query  917  CTCGCCAGCCTATTCCCAGTGAGGGTCTTCAGCTGCATTTACCGCAGGTTTTAGCTGACGCTGTCTCACGCCTG  990
            |||||||||||.|.|.||||||||||||||||.|||||||.||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1109  CTCGCCAGCCTGTCCTCAGTGAGGGTCTTCAGTTGCATTTGCCACAGGTATTGGCAGATGCTGTCTCCCGCCTG  1182

Query  991  GTCCTGGGTAAGTTTGGTGACCTGACCGACAACTTCTCCTCCCCTCACGCTCGCAGAAAAGTGCTGGCTGGAGT  1064
            ||||||||||||||..||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||..|||||||
Sbjct 1183  GTCCTGGGTAAGTTCAGTGACCTGACAGACAACTTTTCCTCCCCTCATGCACGAAGGAAAGTGCTCTCTGGAGT  1256

Query 1065  CGTCATGACAACAGGCACAGATGTTAAAGATGCCAAGGTGATAAGTGTTTCTACAGGAACAAAATGTATTAATG  1138
            .||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.|
Sbjct 1257  AGTGATGACCACAGGTACAGATGTCAAAGATGCCAAGGTGATAAGTGTTTCGACAGGGACGAAGTGTATCAACG  1330

Query 1139  GTGAATACATGAGTGATCGTGGCCTTGCATTAAATGACTGCCATGCAGAAATAATATCTCGGAGATCCTTGCTC  1212
            ||||||||||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.|||.|||||
Sbjct 1331  GTGAATACATGAGTGACCGTGGCCTCGCACTCAATGACTGCCACGCAGAGATAATCTCCCGAAGGTCCCTGCTC  1404

Query 1213  AGATTTCTTTATACACAACTTGAGCTTTACTTAAATAACAAAGATGATCA-AAAAAGATCCATCTTTCAGAAAT  1285
            ||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|| |||||| |||||.||||||||.|
Sbjct 1405  AGGTTTCTTTATGCACAGCTCGAGCTTTATTTAAATAACAAAGAAGACCAGAAAAAG-TCCATATTTCAGAAGT  1477

Query 1286  CAGAGCGAGGGGGGTTTAGGCTGAAGGAGAATGTCCAGTTTCATCTGTACATCAGCACCTCTCCCTGTGGAGAT  1359
            |||||||.||.|||||..||||||||||.|..||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.
Sbjct 1478  CAGAGCGGGGTGGGTTCCGGCTGAAGGATACCGTGCAGTTCCACCTGTACATCAGCACCTCGCCCTGCGGAGAC  1551

Query 1360  GCCAGAATCTTCTCACCACATGAGCCAATCCTGGAAGAACCAGCAGATAGACACCCAAATCGTAAAGCAAGAGG  1433
            ||||||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1552  GCCAGAATATTCTCTCCCCACGAGCCCGTGCTAGAGGAACCAGCAGATAGACATCCGAATCGCAAAGCAAGGGG  1625

Query 1434  ACAGCTACGGACCAAAATAGAGTCTGGTGAGGGGACGATTCCAGTGCGCTCCAATGCGAGCATCCAAACGTGGG  1507
            ||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1626  ACAGCTACGGACGAAAATAGAGTCTGGCGAGGGGACAATCCCTGTGCGCTCAAATGCCAGCATCCAGACCTGGG  1699

Query 1508  ACGGGGTGCTGCAAGGGGAGCGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGTGACAAGATTGCACGCTGGAACGTGGTGGGC  1581
            |||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  ACGGGGTGCTGCAGGGGGAACGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGTGACAAGATAGCACGCTGGAACGTGGTGGGC  1773

Query 1582  ATCCAGGGATCCCTGCTCAGCATTTTCGTGGAGCCCATTTACTTCTCGAGCATCATCCTGGGCAGCCTTTACCA  1655
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||
Sbjct 1774  ATCCAGGGGTCCCTGCTCAGCATTTTCGTGGAACCCATCTACTTCTCCAGCATCATCTTGGGCAGCCTGTACCA  1847

Query 1656  CGGGGACCACCTTTCCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACATAGAGGACCTGCCACCTCTCTACACCCTCA  1729
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1848  CGGGGACCACCTCTCCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACATAGAGGACCTGCCACCGCTCTACACTCTCA  1921

Query 1730  ACAAGCCTTTGCTCAGTGGCATCAGCAATGCAGAAGCACGGCAGCCAGGGAAGGCCCCCAACTTCAGTGTCAAC  1803
            |||||||..|||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1922  ACAAGCCCCTGCTCAGCGGCATCAGCAATGCAGAGGCACGGCAGCCAGGGAAGGCACCCAACTTCAGTGTCAAC  1995

Query 1804  TGGACGGTAGGCGACTCCGCTATTGAGGTCATCAACGCCACGACTGGGAAGGATGAGCTGGGCCGCGCGTCCCG  1877
            |||||.||.||.|||.||.|.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.|||||
Sbjct 1996  TGGACAGTGGGTGACGCCACCATTGAGGTCATCAATGCCACAACAGGGAAGGATGAGCTTGGCCGCCCATCCCG  2069

Query 1878  CCTGTGTAAGCACGCGTTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTGCACGGCAAGGTTCCCTCCCACTTACTACGCTCCA  1951
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|.||.|||.|||
Sbjct 2070  CCTGTGTAAGCACGCGCTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTACACGGCAAGGTTCCCCCCCACCTGCTGCGCACCA  2143

Query 1952  AGATTACCAAACCCAACGTGTACCATGAGTCCAAGCTGGCGGCAAAGGAGTACCAGGCCGCCAAGGCGCGTCTG  2025
            ||||.||.||.||.|.|...|||||.||||||||||||||.||.|.||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 2144  AGATCACTAAGCCTACCACATACCACGAGTCCAAGCTGGCAGCGAGGGAGTACCAGGCTGCCAAGGCCCGTCTG  2217

Query 2026  TTCACAGCCTTCATCAAGGCGGGGCTGGGGGCCTGGGTGGAGAAGCCCACCGAGCAGGACCAGTTCTCACTCAC  2099
            |||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||
Sbjct 2218  TTCACTGCCTTCATCAAGGCGGGGCTGGGCGCCTGGGTGGAGAAGCCCACAGAGCAGGACCAGTTCTCCTTCAC  2291

Query 2100  GCCC  2103
            .|||
Sbjct 2292  TCCC  2295