Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05963
• Subject: XM_017018583.2
• Aligned Length: 2229
• Identities: 1962
• Gaps: 264

Alignment

Query    1  ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGATTTGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACAAGTTTTGGTGGCACGCAGCCTGGGGACTCTGCCTCGTGCCGCTGAGCCTGGCGCAGATCGATTTGAA  74

Query   75  TATAACCTGCCGCTTTGCAGGTGTATTCCACGTGGAGAAAAATGGTCGCTACAGCATCTCTCGGACGGAGGCCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TATAACCTGCCGCTTTGCAGGTGTATTCCACGTGGAGAAAAATGGTCGCTACAGCATCTCTCGGACGGAGGCCG  148

Query  149  CTGACCTCTGCAAGGCTTTCAATAGCACCTTGCCCACAATGGCCCAGATGGAGAAAGCTCTGAGCATCGGATTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGACCTCTGCAAGGCTTTCAATAGCACCTTGCCCACAATGGCCCAGATGGAGAAAGCTCTGAGCATCGGATTT  222

Query  223  GAGACCTGCAGGTATGGGTTCATAGAAGGGCATGTGGTGATTCCCCGGATCCACCCCAACTCCATCTGTGCAGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAGACCTGCAGGTATGGGTTCATAGAAGGGCACGTGGTGATTCCCCGGATCCACCCCAACTCCATCTGTGCAGC  296

Query  297  AAACAACACAGGGGTGTACATCCTCACATCCAACACCTCCCAGTATGACACATATTGCTTCAATGCTTCAGCTC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAACAACACAGGGGTGTACATCCTCACATCCAACACCTCCCAGTATGACACATATTGCTTCAATGCTTCAGCTC  370

Query  371  CACCTGAAGAAGATTGTACATCAGTCACAGACCTGCCCAATGCCTTTGATGGACCAATTACCATAACTATTGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACCTGAAGAAGATTGTACATCAGTCACAGACCTGCCCAATGCCTTTGATGGACCAATTACCATAACTATTGTT  444

Query  445  AACCGTGATGGCACCCGCTATGTCCAGAAAGGAGAATACAGAACGAATCCTGAAGACATCTACCCCAGCAACCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACCGTGATGGCACCCGCTATGTCCAGAAAGGAGAATACAGAACGAATCCTGAAGACATCTACCCCAGCAACCC  518

Query  519  TACTGATGATGACGTGAGCAGCGGCTCCTCCAGTGAAAGGAGCAGCACTTCAGGAGGTTACATCTTTTACACCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TACTGATGATGACGTGAGCAGCGGCTCCTCCAGTGAAAGGAGCAGCACTTCAGGAGGTTACATCTTTTACACCT  592

Query  593  TTTCTACTGTACACCCCATCCCAGACGAAGACAGTCCCTGGATCACCGACAGCACAGACAGAATCCCTGCTACC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TTTCTACTGTACACCCCATCCCAGACGAAGACAGTCCCTGGATCACCGACAGCACAGACAGAATCCCTGCTACC  666

Query  667  A-------------------------------------------------------------------------  667
            |                                                                         
Sbjct  667  ACTTTGATGAGCACTAGTGCTACAGCAACTGAGACAGCAACCAAGAGGCAAGAAACCTGGGATTGGTTTTCATG  740

Query  668  --------------------------------------------------------GTACGTCTTCAAATACCA  685
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTTGTTTCTACCATCAGAGTCAAAGAATCATCTTCACACAACAACACAAATGGCTGGTACGTCTTCAAATACCA  814

Query  686  TCTCAGCAGGCTGGGAGCCAAATGAAGAAAATGAAGATGAAAGAGACAGACACCTCAGTTTTTCTGGATCAGGC  759
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TCTCAGCAGGCTGGGAGCCAAATGAAGAAAATGAAGATGAAAGAGACAGACACCTCAGTTTTTCTGGATCAGGC  888

Query  760  ATTGATGATGATGAAGATTTTATCTCCAGCACCATTTCAACCACACCACGGGCTTTTGACCACACAAAACAGAA  833
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGATGATGATGAAGATTTTATCTCCAGCACCATTTCAACCACACCACGGGCTTTTGACCACACAAAACAGAA  962

Query  834  CCAGGACTGGACCCAGTGGAACCCAAGCCATTCAAATCCGGAAGTGCTACTTCAGACAACCACAAGGATGACT-  906
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  963  CCAGGACTGGACCCAGTGGAACCCAAGCCATTCAAATCCGGAAGTGCTACTTCAGACAACCACAAGGATGACTG  1036

Query  907  --GATGTAGACAGAAATGGCACCACTGCTTATGAAGGAAACTGGAACCCAGAAGCACACCCTCCCCTCATTCAC  978
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGATGTAGACAGAAATGGCACCACTGCTTATGAAGGAAACTGGAACCCAGAAGCACACCCTCCCCTCATTCAC  1110

Query  979  CATGAGCATCATGAGGAAGAAGAGACCCCACATTCTACAAGCACAATCCAGGCAACTCCTAGTAGTACAACGGA  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CATGAGCATCATGAGGAAGAAGAGACCCCACATTCTACAAGCACAATCCAGGCAACTCCTAGTAGTACAACGGA  1184

Query 1053  AGAAACAGCTACCCAGAAGGAACAGTGGTTTGGCAACAGATGGCATGAGGGATATCGCCAAACACCCAGAGAAG  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1185  AGAAACAGCTACCCAGAAGGAACAGTGGTTTGGCAACAGATGGCATGAGGGATATCGCCAAACACCCAAAGAAG  1258

Query 1127  ACTCCCATTCGACAACAGGGACAGCTGCAGCCTCAGCTCATACCAGCCATCCAATGCAAGGAAGGACAACACCA  1200
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct 1259  ACTCCCATTCGACAACAGGGACAGCT------------------------------------------------  1284

Query 1201  AGCCCAGAGGACAGTTCCTGGACTGATTTCTTCAACCCAATCTCACACCCCATGGGACGAGGTCATCAAGCAGG  1274
                                                                                      
Sbjct 1285  --------------------------------------------------------------------------  1284

Query 1275  AAGAAGGATGGATATGGACTCCAGTCATAGTACAACGCTTCAGCCTACTGCAAATCCAAACACAGGTTTGGTGG  1348
                      ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  ----------GATATGGACTCCAGTCATAGTATAACGCTTCAGCCTACTGCAAATCCAAACACAGGTTTGGTGG  1348

Query 1349  AAGATTTGGACAGGACAGGACCTCTTTCAATGACAACGCAGCAGAGTAATTCTCAGAGCTTCTCTACATCACAT  1422
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349  AAGATTTGGACAGGACAGGACCTCTTTCAATGACAACGCAGCAGAGTAATTCTCAGAGCTTCTCTACATCACAT  1422

Query 1423  GAAGGCTTGGAAGAAGATAAAGACCATCCAACAACTTCTACTCTGACATCAAGCAATAGGAATGATGTCACAGG  1496
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423  GAAGGCTTGGAAGAAGATAAAGACCATCCAACAACTTCTACTCTGACATCAAGCAATAGGAATGATGTCACAGG  1496

Query 1497  TGGAAGAAGAGACCCAAATCATTCTGAAGGCTCAACTACTTTACTGGAAGGTTATACCTCTCATTACCCACACA  1570
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497  TGGAAGAAGAGACCCAAATCATTCTGAAGGCTCAACTACTTTACTGGAAGGTTATACCTCTCATTACCCACACA  1570

Query 1571  CGAAGGAAAGCAGGACCTTCATCCCAGTGACCTCAGCTAAGACTGGGTCCTTTGGAGTTACTGCAGTTACTGTT  1644
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571  CGAAGGAAAGCAGGACCTTCATCCCAGTGACCTCAGCTAAGACTGGGTCCTTTGGAGTTACTGCAGTTACTGTT  1644

Query 1645  GGAGATTCCAACTCTAATGTCAATCGTTCCTTATCAGGAGACCAAGACACATTCCACCCCAGTGGGGGGTCCCA  1718
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1645  GGAGATTCCAACTCTAATGTCAATCGTTCCTTATCAGGAGACCAAGACACATTCCACCCCAGTGGGGGGTCCCA  1718

Query 1719  TACCACTCATGGATCTGAATCAGATGGACACTCACATGGGAGTCAAGAAGGTGGAGCAAACACAACCTCTGGTC  1792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1719  TACCACTCATGGATCTGAATCAGATGGACACTCACATGGGAGTCAAGAAGGTGGAGCAAACACAACCTCTGGTC  1792

Query 1793  CTATAAGGACACCCCAAATTCCAGAATGGCTGATCATCTTGGCATCCCTCTTGGCCTTGGCTTTGATTCTTGCA  1866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793  CTATAAGGACACCCCAAATTCCAGAATGGCTGATCATCTTGGCATCCCTCTTGGCCTTGGCTTTGATTCTTGCA  1866

Query 1867  GTTTGCATTGCAGTCAACAGTCGAAGAAGGTGTGGGCAGAAGAAAAAGCTAGTGATCAACAGTGGCAATGGAGC  1940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867  GTTTGCATTGCAGTCAACAGTCGAAGAAGGTGTGGGCAGAAGAAAAAGCTAGTGATCAACAGTGGCAATGGAGC  1940

Query 1941  TGTGGAGGACAGAAAGCCAAGTGGACTCAACGGAGAGGCCAGCAAGTCTCAGGAAATGGTGCATTTGGTGAACA  2014
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941  TGTGGAGGACAGAAAGCCAAGTGGACTCAACGGAGAGGCCAGCAAGTCTCAGGAAATGGTGCATTTGGTGAACA  2014

Query 2015  AGGAGTCGTCAGAAACTCCAGACCAGTTTATGACAGCTGATGAGACAAGGAACCTGCAGAATGTGGACATGAAG  2088
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015  AGGAGTCGTCAGAAACTCCAGACCAGTTTATGACAGCTGATGAGACAAGGAACCTGCAGAATGTGGACATGAAG  2088

Query 2089  ATTGGGGTG  2097
            |||||||||
Sbjct 2089  ATTGGGGTG  2097