Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05771
• Subject: XM_006513064.1
• Aligned Length: 2136
• Identities: 1829
• Gaps: 54

Alignment

Query    1  ATGGATATAGAAGATGAAGAAAACATGAGTTCCAGCAGCACTGATGTGAAGGAAAACCGCAATCTGGACAACGT  74
            |||..|.|||                  |||||||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||||||.|
Sbjct    1  ATGCCTCTAG------------------GTTCCAGCAGCACTGATATTAAAGAAAACCGCAATCTGGACAACAT  56

Query   75  GTCCCCCAAGGATGGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGCTCTCAGCTCTCCAATGGGGGTGGTGGTGGCCCCG  148
            |.||||||||||..|||||||||||||||||||||||||...||.|||||||||.||||||||||||.||.||.
Sbjct   57  GCCCCCCAAGGACAGCAGCACACCTGGGCCTGGCGAGGGTATTCCGCTCTCCAACGGGGGTGGTGGTAGCACCA  130

Query  149  GCAGAAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGCCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAAAGGAGGAAAACACCA  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||
Sbjct  131  GCAGGAAGCGGCCCCTGGAGGAGGGCAGCAATGGTCACTCCAAGTACCGCCTGAAGAAGCGAAGGAAAACACCA  204

Query  223  GGGCCCGTCCTCCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAATGAGATCAAGCCTGGTTTGCAGTACACACTCCTGTC  296
            |||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||..||.|||||
Sbjct  205  GGGCCTGTTCTGCCCAAGAACGCCCTGATGCAGCTGAACGAGATCAAACCTGGCTTACAGTACATGCTGCTGTC  278

Query  297  CCAGACTGGGCCCGTGCACGCGCCTTTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTGAATGGCCAGGTTTTTGAGGGCTCTG  370
            ||||||.||.||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  279  CCAGACAGGACCCGTGCATGCACCTCTGTTTGTCATGTCTGTGGAGGTAAACGGGCAGGTTTTTGAGGGCTCTG  352

Query  371  GTCCCACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCTTGAGGTCTTTCGTTCAGTTTCCTAATGCC  444
            |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct  353  GCCCTACAAAGAAAAAGGCAAAACTCCATGCTGCTGAGAAGGCCCTGAGGTCTTTTGTCCAGTTTCCCAACGCC  426

Query  445  TCTGAGGCCCACCTGGCCATGGGGAGGACCCTGTCTGTCAACACGGACTTCACATCTGACCAGGCCGACTTCCC  518
            ||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  427  TCCGAGGCCCACCTAGCCATGGGAAGGACCCTCTCTGTGAACACAGACTTCACGTCTGACCAGGCTGACTTCCC  500

Query  519  TGACACGCTCTTCAATGGTTTTGAAACTCCTGACAAGGCGGAGCCTCCCTTTTACGTGGGCTCCAATGGGGATG  592
            ||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||
Sbjct  501  TGACACACTCTTCAATGGCTTCGAGACTCCAGACAAGTCAGAGCCACCCTTCTACGTAGGCTCCAACGGGGATG  574

Query  593  ACTCCTTCAGTTCCAGCGGGGACCTCAGCTTGTCTGCTTCCCCGGTGCCTGCCAGCCTAGCCCAGCCTCCTCT-  665
            ||||.|||||.||.||.||.||..|||||.|.||.||.|||||.||||||||||||||..||||||||||||| 
Sbjct  575  ACTCGTTCAGCTCAAGTGGAGATGTCAGCCTATCGGCCTCCCCAGTGCCTGCCAGCCTTACCCAGCCTCCTCTG  648

Query  666  -CCCTGCCTTACCACCATTCCCACCCCCGAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAACGAACTGCGCCCAGGA  738
             ||.|.||  ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.
Sbjct  649  CCCATCCC--ACCACCATTCCCACCCCCAAGTGGGAAGAATCCCGTGATGATCTTGAATGAGCTACGCCCAGGG  720

Query  739  CTCAAGTATGACTTCCTCTCCGAGAGCGGGGAGAGCCATGCCAAGAGCTTCGTCATGTCTGTGGTCGTGGATGG  812
            ||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct  721  CTGAAGTATGACTTCCTCTCTGAGAGTGGGGAGAGCCACGCCAAGAGCTTCGTCATGTCCGTGGTGGTAGATGG  794

Query  813  TCAGTTCTTTGAAGGCTCGGGGAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCGCAGTCTGCCCTGGCCGCCA  886
            .|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||..|..
Sbjct  795  CCAGTTCTTTGAGGGCTCAGGAAGAAACAAGAAGCTTGCCAAGGCCCGGGCTGCACAGTCTGCCTTGGCTACTG  868

Query  887  TTTTTAACTTGCACTTGGATCAGACGCCATCTCGCCAGCCTATTCCCAGTGAGGGTCTTCAGCTGCATTTACCG  960
            |.||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|.|.||||||||||||||||.|||||||.||.
Sbjct  869  TCTTCAATTTGCACTTGGACCAAACACCATCTCGCCAGCCTGTCCTCAGTGAGGGTCTTCAGTTGCATTTGCCA  942

Query  961  CAGGTTTTAGCTGACGCTGTCTCACGCCTGGTCCTGGGTAAGTTTGGTGACCTGACCGACAACTTCTCCTCCCC  1034
            |||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||..||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  943  CAGGTATTGGCAGATGCTGTCTCCCGCCTGGTCCTGGGTAAGTTCAGTGACCTGACAGACAACTTTTCCTCCCC  1016

Query 1035  TCACGCTCGCAGAAAAGTGCTGGCTGGAGTCGTCATGACAACAGGCACAGATGTTAAAGATGCCAAGGTGATAA  1108
            |||.||.||.||.||||||||..|||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1017  TCATGCACGAAGGAAAGTGCTCTCTGGAGTAGTGATGACCACAGGTACAGATGTCAAAGATGCCAAGGTGATAA  1090

Query 1109  GTGTTTCTACAGGAACAAAATGTATTAATGGTGAATACATGAGTGATCGTGGCCTTGCATTAAATGACTGCCAT  1182
            |||||||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.|.|||||||||||.
Sbjct 1091  GTGTTTCGACAGGGACGAAGTGTATCAACGGTGAATACATGAGTGACCGTGGCCTCGCACTCAATGACTGCCAC  1164

Query 1183  GCAGAAATAATATCTCGGAGATCCTTGCTCAGATTTCTTTATACACAACTTGAGCTTTACTTAAATAACAAAGA  1256
            |||||.|||||.||.||.||.|||.|||||||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1165  GCAGAGATAATCTCCCGAAGGTCCCTGCTCAGGTTTCTTTATGCACAGCTCGAGCTTTATTTAAATAACAAAGA  1238

Query 1257  TGATCA-AAAAAGATCCATCTTTCAGAAATCAGAGCGAGGGGGGTTTAGGCTGAAGGAGAATGTCCAGTTTCAT  1329
            .||.|| |||||| |||||.||||||||.||||||||.||.|||||..||||||||||.|..||.|||||.||.
Sbjct 1239  AGACCAGAAAAAG-TCCATATTTCAGAAGTCAGAGCGGGGTGGGTTCCGGCTGAAGGATACCGTGCAGTTCCAC  1311

Query 1330  CTGTACATCAGCACCTCTCCCTGTGGAGATGCCAGAATCTTCTCACCACATGAGCCAATCCTGGA---------  1394
            |||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||..|.||.||         
Sbjct 1312  CTGTACATCAGCACCTCGCCCTGCGGAGACGCCAGAATATTCTCTCCCCACGAGCCCGTGCTAGAGGGTATGAC  1385

Query 1395  ---------------------AGAACCAGCAGATAGACACCCAAATCGTAAAGCAAGAGGACAGCTACGGACCA  1447
                                 ||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1386  GCCAGACTCTCACCAGCTGACAGAACCAGCAGATAGACATCCGAATCGCAAAGCAAGGGGACAGCTACGGACGA  1459

Query 1448  AAATAGAGTCTGGTGAGGGGACGATTCCAGTGCGCTCCAATGCGAGCATCCAAACGTGGGACGGGGTGCTGCAA  1521
            |||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1460  AAATAGAGTCTGGCGAGGGGACAATCCCTGTGCGCTCAAATGCCAGCATCCAGACCTGGGACGGGGTGCTGCAG  1533

Query 1522  GGGGAGCGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGTGACAAGATTGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGATCCCT  1595
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1534  GGGGAACGGCTGCTCACCATGTCCTGCAGTGACAAGATAGCACGCTGGAACGTGGTGGGCATCCAGGGGTCCCT  1607

Query 1596  GCTCAGCATTTTCGTGGAGCCCATTTACTTCTCGAGCATCATCCTGGGCAGCCTTTACCACGGGGACCACCTTT  1669
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1608  GCTCAGCATTTTCGTGGAACCCATCTACTTCTCCAGCATCATCTTGGGCAGCCTGTACCACGGGGACCACCTCT  1681

Query 1670  CCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACATAGAGGACCTGCCACCTCTCTACACCCTCAACAAGCCTTTGCTC  1743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||..|||||
Sbjct 1682  CCAGGGCCATGTACCAGCGGATCTCCAACATAGAGGACCTGCCACCGCTCTACACTCTCAACAAGCCCCTGCTC  1755

Query 1744  AGTGGCATCAGCAATGCAGAAGCACGGCAGCCAGGGAAGGCCCCCAACTTCAGTGTCAACTGGACGGTAGGCGA  1817
            ||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||
Sbjct 1756  AGCGGCATCAGCAATGCAGAGGCACGGCAGCCAGGGAAGGCACCCAACTTCAGTGTCAACTGGACAGTGGGTGA  1829

Query 1818  CTCCGCTATTGAGGTCATCAACGCCACGACTGGGAAGGATGAGCTGGGCCGCGCGTCCCGCCTGTGTAAGCACG  1891
            |.||.|.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||
Sbjct 1830  CGCCACCATTGAGGTCATCAATGCCACAACAGGGAAGGATGAGCTTGGCCGCCCATCCCGCCTGTGTAAGCACG  1903

Query 1892  CGTTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTGCACGGCAAGGTTCCCTCCCACTTACTACGCTCCAAGATTACCAAACCC  1965
            ||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.|.||.|||.|||||||.||.||.||.
Sbjct 1904  CGCTGTACTGTCGCTGGATGCGTGTACACGGCAAGGTTCCCCCCCACCTGCTGCGCACCAAGATCACTAAGCCT  1977

Query 1966  AACGTGTACCATGAGTCCAAGCTGGCGGCAAAGGAGTACCAGGCCGCCAAGGCGCGTCTGTTCACAGCCTTCAT  2039
            |.|...|||||.||||||||||||||.||.|.||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1978  ACCACATACCACGAGTCCAAGCTGGCAGCGAGGGAGTACCAGGCTGCCAAGGCCCGTCTGTTCACTGCCTTCAT  2051

Query 2040  CAAGGCGGGGCTGGGGGCCTGGGTGGAGAAGCCCACCGAGCAGGACCAGTTCTCACTCACGCCC  2103
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||.|||
Sbjct 2052  CAAGGCGGGGCTGGGCGCCTGGGTGGAGAAGCCCACAGAGCAGGACCAGTTCTCCTTCACTCCC  2115