Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05963
• Subject: NM_001202555.2
• Aligned Length: 2097
• Identities: 1286
• Gaps: 810

Alignment

Query    1  ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGATTTGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGATTTGAA  74

Query   75  TATAACCTGCCGCTTTGCAGGTGTATTCCACGTGGAGAAAAATGGTCGCTACAGCATCTCTCGGACGGAGGCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TATAACCTGCCGCTTTGCAGGTGTATTCCACGTGGAGAAAAATGGTCGCTACAGCATCTCTCGGACGGAGGCCG  148

Query  149  CTGACCTCTGCAAGGCTTTCAATAGCACCTTGCCCACAATGGCCCAGATGGAGAAAGCTCTGAGCATCGGATTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGACCTCTGCAAGGCTTTCAATAGCACCTTGCCCACAATGGCCCAGATGGAGAAAGCTCTGAGCATCGGATTT  222

Query  223  GAGACCTGCAGGTATGGGTTCATAGAAGGGCATGTGGTGATTCCCCGGATCCACCCCAACTCCATCTGTGCAGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGACCTGCAGGTATGGGTTCATAGAAGGGCACGTGGTGATTCCCCGGATCCACCCCAACTCCATCTGTGCAGC  296

Query  297  AAACAACACAGGGGTGTACATCCTCACATCCAACACCTCCCAGTATGACACATATTGCTTCAATGCTTCAGCTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAACAACACAGGGGTGTACATCCTCACATCCAACACCTCCCAGTATGACACATATTGCTTCAATGCTTCAGCTC  370

Query  371  CACCTGAAGAAGATTGTACATCAGTCACAGACCTGCCCAATGCCTTTGATGGACCAATTACCATAACTATTGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACCTGAAGAAGATTGTACATCAGTCACAGACCTGCCCAATGCCTTTGATGGACCAATTACCATAACTATTGTT  444

Query  445  AACCGTGATGGCACCCGCTATGTCCAGAAAGGAGAATACAGAACGAATCCTGAAGACATCTACCCCAGCAACCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACCGTGATGGCACCCGCTATGTCCAGAAAGGAGAATACAGAACGAATCCTGAAGACATCTACCCCAGCAACCC  518

Query  519  TACTGATGATGACGTGAGCAGCGGCTCCTCCAGTGAAAGGAGCAGCACTTCAGGAGGTTACATCTTTTACACCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TACTGATGATGACGTGAGCAGCGGCTCCTCCAGTGAAAGGAGCAGCACTTCAGGAGGTTACATCTTTTACACCT  592

Query  593  TTTCTACTGTACACCCCATCCCAGACGAAGACAGTCCCTGGATCACCGACAGCACAGACAGAATCCCTGCTACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  593  TTTCTACTGTACACCCCATCCCAGACGAAGACAGTCCCTGGATCACCGACAGCACAGACAGAATCCCTGCTAC-  665

Query  667  AGTACGTCTTCAAATACCATCTCAGCAGGCTGGGAGCCAAATGAAGAAAATGAAGATGAAAGAGACAGACACCT  740
                                                                                      
Sbjct  666  --------------------------------------------------------------------------  665

Query  741  CAGTTTTTCTGGATCAGGCATTGATGATGATGAAGATTTTATCTCCAGCACCATTTCAACCACACCACGGGCTT  814
                                                                                      
Sbjct  666  --------------------------------------------------------------------------  665

Query  815  TTGACCACACAAAACAGAACCAGGACTGGACCCAGTGGAACCCAAGCCATTCAAATCCGGAAGTGCTACTTCAG  888
                                                                                      
Sbjct  666  --------------------------------------------------------------------------  665

Query  889  ACAACCACAAGGATGACTGATGTAGACAGAAATGGCACCACTGCTTATGAAGGAAACTGGAACCCAGAAGCACA  962
                                                                                      
Sbjct  666  --------------------------------------------------------------------------  665

Query  963  CCCTCCCCTCATTCACCATGAGCATCATGAGGAAGAAGAGACCCCACATTCTACAAGCACAATCCAGGCAACTC  1036
                                                                                      
Sbjct  666  --------------------------------------------------------------------------  665

Query 1037  CTAGTAGTACAACGGAAGAAACAGCTACCCAGAAGGAACAGTGGTTTGGCAACAGATGGCATGAGGGATATCGC  1110
                                                                                      
Sbjct  666  --------------------------------------------------------------------------  665

Query 1111  CAAACACCCAGAGAAGACTCCCATTCGACAACAGGGACAGCTGCAGCCTCAGCTCATACCAGCCATCCAATGCA  1184
                                                                                      
Sbjct  666  --------------------------------------------------------------------------  665

Query 1185  AGGAAGGACAACACCAAGCCCAGAGGACAGTTCCTGGACTGATTTCTTCAACCCAATCTCACACCCCATGGGAC  1258
                                                                                      
Sbjct  666  --------------------------------------------------------------------------  665

Query 1259  GAGGTCATCAAGCAGGAAGAAGGATGGATATGGACTCCAGTCATAGTACAACGCTTCAGCCTACTGCAAATCCA  1332
                                                                                      
Sbjct  666  --------------------------------------------------------------------------  665

Query 1333  AACACAGGTTTGGTGGAAGATTTGGACAGGACAGGACCTCTTTCAATGACAACGCAGCAGAGTAATTCTCAGAG  1406
                                                                                      
Sbjct  666  --------------------------------------------------------------------------  665

Query 1407  CTTCTCTACATCACATGAAGGCTTGGAAGAAGATAAAGACCATCCAACAACTTCTACTCTGACATCAAGCAATA  1480
                                                                                 |||||
Sbjct  666  ---------------------------------------------------------------------CAATA  670

Query 1481  GGAATGATGTCACAGGTGGAAGAAGAGACCCAAATCATTCTGAAGGCTCAACTACTTTACTGGAAGGTTATACC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  GGAATGATGTCACAGGTGGAAGAAGAGACCCAAATCATTCTGAAGGCTCAACTACTTTACTGGAAGGTTATACC  744

Query 1555  TCTCATTACCCACACACGAAGGAAAGCAGGACCTTCATCCCAGTGACCTCAGCTAAGACTGGGTCCTTTGGAGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  TCTCATTACCCACACACGAAGGAAAGCAGGACCTTCATCCCAGTGACCTCAGCTAAGACTGGGTCCTTTGGAGT  818

Query 1629  TACTGCAGTTACTGTTGGAGATTCCAACTCTAATGTCAATCGTTCCTTATCAGGAGACCAAGACACATTCCACC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  TACTGCAGTTACTGTTGGAGATTCCAACTCTAATGTCAATCGTTCCTTATCAGGAGACCAAGACACATTCCACC  892

Query 1703  CCAGTGGGGGGTCCCATACCACTCATGGATCTGAATCAGATGGACACTCACATGGGAGTCAAGAAGGTGGAGCA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  CCAGTGGGGGGTCCCATACCACTCATGGATCTGAATCAGATGGACACTCACATGGGAGTCAAGAAGGTGGAGCA  966

Query 1777  AACACAACCTCTGGTCCTATAAGGACACCCCAAATTCCAGAATGGCTGATCATCTTGGCATCCCTCTTGGCCTT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  967  AACACAACCTCTGGTCCTATAAGGACACCCCAAATTCCAGAATGGCTGATCATCTTGGCATCCCTCTTGGCCTT  1040

Query 1851  GGCTTTGATTCTTGCAGTTTGCATTGCAGTCAACAGTCGAAGAAGGTGTGGGCAGAAGAAAAAGCTAGTGATCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  GGCTTTGATTCTTGCAGTTTGCATTGCAGTCAACAGTCGAAGAAGGTGTGGGCAGAAGAAAAAGCTAGTGATCA  1114

Query 1925  ACAGTGGCAATGGAGCTGTGGAGGACAGAAAGCCAAGTGGACTCAACGGAGAGGCCAGCAAGTCTCAGGAAATG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  ACAGTGGCAATGGAGCTGTGGAGGACAGAAAGCCAAGTGGACTCAACGGAGAGGCCAGCAAGTCTCAGGAAATG  1188

Query 1999  GTGCATTTGGTGAACAAGGAGTCGTCAGAAACTCCAGACCAGTTTATGACAGCTGATGAGACAAGGAACCTGCA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1189  GTGCATTTGGTGAACAAGGAGTCGTCAGAAACTCCAGACCAGTTTATGACAGCTGATGAGACAAGGAACCTGCA  1262

Query 2073  GAATGTGGACATGAAGATTGGGGTG  2097
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  GAATGTGGACATGAAGATTGGGGTG  1287