Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05828
• Subject: NM_001637.4
• Aligned Length: 1725
• Identities: 1724
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCTGTCTCTTCAGTCCTCAGCCTCTCC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCTGTCTCTTCAGTCCTCGGCCTCTCC  74

Query   75  AGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCAGCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTAGGGTGTGTGCTGGTGGTGTCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCAGCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTAGGGTGTGTGCTGGTGGTGTCTG  148

Query  149  TAATAGAACAGCTTGCTCAAGTTCACAACTCGACGGTCCAGGCCTCGATGGAGAGACTGTGCAGCTACCTGCCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAATAGAACAGCTTGCTCAAGTTCACAACTCGACGGTCCAGGCCTCGATGGAGAGACTGTGCAGCTACCTGCCT  222

Query  223  GAAAAACTGTTCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATCATAAAACTGCTTAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAAAACTGTTCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATCATAAAACTGCTTAG  296

Query  297  CGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATGTCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATGTCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTC  370

Query  371  ATCTCTACCCTCTTCCCAAGGAGACATGGAAATTTACACTACAGAAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCTCTACCCTCTTCCCAAGGAGACATGGAAATTTACACTACAGAAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCG  444

Query  445  ATTCTGAAATATTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCTGCCAGAAAATTAA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTCTGAAATATTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCTGCCAGAAAATTAA  518

Query  519  ATTAGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTCAAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCAACACTGCGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATTAGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTCAAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCAACACTGCGGG  592

Query  593  GCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAGTGTACCCAGGTAGAAGGCCGAACAACTGG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAGTGTACCCAGGTAGAAGGCCGAACAACTGG  666

Query  667  GATGTCCATCAGGATTCAAACTGTAATGGCATTTGGGGTGTCGATCCAAAAGATGGAGTTCCATATGAGAAGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGTCCATCAGGATTCAAACTGTAATGGCATTTGGGGTGTCGATCCAAAAGATGGAGTTCCATATGAGAAGAA  740

Query  741  ATTCTGTGAAGGTTCACAGCCCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATCTCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTCTGTGAAGGTTCACAGCCCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATCTCTC  814

Query  815  CTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTGAACTCTTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTGAACTCTTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTT  888

Query  889  GACTGGCCCCAACTCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGGAATTAAAGAAAAATCTATTTACCT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GACTGGCCCCAACTCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGGAATTAAAGAAAAATCTATTTACCT  962

Query  963  TCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCACAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATGGTGCATCTTCCCGAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCACAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATGGTGCATCTTCCCGAA  1036

Query 1037  ACCTGAAGAAATTTATAGAAAGCTTGTCTAGAAACAAGGTGTTGGACTATCCCGCCATCGTTATATATGCCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCTGAAGAAATTTATAGAAAGCTTGTCTAGAAACAAGGTGTTGGACTATCCCGCCATCGTTATATATGCCATG  1110

Query 1111  ATTGGAAATGATGTCTGCAGTGGGAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTCCTGAGAAACTCTACTCCAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATTGGAAATGATGTCTGCAGTGGGAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTCCTGAGAAACTCTACTCCAA  1184

Query 1185  CGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCCCACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCCCACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAG  1258

Query 1259  ATGGAACCTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCGGCCAGCTAAATAAAGACATGACCTAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGGAACCTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCGGCCAGCTAAATAAAGACATGACCTAT  1332

Query 1333  GCGCAGTTGTACTCCTTCCTGAACTGCCTCCAGGTCAGCCCCTGCCACGGCTGGATGTCTTCCAACAAGACGTT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCGCAGTTGTACTCCTTCCTGAACTGCCTCCAGGTCAGCCCCTGCCACGGCTGGATGTCTTCCAACAAGACGTT  1406

Query 1407  GCGGACTCTCACTTCAGAGAGAGCAGAGCAACTCTCCAACACACTGAAAAAAATTGCAGCCAGTGAGAAATTTA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GCGGACTCTCACTTCAGAGAGAGCAGAGCAACTCTCCAACACACTGAAAAAAATTGCAGCCAGTGAGAAATTTA  1480

Query 1481  CAAACTTCAATCTTTTCTACATGGATTTTGCCTTCCATGAAATCATACAGGAGTGGCAGAAGAGAGGCGGACAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAAACTTCAATCTTTTCTACATGGATTTTGCCTTCCATGAAATCATACAGGAGTGGCAGAAGAGAGGCGGACAG  1554

Query 1555  CCCTGGCAGCTCATCGAGCCCGTGGATGGATTCCACCCCAACGAGGTGGCTTTGCTGTTGTTGGCGGATCATTT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCCTGGCAGCTCATCGAGCCCGTGGATGGATTCCACCCCAACGAGGTGGCTTTGCTGTTGTTGGCGGATCATTT  1628

Query 1629  CTGGAAAAAGGTGCAGCTCCAGTGGCCCCAAATCCTGGGAAAGGAGAATCCGTTCAACCCCCAGATTAAACAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTGGAAAAAGGTGCAGCTCCAGTGGCCCCAAATCCTGGGAAAGGAGAATCCGTTCAACCCCCAGATTAAACAGG  1702

Query 1703  TGTTTGGAGACCAAGGCGGGCAC  1725
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TGTTTGGAGACCAAGGCGGGCAC  1725