Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_05811
Subject:
NM_001289546.1
Aligned Length:
697
Identities:
593
Gaps:
9

Alignment

Query   1  MADIKTGIFAKNVQKRLNRAQEKVLQKLGKADETKDEQFEEYVQNFKRQEAEGTRLQRELRGYLAAIKGMQEAS  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  MADIKTGIFAKNVQKRLNRAQEKVLQKLGKADETKDEQFEEYVQNFKRQEAEGTRLQRELRGYLAAIKGMQEAS  74

Query  75  MKLTESLHEVYEPDWYGREDVKMVGEKCDVLWEDFHQKLVDGSLLTLDTYLGQFPDIKNRIAKRSRKLVDYDSA  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  MKLTESLHEVYEPDWYGREDVKMVGEKCDVLWEDFHQKLVDGSLLTLDTYLGQFPDIKNRIAKRSRKLVDYDSA  148

Query 149  RHHLEALQSSKRKDESRISKAEEEFQKAQKVFEEFNVDLQEELPSLWSRRVGFYVNTFKNVSSLEAKFHKEIAV  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  RHHLEALQSSKRKDESRISKAEEEFQKAQKVFEEFNVDLQEELPSLWSSRVGFYVNTFKNVSSLEAKFHKEIAV  222

Query 223  LCHKLYEVMTKLGDQHADKAFTIQGAPSDSGPLRIAKTPSPPEEPSPLPSPTASPNHTLAPASPAPARPRSPSQ  296
           |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 223  LCHKLYEVMTKLGDQHADKAFSIQGAPSDSGPLRIAKTPSPPEEPSPLPSPTASPNHTLAPASPAPVRPRSPSQ  296

Query 297  TRKGPPVPPLPKVTPTKELQQENIISFFEDNFVPEISVTTPSQNEVPEVKKEETLLDLDFDPFKPEVTPAGSAG  370
           |||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||.|.|||||.
Sbjct 297  TRKGPPVPPLPKVTPTKELKQENIINFFEDNFVPEINVTTPSQNEVLEVKKEETLLDLDFDPFKPDVAPAGSAA  370

Query 371  VTHSPMSQTLPWDLWTTSTDLVQPASGGSFNGFTQPQDTSLFTMQTDQSMICNLAESEQAPPTEPKAEEPLA-A  443
           .||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||.|...|||.|||.||||.||||.| |
Sbjct 371  ATHSPMSQTLPWDLWTTSTDLVQPASGGSFNDFTQAQDTSLFTMQTDQNMVGGLAETEQALPTEPQAEEPPATA  444

Query 444  VTPAVGLDLGMDTRAEEPVEEAVIIPGADADAAVGTLVSAAEGAPGEEAEAETATVPAGEGVSLEEAKIGTETT  517
           ..|..|||||..  .|||.|||||.|..|....|.|.| ..||||.||||||.|..|||||.|.|.|||..|.|
Sbjct 445  AAPTAGLDLGLE--MEEPKEEAVIPPATDTGETVETAV-PTEGAPVEEAEAEKAALPAGEGGSPEGAKIDGEST  515

Query 518  EGAESAQPEAEELEATVPQEKVIPSVVIEPASNHEEEGEN-EITIGAEPKETTEDAAPPGPTSETPELATEQKP  590
           |.|.|..|...|.||..||  ||||||||||||||.|||. |...|.||.|..||.|..|...|..|.|||..|
Sbjct 516  ELAISESPQPVEPEAGAPQ--VIPSVVIEPASNHEGEGEHQETATGTEPREAAEDVAAQGSAGEKQEVATEPTP  587

Query 591  IQDPQPTPSAPAMGAADQLASAREASQELPPGFLYKVETLHDFEAANSDELTLQRGDVVLVVPSDSEADQDAGW  664
           . |.|.|..|.| ||.|...||..|.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 588  L-DSQATLPASA-GAVDASLSAGDATQELPPGFLYKVETLHDFEAANSDELNLQRGDVVLVVPSDSEADQDAGW  659

Query 665  LVGVKESDWLQYRDLATYKGLFPENFTRRLD  695
           ||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 660  LVGVKESDWLQYRDLATYKGLFPENFTRRLE  690