Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05811
- Subject:
- XM_011244304.2
- Aligned Length:
- 2109
- Identities:
- 1671
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAAAACGTGCAAAAGCGCCTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT 74
Query 75 CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG 148
|||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 CCAGAAGCTGGGGAAGGCTGACGAGACAAAAGATGAACAGTTTGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAGG 148
Query 149 AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC 222
|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 149 AGGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGGGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGTATGCAGGAGGCCTCA 222
Query 223 ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG 296
|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||||||
Sbjct 223 ATGAAGCTCACTGAATCTCTACATGAAGTCTACGAGCCAGACTGGTATGGACGGGAAGATGTAAAGATGGTTGG 296
Query 297 TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT 370
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct 297 TGAGAAGTGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAGCTAGTGGATGGCTCCTTGCTGACACTGGACACCT 370
Query 371 ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC 444
|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 371 ACCTGGGCCAGTTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCTAAGCGCAGCAGGAAGCTTGTGGATTATGATAGTGCT 444
Query 445 CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT 518
|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||..||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||
Sbjct 445 CGCCATCACCTGGAGGCTCTGCAGAGTTCCAAACGGAAAGATGAGAGTCGGATCTCTAAGGCAGAAGAGGAGTT 518
Query 519 TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct 519 TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTCAATGTTGACTTACAAGAAGAGTTGCCGTCATTGTGGTCAAGTC 592
Query 593 GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG 666
|||||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 593 GAGTTGGCTTTTACGTCAATACTTTCAAAAATGTCTCCAGCCTTGAGGCCAAGTTTCATAAGGAAATCGCAGTG 666
Query 667 CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG 740
|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||.|||.|||||
Sbjct 667 CTTTGCCACAAGCTCTATGAAGTGATGACGAAACTCGGTGATCAGCATGCTGACAAGGCCTTCAGCATTCAAGG 740
Query 741 AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA 814
|||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 741 AGCTCCCAGTGACTCGGGTCCTCTTCGCATTGCAAAGACACCATCACCTCCAGAGGAGCCTTCTCCCCTGCCCA 814
Query 815 GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG 888
||||.||.||.|||||.||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||..||.||..|.||||||||||||
Sbjct 815 GCCCCACGGCTAGTCCCAACCACACATTAGCACCTGCATCTCCTGCCCCAGTGCGACCCAGATCACCTTCACAG 888
Query 889 ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT 962
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 889 ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTGCCTAAAGTCACCCCAACAAAGGAACTGAAACAGGAGAACATCAT 962
Query 963 CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA 1036
||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||...|||||||
Sbjct 963 CAATTTCTTTGAGGACAACTTTGTACCAGAAATCAATGTGACAACACCTTCCCAGAACGAAGTCTTGGAGGTGA 1036
Query 1037 AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA 1110
||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||.|||.|.||.|||||||||||||.|
Sbjct 1037 AGAAGGAAGAGACTTTGCTGGATTTGGACTTTGACCCTTTCAAGCCCGATGTGGCTCCGGCAGGTTCTGCTGCA 1110
Query 1111 GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGACAAGCACTGATTTGGTACAGCCGGC 1184
|.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111 GCGACCCACTCTCCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACTTATGGACGACAAGCACTGATTTGGTACAACCAGC 1184
Query 1185 TTCTGGTGGTTCATTTAATGGATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTA 1258
||||||.|||||||||||||..|||||.|||.|||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||.||
Sbjct 1185 TTCTGGGGGTTCATTTAATGATTTCACCCAGGCCCAGGACACTTCATTATTCACCATGCAGACAGATCAGAATA 1258
Query 1259 TGATCTGCAACTTGGCTGAATCTGAACAGGCTCCACCCACAGAGCCAAAAGCAGAGGAGCCTCTGGCTGCTGTC 1332
||||| ||.|||
Sbjct 1259 TGATC---------------------------CCTCCC------------------------------------ 1269
Query 1333 ACACCTGCCGTTGGTCTGGACCTTGGAATGGACACTCGGGCTGAGGAGCCAGTGGAGGAGGCAGTGATCATACC 1406
|.||..||.||| ||| |||.|.||||| |.|
Sbjct 1270 ------------------------GCAACTGATACT--GGC----GAGACTGTGGA---------------AAC 1298
Query 1407 TGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGGAGAGGAAGCAGAGG 1480
||.|| ||| ||.|||||||.|||||.|..|||||||||||||
Sbjct 1299 TGCAG----TGC-----------------------------CAACTGAGGGTGCCCCGGTGGAGGAAGCAGAGG 1339
Query 1481 CGGAGACGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAAC--TGAAACCACTG 1552
|.||||.|||..|..|||||||.||.|||||||.||||..|||||..|||||||||| || .||||.|||.|
Sbjct 1340 CAGAGAAGGCAGCCCTCCCTGCTGGAGAAGGAGGAAGTCCAGAGGGAGCCAAAATTG--ACGGGGAAAGCACGG 1411
Query 1553 AGGGTG----CAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTG--CCTCAGGAGAAGGTCATT 1620
||..|| |||.|||.|| |||.||.|||.|||||.|||||| ..||| |||| |||||||.
Sbjct 1412 AGCTTGCAATCAGTGAGAGC----CCTCAACCAGTGGAGCCCGAAGC--GGGTGCTCCTC------AGGTCATC 1473
Query 1621 CCTTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAAC---GAAATAACTATAGGTGCAGA 1691
|||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||..|||||||||.|| ||||...|||..|||.|.||
Sbjct 1474 CCTTCTGTTGTCATTGAGCCAGCCTCCAACCATGAAGGAGAAGGAGAACACCAAGAAACTGCTACGGGTACTGA 1547
Query 1692 GCCCAAGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGC----GAGACACCGGAGCTGGCTACGGAG 1761
.||.|.||||.||.|.|||||.|.||||.|.|.|||| .|||| ||||..|.|||..|||||||.|||
Sbjct 1548 ACCGAGGGAGGCCGCTGAGGATGTGGCTGCCCAGGGC----TCAGCGGGTGAGAAGCAGGAAGTGGCTACAGAG 1617
Query 1762 CAGAAGCCTATCCAGGACCCTCAGCCCAC---GCCT---TCTGCACCAGCCATGGGGGCT---GCTGACCAGCT 1826
|..|.|||| |.|||..|||||.|.|| |||| |||||| ||.||| |.||.|..|||
Sbjct 1618 CCCACGCCT---CTGGATTCTCAGGCAACTCTGCCTGCATCTGCA---------GGTGCTGTGGATGCCTCGCT 1679
Query 1827 AGCATCTGCAAGGGAGGCCTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTG 1900
.||||||.||||.|||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1680 ---GTCTGCAGGGGATGCCACTCAGGAACTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACCCTGCATGATTTCG 1750
Query 1901 AGGCAGCAAATTCTGATGAACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCT 1974
|||||||.||.|||||||||||||.|.|||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.
Sbjct 1751 AGGCAGCGAACTCTGATGAACTTAACCTACAAAGGGGTGACGTGGTACTCGTGGTGCCTTCAGACTCAGAAGCC 1824
Query 1975 GATCAGGATGCAGGCTGGCTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAA 2048
||.|||||||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1825 GACCAGGATGCAGGCTGGTTGGTGGGGGTGAAGGAGTCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTGGCCACGTACAA 1898
Query 2049 AGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCACCCGACGCTTAGAT 2085
||||||||||||||||||||||||.||.|||.|.||.
Sbjct 1899 AGGCCTCTTTCCAGAGAACTTCACGCGGCGCCTGGAG 1935