Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05823
• Subject: NR_003573.1
• Aligned Length: 1310
• Identities: 1000
• Gaps: 293

Alignment

Query    1  -------------------------------------------------ATGTCTACTGTTCACGAAATCCTGT  25
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  CATTTGGGGACGCTCTCAGCTCTCGGCGCACGGCCCAGCTTCCTTCAAAATGTCTACTGTTCACGAAATCCTGT  74

Query   26  GCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGATCACTCTACACCCCCAAGTGCATATGGGTCTGTCAAAGCCTATACTAACTTT  99
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct   75  GCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGATCACTCTACACCCCCAAGTGCATATGGGTCTGTCAAAGCCTACACTAACTTT  148

Query  100  GATGCTGAGCGGGATGCTTTGAACATTGAAACAGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGGTCACCATTGTCAA  173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATGCTGAGCGGGATGCTTTGAACATTGAAACAGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGGTCACCATTGTCAA  222

Query  174  CATTTTGACCAACCGCAGCAATGCACAGAGACAGGATATTGCCTTCGCCTACCAGAGAAGGACCAAAAAGGAAC  247
            ||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATTGTGACCAACCGCGACAATGCACAGAGACAGGATATTGTCTTCTCCTACCAGAGAAGGACCAAAAAGGAAC  296

Query  248  TTGCATCAGCACTGAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCTGGAGACGTTGATTTTGGGCCTATTGAAGACACCTGCT  321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTGCATCAGCACTGAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCTGGAGACGGTGATTTTGGGCCTATTGAAGACACCTGCT  370

Query  322  CAGTATGACGCTTCTGAGCTAAAAGCTTCCATGAAGGGGCTGGGAACCGACGAGGACTCTCTCATTGAGATCAT  395
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CAGTATGACGCTTCTGAGCTAAAAGCTTCCATGAAGGGGCTAGGAACCGACGAGGACTCTCTCATTGAGATCAT  444

Query  396  CTGCTCCAGAACCAACCAGGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGACTGATCTGGAGA  469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGCTCCAGAACCAACCAGGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGACTGATCTGGAGA  518

Query  470  AGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCCGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGTAGAAGAGCAGAG  543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCCGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGTAGAAGAGCAGAG  592

Query  544  GATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCTCGGGATCTCTATGACGCTGGAGTGAAGAGGAA  617
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCCCAGGATCTCTATGACGCTGGAGTGAAGAGGAA  666

Query  618  AGGAACTGATGTTCCCAAGTGGATCAGCATCATGACCGAGCGGAGCGTGCCCCACCTCCAGAAAGTATTTGATA  691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGAACTGATGTTCCCAAGTGGATCAGCATCATGACCGAGCGGAGCGTGCCCCACCTCCAGAAAGTATTTGATA  740

Query  692  GGTACAAGAGTTACAGCCCTTATGACATGTTGGAAAGCATCAGGAAAGAGGTTAAAGGAGACCTGGAAAATGCT  765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTACAAGAGTTACAGCCCTTATGACATGTTGGAAAGCATCAGGAAAGAGGTTAAAGGAGACCTGGAAAATGCT  814

Query  766  TTCCTGAACCTGGTTCAGTGCATTCAGAACAAGCCCCTGTATTTTGCTGATCGGCTGTATGACTCCATGAAGGG  839
            ||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  815  TTCCTGAACCTGGTCCAGCGCATTCAGAACAAGCCCTTGTATTTTGCTGATCAGCTGTACGACTCCATGAAGGG  888

Query  840  CAAGGGGACGCGAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCGCAGTGAAGTGGACATGTTGAAAATTAGGT  913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CAAGGGGACGCGAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCGCAGTGAAGTGGACATGTTGAAAATTAGGT  962

Query  914  CTGAATTCAAGAGAAAGTACGGCAAGTCCCTGTACTATTATATCCAGCAAGACACTAAGGGCGACTACCAGAAA  987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTGAATTCAAGAGAAAGTACGGCAAGTCCCTGTACTATTACATCCAGCAAGACACTAAGGGCGACTACCAGAAA  1036

Query  988  GCGCTGCTGTACCTGTGTGGTGGAGATGAC--------------------------------------------  1017
            ||||||||||||||||||||||||||.|||                                            
Sbjct 1037  GCGCTGCTGTACCTGTGTGGTGGAGACGACTGAAGCCCGACACAGCCTGAGCGTCCAGAAATGGTGCTCACCAT  1110

Query 1018  --------------------------------------------------------------------------  1017
                                                                                      
Sbjct 1111  GCTTCCAGCTAACAGGTCTACTAAACATACAAAAGTTTAGCCGGGCGTGGTGGCGCTCGCCTGTAGTCCCAGCT  1184

Query 1018  --------------------------------------------------------------------------  1017
                                                                                      
Sbjct 1185  AGTCCGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGGAAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCGAGATCATGCCACT  1258

Query 1018  ----------------------------------------------------  1017
                                                                
Sbjct 1259  GCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCTAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAA  1310