Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05923
• Subject: NM_172962.1
• Aligned Length: 2634
• Identities: 2293
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGGACCAGAGGCCCTGTCATCTTTACTGCTGCTG---CTCTTGGTGGCAAGTGGAGATGCTGACATGAAGGG  71
            |||||..|||.|.||||.||||||.|||||||||||   |||||||||.|||.|||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGACAGGGACCCTCTCATCTCTACTGCTGCTGCTACTCTTGGTGACAATTGGAGATGCTGACATGAAGGG  74

Query   72  ACATTTTGATCCTGCCAAGTGCCGCTATGCCCTGGGCATGCAGGACCGGACCATCCCAGACAGTGACATCTCTG  145
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct   75  ACATTTTGACCCTGCCAAGTGCCGCTATGCCCTGGGCATGCAGGACCGCACCATTCCTGACAGCGATATCTCTG  148

Query  146  CTTCCAGCTCCTGGTCAGATTCCACTGCCGCCCGCCACAGCAGGTTGGAGAGCAGTGACGGGGATGGGGCCTGG  219
            ..||||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||||||.||||.||||||||.||.||||||||.|||
Sbjct  149  TGTCCAGCTCCTGGTCGGACTCTACCGCTGCCCGCCACAGCAGGCTGGAAAGCAGTGATGGAGATGGGGCTTGG  222

Query  220  TGCCCCGCAGGGTCGGTGTTTCCCAAGGAGGAGGAGTACTTGCAGGTGGATCTACAACGACTGCACCTGGTGGC  293
            |||||.||||||.|.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|...|.||.|||||||||||
Sbjct  223  TGCCCTGCAGGGCCTGTGTTCCCCAAAGAAGAGGAGTACTTGCAGGTGGACCTTCGTAGGCTACACCTGGTGGC  296

Query  294  TCTGGTGGGCACCCAGGGACGGCATGCCGGGGGCCTGGGCAAGGAGTTCTCCCGGAGCTACCGGCTGCGTTACT  367
            ||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||.|||||||||
Sbjct  297  TCTGGTGGGCACCCAGGGCCGCCATGCTGGGGGTCTGGGCAAAGAGTTCTCCCGAAGCTATCGGTTGCGTTACT  370

Query  368  CCCGGGATGGTCGCCGCTGGATGGGCTGGAAGGACCGCTGGGGTCAGGAGGTGATCTCAGGCAATGAGGACCCT  441
            ||||.|||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||.
Sbjct  371  CCCGAGATGGCCGCCGCTGGATGGACTGGAAGGACCGCTGGGGACAGGAGGTGATTTCGGGTAACGAGGATCCC  444

Query  442  GAGGGAGTGGTGCTGAAGGACCTTGGGCCCCCCATGGTTGCCCGACTGGTTCACTTCTACCCCCGGGCTGACCG  515
            |.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|.||||||||||.||||||||||
Sbjct  445  GGGGGAGTAGTGCTGAAGGACCTTGGGCCCCCCATGGTGGCCCGGCTGGTCCGCTTCTACCCCAGGGCTGACCG  518

Query  516  GGTCATGAGCGTCTGTCTGCGGGTAGAGCTCTATGGCTGCCTCTGGAGGGATGGACTCCTGTCTTACACCGCCC  589
            |||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct  519  GGTCATGAGTGTCTGTCTTCGGGTGGAGCTCTATGGCTGCCTCTGGCGGGATGGACTCCTGTCATATACAGCCC  592

Query  590  CTGTGGGGCAGACAATGTATTTATCTGAGGCCGT-GTAC--CTCAACGACTCCACCTATGACGGACATACCGTG  660
            |.|||||||||||.|||.|.||||||||||...| ||||  |||||.||.|||||.||.||.|||.||||.|..
Sbjct  593  CCGTGGGGCAGACCATGCAGTTATCTGAGGTGATGGTACATCTCAATGATTCCACTTACGATGGATATACTGCT  666

Query  661  GGCGGACTGCAGTATGGGGGTCTGGGCCAGCTGGCAGATGGTGTGGTGGGGCTGGATGACTTTAGGAAGAGTCA  734
            ||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||.||||.||
Sbjct  667  GGAGGGCTGCAGTATGGCGGTCTGGGCCAGCTGGCAGATGGCGTGGTGGGCCTGGATGATTTCAGGCAGAGCCA  740

Query  735  GGAGCTGCGGGTCTGGCCAGGCTATGACTATGTGGGATGGAGCAACCACAGCTTCTCCAGTGGCTATGTGGAGA  808
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||..|||||.|||||||
Sbjct  741  GGAGCTGCGGGTCTGGCCAGGCTATGACTATGTGGGATGGAGCAATCAGAGCTTCCCCACGGGCTACGTGGAGA  814

Query  809  TGGAGTTTGAGTTTGACCGGCTGAGGGCCTTCCAGGCTATGCAGGTCCACTGTAACAACATGCACACGCTGGGA  882
            ||||||||||||||||.|||.|||||.||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  TGGAGTTTGAGTTTGATCGGTTGAGGACCTTCCAGACCATGCAGGTCCACTGTAACAACATGCACACTCTGGGA  888

Query  883  GCCCGTCTGCCTGGCGGGGTGGAATGTCGCTTCCGGCGTGGCCCTGCCATGGCCTGGGAGGGGGAGCCCATGCG  956
            |||||.||.||.||||||||||||||.||.||.....|.||.||.||||||||||||||.||.|||||..|.||
Sbjct  889  GCCCGCCTACCAGGCGGGGTGGAATGCCGGTTTAAAAGGGGTCCCGCCATGGCCTGGGAAGGAGAGCCTGTCCG  962

Query  957  CCACAACCTAGGGGGCAACCTGGGGGACCCCAGAGCCCGGGCTGTCTCAGTGCCCCTTGGCGGCCGTGTGGCTC  1030
            |||....||.||.||||.|||.||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.||.||||..||||..|
Sbjct  963  CCATGCTCTGGGAGGCAGCCTTGGAGACCCCAGAGCCCGGGCCATCTCAGTGCCCCTGGGTGGCCACGTGGGCC  1036

Query 1031  GCTTTCTGCAGTGCCGCTTCCTCTTTGCGGGGCCCTGGTTACTCTTCAGCGAAATCTCCTTCATCTCTGATGTG  1104
            ||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||
Sbjct 1037  GCTTTCTGCAGTGCAGATTCCTCTTTGCAGGTCCTTGGTTACTCTTCAGTGAGATCTCTTTCATCTCAGATGTG  1110

Query 1105  GTGAACAATTCCTCTCCGGCACTGGGAGGCACCTTCCCGCCAGCCCCCTGGTGGCCGCCTGGCCCACCTCCCAC  1178
            ||||||.|.||||||            |.|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1111  GTGAACGACTCCTCT------------GACACCTTCCCACCAGCCCCCTGGTGGCCACCTGGCCCGCCTCCCAC  1172

Query 1179  CAACTTCAGCAGCTTGGAGCTGGAGCCCAGAGGCCAGCAGCCCGTGGCCAAGGCCGAGGGGAGCCCGACCGCCA  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 1173  CAACTTCAGCAGCTTGGAGCTGGAGCCCCGGGGTCAACAGCCAGTGGCCAAGGCGGAGGGGAGCCCAACTGCCA  1246

Query 1253  TCCTCATCGGCTGCCTGGTGGCCATCATCCTGCTCCTGCTGCTCATCATTGCCCTCATGCTCTGGCGGCTGCAC  1326
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||.||||||||
Sbjct 1247  TCCTCATTGGCTGCCTGGTGGCCATCATCCTGCTGCTGCTTCTCATCATCGCGCTGATGCTCTGGAGGCTGCAC  1320

Query 1327  TGGCGCAGGCTCCTCAGCAAGGCTGAACGGAGGGTGTTGGAAGAGGAGCTGACGGTTCACCTCTCTGTCCCTGG  1400
            ||||||.||||.||||||||||||||.||..|.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1321  TGGCGCCGGCTGCTCAGCAAGGCTGAGCGCCGCGTGTTGGAGGAGGAGCTGACGGTTCACCTTTCTGTCCCTGG  1394

Query 1401  GGACACTATCCTCATCAACAACCGCCCAGGTCCTAGAGAGCCACCCCCGTACCAGGAGCCCCGGCCTCGTGGGA  1474
            ||||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1395  GGACACCATCCTCATCAACAACCGCCCAGGACCCCGAGAGCCACCCCCTTACCAGGAGCCCCGGCCTCGGGGGA  1468

Query 1475  ATCCGCCCCACTCTGCTCCCTGTGTCCCCAATGGCTCTGCCTACAGTGGGGACTATATGGAGCCTGAGAAGCCA  1548
            .|||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1469  CTCCACCCCATTCTGCACCCTGCGTCCCCAACGGCTCTGCCTGCAGTGGGGACTATATGGAGCCCGAGAAGCCG  1542

Query 1549  GGCGCCCCGCTTCTGCCCCCACCTCCCCAGAACAGCGTCCCCCATTATGCCGAGGCTGACATTGTTACCCTGCA  1622
            ||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1543  GGTGCCCCGCTTCTACCCCCACCTCCCCAGAACAGCGTCCCCCATTATGCCGAAGCTGACATTGTCACCCTGCA  1616

Query 1623  GGGCGTCACCGGGGGCAACACCTATGCTGTGCCTGCACTGCCCCCAGGGGCAGTCGGGGATGGGCCCCCCAGAG  1696
            |||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1617  GGGCGTCACTGGGGGCAACACCTACGCTGTGCCTGCACTGCCCCCAGGGGCGGTTGGGGATGGGCCCCCCAGAG  1690

Query 1697  TGGATTTCCCTCGATCTCGACTCCGCTTCAAGGAGAAGCTTGGCGAGGGCCAGTTTGGGGAGGTGCACCTGTGT  1770
            |||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 1691  TGGATTTCCCTCGGTCACGGCTCCGCTTCAAGGAGAAGCTTGGCGAGGGCCAATTTGGGGAGGTACACCTGTGT  1764

Query 1771  GAGGTCGACAGCCCTCAAGATCTGGTCAGTCTTGATTTCCCCCTTAATGTGCGTAAGGGACACCCTTTGCTGGT  1844
            ||.||.||...|||.|||||||||||||||..|||.|||||..|.|.|||||..|||||||||||.||||||||
Sbjct 1765  GAAGTAGAGGACCCGCAAGATCTGGTCAGTAGTGACTTCCCTATCAGTGTGCACAAGGGACACCCCTTGCTGGT  1838

Query 1845  AGCTGTCAAGATCTTACGGCCAGATGCCACCAAGAATGCCAGGAATGATTTCCTGAAAGAGGTGAAGATCATGT  1918
            |||.||.||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1839  AGCAGTGAAGATCCTCCGGCCAGATGCCACCAAAAATGCCAGGAATGATTTCCTGAAGGAGGTAAAGATCATGT  1912

Query 1919  CGAGGCTCAAGGACCCAAACATCATTCGGCTGCTGGGCGTGTGTGTGCAGGACGACCCCCTCTGCATGATTACT  1992
            |..||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 1913  CACGGCTGAAGGACCCAAACATCATCCGGCTCCTGGGTGTGTGTGTGCAGGATGACCCCCTCTGCATGATCACA  1986

Query 1993  GACTACATGGAGAACGGCGACCTCAACCAGTTCCTCAGTGCCCACCAGCTGGAGGACAAGGCAGCCGAGGGGGC  2066
            ||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||..|..|||||..
Sbjct 1987  GACTACATGGAGAACGGCGATCTGAACCAGTTCCTCAGTGCCCGCCAGCTGGAGAACAAGGCCACTCAGGGGCT  2060

Query 2067  CCCTGGGGACGGGCAGGCTGCGCAGGGGCCCACCATCAGCTACCAAATGCTGCTGCATGTGGCAGCCCAGATCG  2140
            |.||||||||....||.|||..|||||||||||.||||||||||..||||||.|.||.||||..||||||||||
Sbjct 2061  CTCTGGGGACACAGAGTCTGACCAGGGGCCCACAATCAGCTACCCTATGCTGTTACACGTGGGGGCCCAGATCG  2134

Query 2141  CCTCCGGCATGCGCTATCTGGCCACACTCAACTTTGTACATCGGGACCTGGCCACGCGGAACTGCCTAGTTGGG  2214
            ||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|.||||||
Sbjct 2135  CCTCTGGCATGCGTTATCTCGCCACGCTGAACTTTGTGCATCGGGACCTGGCCACCCGGAACTGCTTGGTTGGG  2208

Query 2215  GAAAATTTCACCATCAAAATCGCAGACTTTGGCATGAGCCGGAACCTCTATGCTGGGGACTATTACCGTGTGCA  2288
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 2209  GAAAATTTCACCATCAAAATCGCCGACTTTGGCATGAGCCGGAATCTCTACGCTGGGGATTATTACCGTGTCCA  2282

Query 2289  GGGCCGGGCAGTGCTGCCCATCCGCTGGATGGCCTGGGAGTGCATCCTCATGGGGAAGTTCACGACTGCGAGTG  2362
            |||||||||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 2283  GGGCCGGGCGGTGCTGCCCATCAGGTGGATGGCTTGGGAGTGCATTCTCATGGGGAAGTTCACAACAGCCAGTG  2356

Query 2363  ACGTGTGGGCCTTTGGTGTGACCCTGTGGGAGGTGCTGATGCTCTGTAGGGCCCAGCCCTTTGGGCAGCTCACC  2436
            ||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||.||.
Sbjct 2357  ACGTTTGGGCCTTCGGAGTGACCCTGTGGGAGGTGCTGATGCTCTGCAGGTCCCAGCCCTTTGGGCAGCTTACA  2430

Query 2437  GACGAGCAGGTCATCGAGAACGCGGGGGAGTTCTTCCGGGACCAGGGCCGGCAGGTGTACCTGTCCCGGCCGCC  2510
            ||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||||||||.|||.|||||.||||.||
Sbjct 2431  GATGAGCAGGTTATCGAGAATGCCGGCGAGTTCTTCAGGGACCAGGGCCGGCAGGTCTACTTGTCCAGGCCACC  2504

Query 2511  TGCCTGCCCGCAGGGCCTATATGAGCTGATGCTTCGGTGCTGGAGCCGGGAGTCTGAGCAGCGACCACCCTTTT  2584
            .||||||||.|||..|||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|.||||||||.||.|||||..
Sbjct 2505  CGCCTGCCCACAGACCCTGTATGAGCTGATGCTCCGGTGTTGGAGCCGGGAGCCCGAGCAGCGGCCGCCCTTCG  2578

Query 2585  CCCAGCTGCATCGGTTCCTGGCAGAGGATGCACTCAACACGGTG  2628
            |||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2579  CCCAGCTTCATCGGTTCCTGGCGGATGATGCGCTCAACACGGTG  2622