Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05811
• Subject: XM_017011996.2
• Aligned Length: 2765
• Identities: 2038
• Gaps: 682

Alignment

Query    1  ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCGACATCAAGACGGGCATCTTCGCCAAGAACGTCCAGAAGCGACTCAACCGCGCGCAGGAAAAGGTCCT  74

Query   75  CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCAAAAGCTGGGGAAAGCTGATGAGACAAAAGACGAACAGTTCGAAGAATATGTCCAGAACTTCAAACGGCAAG  148

Query  149  AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGCAGAGGGTACCAGACTTCAGCGAGAACTCCGAGGATATTTAGCAGCAATCAAAGGCATGCAGGAGGCCTCC  222

Query  223  ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGAAGCTCACAGAGTCGCTGCATGAAGTCTATGAGCCTGACTGGTATGGGCGGGAAGATGTGAAAATGGTTGG  296

Query  297  TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGAAATGTGATGTGCTGTGGGAAGACTTCCATCAAAAACTCGTGGATGGGTCCTTGCTAACACTGGATACCT  370

Query  371  ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCTGGGGCAATTTCCTGACATAAAGAATCGCATCGCCAAGCGCAGCAGGAAGCTAGTGGACTATGACAGTGCC  444

Query  445  CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCCACCATCTGGAAGCTCTGCAGAGCTCCAAGAGGAAGGATGAGAGTCGAATCTCTAAGGCAGAAGAAGAATT  518

Query  519  TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TCAGAAAGCACAGAAAGTGTTTGAAGAGTTTAACGTTGACTTACAAGAAGAGTTACCATCATTATGGTCAAGAC  592

Query  593  GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GAGTTGGATTTTATGTTAATACTTTCAAAAACGTCTCCAGCCTTGAAGCCAAGTTTCATAAGGAAATTGCGGTG  666

Query  667  CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTTGCCACAAACTGTATGAAGTGATGACAAAACTGGGTGACCAGCACGCCGACAAGGCCTTCACCATCCAAGG  740

Query  741  AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGCGCCCAGTGATTCGGGTCCTCTCCGCATTGCAAAGACACCATCACCGCCTGAGGAGCCTTCACCCCTCCCGA  814

Query  815  GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCCCGACAGCAAGTCCAAATCATACATTAGCACCTGCGTCTCCCGCACCAGCACGGCCTCGGTCACCTTCACAG  888

Query  889  ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACAAGGAAAGGGCCTCCTGTCCCACCTCTACCTAAAGTCACCCCGACAAAGGAACTGCAGCAGGAGAACATCAT  962

Query  963  CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAGTTTCTTTGAGGACAACTTTGTTCCAGAAATCAGTGTGACAACACCTTCCCAGAATGAAGTCCCTGAGGTGA  1036

Query 1037  AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAAAGAGGAGACTTTGCTGGATCTGGACTTTGATCCTTTCAAGCCCGAGGTGACACCTGCAGGTTCTGCTGGA  1110

Query 1111  GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGAC------------AAG---------  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||         
Sbjct 1111  GTGACCCACTCACCCATGTCTCAGACATTGCCCTGGGACCTATGGACGACTGACTCTTCAGAAAGTCTTTCCTT  1184

Query 1164  ------CACTGAT-TTGG-------TACAGCC--------GGC--------TTC-------------TGGT---  1191
                  | ||||| .|||       |.|||.|        |||        |||             ||.|   
Sbjct 1185  GTGTAAC-CTGATCATGGAGGAAACTCCAGACAGTGGGTTGGCCGAAGAAATTCAAAGATCTCAAAATGATATA  1257

Query 1192  GGTTCATTTAATGG--------------ATTCACACAG-----------------CCCCAGG------------  1222
            |||.||||||.|.|              .|.||.||||                 ||.||||            
Sbjct 1258  GGTGCATTTACTTGGGGCCCTGACGCTAGTACAGACAGGGTCAGCCAAGAAGTTACCTCAGGTGGGTTTGGAGA  1331

Query 1223  ATACT-------TC-------------------------ATTATTCACAA-------------TGCAGACAGAC  1251
            |.|||       ||                         |||||.|||.|             |||.|||.|.|
Sbjct 1332  AGACTCTGCATGTCCCTCCGAAACAGAGCAAGACATAAGATTATCCACCAGCCTGCTTTCGTCTGCTGACTGGC  1405

Query 1252  C------------AGAGTATGATC-TGCAACTTGGC-------------TGAATCTGAAC--------------  1285
            |            ||||..|||.| |||..|..|||             ||.|..|||||              
Sbjct 1406  CCACTGTAGCTGAAGAGAGTGAGCATGCCCCGGGGCCAGCCTTTCCAGGTGGAAATGAACAACTGCCCCCAAAG  1479

Query 1286  ----------AGGCT-------CC----------------------------------ACCCA-------CAGA  1301
                      |||||       ||                                  |||||       ||||
Sbjct 1480  CCTGCGCCGGAGGCTGGAGTTGCCATTGCTGCTTGTGTGGAGATGGAGCAGCTGTATGACCCACTTGACTCAGA  1553

Query 1302  ---GCCA------------------------AAAGCA-------------------------------------  1311
               ||||                        ||||.|                                     
Sbjct 1554  CATGCCAGCCATGGACACAGCTGGCCTGTTCAAAGAAAGTCATGAAGATATGAAGAAGTCAGATGAAGAGGAAG  1627

Query 1312  --------------GAGGAGCCTCT---GGCTGCTGT-------------------CACACCT---GCCGTTGG  1346
                          ||.||..||||   |||.|.|||                   .||| ||   ||..|||.
Sbjct 1628  AGAAACAGAAGATGGAAGATTCTCTGTGGGCAGGTGTGGAGGCGTGTCAAAAGGTAGACA-CTGGAGCTATTGA  1700

Query 1347  TCT-----------------------------------------------GGAC-------------------C  1354
            |.|                                               ||||                   |
Sbjct 1701  TATCAAGACACTAGAAGGTACAGAGGAATTTGAAGAGAAAGCATGTGAAAGGACAGGAAACAGAGTGGTAGAAC  1774

Query 1355  TT------------GGAA---------------------------------TGGACACT---------------  1368
            ||            ||||                                 ||||.|||               
Sbjct 1775  TTCTTAATACCATAGGAAAGGAAGACCATAAGACCTTAAAAATTAATGAAGTGGAAACTAGAAAAGATCTAAGA  1848

Query 1369  ---CGGGCTGAGGA----------GCCAGT--------------------------------------------  1385
               .||..|.||||          ||||.|                                            
Sbjct 1849  GCAGGGTATAAGGAAAGTACAAACGCCAATGAAAATTATTTTGAGAAAACTGACCTATTAGAAAAGGACATGGA  1922

Query 1386  -GGAGGAG------------------------------------------------------------------  1392
             |||||||                                                                  
Sbjct 1923  AGGAGGAGATATGGCAAAAGAACTTAGTGACAGAGACCAAGGTCTACATGATGGAATTCAAAAGGCTTCTGGTG  1996

Query 1393  -------------------------------------------------GCAG---------------------  1396
                                                             ||||                     
Sbjct 1997  GTTCATTTAATGGATTCACACAGCCCCAGGATACTTCATTATTCACAATGCAGACAGACCAGAGTATGATCTGC  2070

Query 1397  ----TGATCATACCTGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGG  1466
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2071  AACTTGATCATACCTGGAGCTGATGCTGATGCAGCTGTTGGAACCTTGGTGTCAGCAGCTGAGGGGGCCCCAGG  2144

Query 1467  AGAGGAAGCAGAGGCGGAGACGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAA  1540
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2145  AGAGGAAGCAGAGGCGGAGAAGGCCACTGTCCCTGCCGGGGAAGGAGTAAGTTTAGAGGAGGCCAAAATTGGAA  2218

Query 1541  CTGAAACCACTGAGGGTGCAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAG  1614
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2219  CTGAAACCACTGAGGGTGCAGAGAGTGCCCAACCTGAAGCAGAGGAGCTCGAAGCAACAGTGCCTCAGGAGAAG  2292

Query 1615  GTCATTCCTTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGC  1688
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2293  GTCATTCCTTCGGTGGTCATAGAGCCTGCCTCCAACCATGAAGAGGAAGGAGAAAACGAAATAACTATAGGTGC  2366

Query 1689  AGAGCCCAAGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGC  1762
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2367  AGAGCCCAAGGAGACCACCGAGGACGCGGCTCCTCCGGGCCCCACCAGCGAGACACCGGAGCTGGCTACGGAGC  2440

Query 1763  AGAAGCCTATCCAGGACCCTCAGCCCACGCCTTCTGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCA  1836
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2441  AGAAGCCTATCCAGGACCCTCAGCCCACGCCTTCTGCACCAGCCATGGGGGCTGCTGACCAGCTAGCATCTGCA  2514

Query 1837  AGGGAGGCCTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAA  1910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2515  AGGGAGGCCTCTCAGGAATTGCCTCCTGGCTTTCTCTACAAGGTGGAAACACTGCATGATTTTGAGGCAGCAAA  2588

Query 1911  TTCTGATGAACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATG  1984
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2589  TTCTGATGAACTTACCTTACAAAGGGGTGATGTGGTGCTGGTGGTCCCCTCAGATTCAGAAGCTGATCAGGATG  2662

Query 1985  CAGGCTGGCTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTT  2058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2663  CAGGCTGGCTGGTGGGAGTGAAGGAATCAGACTGGCTTCAGTACAGAGACCTTGCCACCTACAAAGGCCTCTTT  2736

Query 2059  CCAGAGAACTTCACCCGACGCTTAGAT  2085
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2737  CCAGAGAACTTCACCCGACGCTTAGAT  2763