Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_05974
- Subject:
- XM_005255760.4
- Aligned Length:
- 2405
- Identities:
- 2121
- Gaps:
- 280
Alignment
Query 1 ATGCCAGAACGGCTAGCGGAAATGCTCTTGGATCTCTGGACTCCATTAATAATATTATGGATTACTCTTCCCCC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCAGAACGGCTAGCGGAAATGCTCTTGGATCTCTGGACTCCATTAATAATATTATGGATTACTCTTCCCCC 74
Query 75 TTGCATTTACATGGCTCCGATGAATCAGTCTCAAGTTTTAATGAGTGGATCCCCTTTGGAACTAAACAGTCTGG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TTGCATTTACATGGCTCCGATGAATCAGTCTCAAGTTTTAATGAGTGGATCCCCTTTGGAACTAAACAGTCTGG 148
Query 149 GTGAAGAACAGCGAATTTTGAACCGCTCCAAAAGAGGCTGGGTTTGGAATCAAATGTTTGTCCTGGAAGAGTTT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GTGAAGAACAGCGAATTTTGAACCGCTCCAAAAGAGGCTGGGTTTGGAATCAAATGTTTGTCCTGGAAGAGTTT 222
Query 223 TCTGGACCTGAACCGATTCTTGTTGGCCGGCTACACACAGACCTGGATCCTGGGAGCAAAAAAATCAAGTATAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCTGGACCTGAACCGATTCTTGTTGGCCGGCTACACACAGACCTGGATCCTGGGAGCAAAAAAATCAAGTATAT 296
Query 297 CCTATCAGGTGATGGAGCTGGGACCATATTTCAAATAAATGATGTAACTGGAGATATCCATGCTATAAAAAGAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTATCAGGTGATGGAGCTGGGACCATATTTCAAATAAATGATGTAACTGGAGATATCCATGCTATAAAAAGAC 370
Query 371 TTGACCGGGAGGAAAAGGCTGAGTATACCCTAACAGCTCAAGCAGTGGACTGGGAGACAAGCAAACCTCTGGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TTGACCGGGAGGAAAAGGCTGAGTATACCCTAACAGCTCAAGCAGTGGACTGGGAGACAAGCAAACCTCTGGAG 444
Query 445 CCTCCTTCTGAATTTATTATTAAAGTTCAAGACATCAATGACAATGCACCAGAGTTTCTTAATGGACCCTATCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTCCTTCTGAATTTATTATTAAAGTTCAAGACATCAATGACAATGCACCAGAGTTTCTTAATGGACCCTATCA 518
Query 519 TGCTACTGTGCCAGAAATGTCCATTTTGGGTACATCTGTCACTAACGTCACTGCGACCGACGCTGATGACCCAG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCTACTGTGCCAGAAATGTCCATTTTGGGTACATCTGTCACTAACGTCACTGCGACCGACGCTGATGACCCAG 592
Query 593 TTTATGGAAACAGTGCAAAGTTGGTTTATAGTATATTGGAAGGGCAGCCTTATTTTTCCATTGAGCCTGAAACA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTATGGAAACAGTGCAAAGTTGGTTTATAGTATATTGGAAGGGCAGCCTTATTTTTCCATTGAGCCTGAAACA 666
Query 667 GCTATTATAAAAACTGCCCTTCCCAACATGGACAGAGAAGCCAAGGAGGAGTACCTGGTTGTTATCCAAGCCAA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTATTATAAAAACTGCCCTTCCCAACATGGACAGAGAAGCCAAGGAGGAGTACCTGGTTGTTATCCAAGCCAA 740
Query 741 AGATATGGGTGGACACTCTGGTGGCCTGTCTGGGACCACGACACTTACAGTGACTCTTACTGATGTTAATGACA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGATATGGGTGGACACTCTGGTGGCCTGTCTGGGACCACGACACTTACAGTGACTCTTACTGATGTTAATGACA 814
Query 815 ATCCTCCAAAATTTGCACAGAGCCTGTATCACTTCTCAGTACCGGAAGATGTGGTTCTTGGCACTGCAATAGGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATCCTCCAAAATTTGCACAGAGCCTGTATCACTTCTCAGTACCGGAAGATGTGGTTCTTGGCACTGCAATAGGA 888
Query 889 AGGGTGAAGGCCAATGATCAGGATATTGGTGAAAATGCACAGTCATCATATGATATCATCGATGGAGATGGAAC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AGGGTGAAGGCCAATGATCAGGATATTGGTGAAAATGCACAGTCATCATATGATATCATCGATGGAGATGGAAC 962
Query 963 AGCACTTTTTGAAATCACTTCTGATGCCCAGGCCCAGGATGGCATTATAAGGCTAAGAAAACCTCTGGACTTTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGCACTTTTTGAAATCACTTCTGATGCCCAGGCCCAGGATGGCATTATAAGGCTAAGAAAACCTCTGGACTTTG 1036
Query 1037 AGACCAAAAAATCCTATACGCTAAAGGTAGAGGCAGCCAATGTCCATATTGACCCACGCTTCAGTGGCAGGGGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGACCAAAAAATCCTATACGCTAAAGGTAGAGGCAGCCAATGTCCATATTGACCCACGCTTCAGTGGCAGGGGG 1110
Query 1111 CCCTTTAAAGACACGGCGACAGTCAAAATCGTGGTTGAAGATGCTGATGAGCCTCCGGTCTTCTCTTCACCGAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCCTTTAAAGACACGGCGACAGTCAAAATCGTGGTTGAAGATGCTGATGAGCCTCCGGTCTTCTCTTCACCGAC 1184
Query 1185 TTACCTACTTGAAGTTCATGAAAATGCTGCTCTAAACTCCGTGATTGGGCAAGTGACTGCTCGTGACCCTGATA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTACCTACTTGAAGTTCATGAAAATGCTGCTCTAAACTCCGTGATTGGGCAAGTGACTGCTCGTGACCCTGATA 1258
Query 1259 TCACTTCCAGTCCTATAAGGTTTTCCATCGACCGGCACACTGACCTGGAGAGGCAGTTCAACATTAATGCAGAC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCACTTCCAGTCCTATAAGGTTTTCCATCGACCGGCACACTGACCTGGAGAGGCAGTTCAACATTAATGCAGAC 1332
Query 1333 GATGGGAAGATAACGCTGGCAACACCACTTGACAGAGAATTAAGTGTATGGCACAACATAACAATCATTGCTAC 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATGGGAAGATAACGCTGGCAACACCACTTGACAGAGAATTAAGTGTATGGCACAACATAACAATCATTGCTAC 1406
Query 1407 TGAAATTAGGAACCACAGTCAGATATCACGAGTACCTGTTGCTATTAAAGTGCTGGATGTCAATGACAACGCCC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGAAATTAGGAACCACAGTCAGATATCACGAGTACCTGTTGCTATTAAAGTGCTGGATGTCAATGACAACGCCC 1480
Query 1481 CTGAATTCGCATCCGAATATGAGGCATTTTTATGTGAAAATGGAAAACCCGGCCAAGTCATTCAAACTGTTAGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CTGAATTCGCATCCGAATATGAGGCATTTTTATGTGAAAATGGAAAACCCGGCCAAGTCATTCAAACTGTTAGC 1554
Query 1555 GCCATGGACAAAGATGATCCCAAAAACGGACATTATTTCTTATACAGTCTCCTTCCAGAAATGGTCAACAATCC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GCCATGGACAAAGATGATCCCAAAAACGGACATTATTTCTTATACAGTCTCCTTCCAGAAATGGTCAACAATCC 1628
Query 1629 GAATTTCACCATCAAGAAAAATGAAGATAATTCCCTCAGTATTTTGGCAAAGCATAATGGATTCAACCGCCAGA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAATTTCACCATCAAGAAAAATGAAGATAATTCCCTCAGTATTTTGGCAAAGCATAATGGATTCAACCGCCAGA 1702
Query 1703 AGCAAGAAGTCTATCTTTTACCAATCATAATCAGTGATAGTGGAAATCCTCCACTGAGCAGCACTAGCACCTTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGCAAGAAGTCTATCTTTTACCAATCATAATCAGTGATAGTGGAAATCCTCCACTGAGCAGCACTAGCACCTTG 1776
Query 1777 ACAATCAGGGTCTGTGGCTGCAGCAATGACGGTGTCGTCCAGTCTTGCAATGTCGAAGCTTATGTCCTTCCAAT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ACAATCAGGGTCTGTGGCTGCAGCAATGACGGTGTCGTCCAGTCTTGCAATGTCGAAGCTTATGTCCTTCCAAT 1850
Query 1851 TGGACTCAGTATGGGCGCCTTAATTGCCATATTAGCATGCATCATTTTGCTGTTAGTCATCGTGGTGCTGTTTG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGGACTCAGTATGGGCGCCTTAATTGCCATATTAGCATGCATCATTTTGCTGTTAGTCATCGTGGTGCTGTTTG 1924
Query 1925 TAACTCTACGGCGGCATAAAAATGAACCATTAATTATCAAAGATGATGAAGACGTTCGAGAAAACATCATTCGC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TAACTCTACGGCGGCATAAAAATGAACCATTAATTATCAAAGATGATGAAGACGTTCGAGAAAACATCATTCGC 1998
Query 1999 TACGATGATGAAGGAGGAGGGGAGGAGGACACAGAGGCTTTTGACATTGCAACTTTACAAAATCCAGATGGAAT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 TACGATGATGAAGGAGGAGGGGAGGAGGACACAGAGGCTTTTGACATTGCAACTTTACAAAATCCAGATGGAAT 2072
Query 2073 TAATGGATTTTTACCCCGTAAGGATATTAAACCAGATTTGCAGTTTATGCCAAGGCAAGGGCTTGCTCCAG--- 2143
||||||||||||||||| |||| |||| || |||| ||||| ||
Sbjct 2073 TAATGGATTTTTACCCC--------ATTA---CAGA-----AG--------------AGGG-TTGCT--AGGAG 2113
Query 2144 -----TTCCAAATGGTGTTGATGTCGATGAATTTATAAATGTAAGGCTGCATGAGGCAGATAATGATCCCACAG 2212
|..||| |.||.||||
Sbjct 2114 GAATATCACAA-----GATGCTGTC------------------------------------------------- 2133
Query 2213 CCCCGCCATATGACTCCATTCAGATATATGGCTATGAAGGCCGAGGGTCAGTGGCTGGCTCCCTCAGCTCCTTG 2286
Sbjct 2134 -------------------------------------------------------------------------- 2133
Query 2287 GAGTCCACCACATCAGACTCAGACCAGAATTTTGACTACCTCAGTGACTGGGGTCCCCGCTTTAAGAGACTGGG 2360
Sbjct 2134 -------------------------------------------------------------------------- 2133
Query 2361 CGAACTCTACTCTGTTGGTGAAAGTGACAAAGAAACT 2397
Sbjct 2134 ------------------------------------- 2133