Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05828
- Subject:
- XM_011515341.2
- Aligned Length:
- 1728
- Identities:
- 1312
- Gaps:
- 414
Alignment
Query 1 ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCTGTCTCTTCAGTCCTCAGCCTCTCC 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1 ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCTGTCTCTTCAGTCCTCGGCCTCTCC 74
Query 75 AGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCAGCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTAGGGTGTGTGCTGGTGGTGTCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCAGCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTAGGGTGTGTGCTGGTGGTGTCTG 148
Query 149 TAATAGAACAGCTTGCTCAAGTTCACAACTCGACGGTCCAGGCCTCGATGGAGAGACTGTGCAGCTACCTGCCT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TAATAGAACAGCTTGCTCAAGTTCACAACTCGACGGTCCAGGCCTCGATGGAGAGACTGTGCAGCTACCTGCCT 222
Query 223 GAAAAACTGTTCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATCATAAAACTGCTTAG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAAAAACTGTTCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATCATAAAACTGCTTAG 296
Query 297 CGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATGTCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATGTCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTC 370
Query 371 ATCTCTACCCTCTTCCCAAGGAGACATGGAAATTTACACTACAGAAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATCTCTACCCTCTTCCCAAGGAGACATGGAAATTTACACTACAGAAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCG 444
Query 445 ATTCTGAAATATTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCTGCCAGAAAATTAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTCTGAAATATTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCTGCCAGAAAATTAA 518
Query 519 ATTAGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTCAAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCAACACTGCGGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 ATTAGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTCAAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCAACACTGCGGG 592
Query 593 GCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAGTGTACCCAGGTAGAAGGCCGAACAACTGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAGTGTACCCAGGTAGAAGGCCGAACAACTGG 666
Query 667 GATGTCCATCAGGATTCAAACTGTAATGGCATTTGGGGTGTCGATCCAAAAGATGGAGTTCCATATGAGAAGAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GATGTCCATCAGGATTCAAACTGTAATGGCATTTGGGGTGTCGATCCAAAAGATGGAGTTCCATATGAGAAGAA 740
Query 741 ATTCTGTGAAGGTTCACAGCCCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATCTCTC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATTCTGTGAAGGTTCACAGCCCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATCTCTC 814
Query 815 CTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTGAACTCTTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTGAACTCTTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTT 888
Query 889 GACTGGCCCCAACTCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGGAATTAAAGAAAAATCTATTTACCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GACTGGCCCCAACTCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGGAATTAAAGAAAAATCTATTTACCT 962
Query 963 TCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCACAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATGGTGCATCTTCCCGAA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 TCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCACAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATGGTGCATCTTCCCGAA 1036
Query 1037 ACCTGAAGAAATTTATAGAAAGCTTGTCTAGAAACAAGGTGTTGGACTATCCCGCCATCGTTATATATGCCATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ACCTGAAGAAATTTATAGAAAGCTTGTCTAGAAACAAGGTGTTGGACTATCCCGCCATCGTTATATATGCCATG 1110
Query 1111 ATTGGAAATGATGTCTGCAGTGGGAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTCCTGAGAAACTCTACTCCAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATTGGAAATGATGTCTGCAGTGGGAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTCCTGAGAAACTCTACTCCAA 1184
Query 1185 CGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCCCACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCCCACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAG 1258
Query 1259 ATGGAACCTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCGGCCAGCTAAATAAA---GACATGACC 1329
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||.|||
Sbjct 1259 ATGGAACCTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCG------------AAGGTGAAATG--- 1317
Query 1330 TATGCGCAGTTGTACTCCTTCCTGAACTGCCTCCAGGTCAGCCCCTGCCACGGCTGGATGTCTTCCAACAAGAC 1403
Sbjct 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Query 1404 GTTGCGGACTCTCACTTCAGAGAGAGCAGAGCAACTCTCCAACACACTGAAAAAAATTGCAGCCAGTGAGAAAT 1477
Sbjct 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Query 1478 TTACAAACTTCAATCTTTTCTACATGGATTTTGCCTTCCATGAAATCATACAGGAGTGGCAGAAGAGAGGCGGA 1551
Sbjct 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Query 1552 CAGCCCTGGCAGCTCATCGAGCCCGTGGATGGATTCCACCCCAACGAGGTGGCTTTGCTGTTGTTGGCGGATCA 1625
Sbjct 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Query 1626 TTTCTGGAAAAAGGTGCAGCTCCAGTGGCCCCAAATCCTGGGAAAGGAGAATCCGTTCAACCCCCAGATTAAAC 1699
Sbjct 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Query 1700 AGGTGTTTGGAGACCAAGGCGGGCAC 1725
Sbjct 1318 -------------------------- 1317