Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05974
• Subject: XM_006530631.2
• Aligned Length: 2398
• Identities: 2191
• Gaps: 2

Alignment

Query    1  ATGCCAGAACGGCTAGCGGAAATGCTCTTGGATCTCTGGACTCCATTAATAATATTATGGATTACTCTTCCCCC  74
            |||||||||.|||||||.||.|.||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..|
Sbjct    1  ATGCCAGAAAGGCTAGCTGAGACGCTCATGGACCTCTGGACTCCATTAATAATATTATGGATTACCCTCCCTTC  74

Query   75  TTGCATTTACATGGCTCCGATGAATCAGTCTCAAGTTTTAATGAGTGGATCCCCTTTGGAACTAAACAGTCTGG  148
            |||..|.||||.||||||||||||||||.||||.|||||||..|.||||||||||||||||||||.|||.|.|.
Sbjct   75  TTGTGTATACACGGCTCCGATGAATCAGGCTCACGTTTTAACTACTGGATCCCCTTTGGAACTAAGCAGGCAGA  148

Query  149  GTGAAGAACA-GCGAATTTTGAACCGCTCCAAAAGAGGCTGGGTTTGGAATCAAATGTTTGTCCTGGAAGAGTT  221
            |||||| ||| |||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  149  GTGAAG-ACATGCGGATTTTGAGCCGCTCCAAAAGAGGCTGGGTTTGGAATCAAATGTTTGTCCTGGAAGAATT  221

Query  222  TTCTGGACCTGAACCGATTCTTGTTGGCCGGCTACACACAGACCTGGATCCTGGGAGCAAAAAAATCAAGTATA  295
            |||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  222  TTCTGGACCTGAACCGATTCTCGTTGGCCGGTTACACACAGATCTGGATCCTGGAAGCAAAAAAATCAAGTATA  295

Query  296  TCCTATCAGGTGATGGAGCTGGGACCATATTTCAAATAAATGATGTAACTGGAGATATCCATGCTATAAAAAGA  369
            |||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  296  TCCTATCGGGTGATGGAGCTGGCACAATCTTTCAAATAAATGATATAACTGGAGATATCCATGCTATCAAAAGA  369

Query  370  CTTGACCGGGAGGAAAAGGCTGAGTATACCCTAACAGCTCAAGCAGTGGACTGGGAGACAAGCAAACCTCTGGA  443
            ||||||||.||||||||||||||.|||||..||||.|||||.||||||||||..|||||||.|||.||.||.||
Sbjct  370  CTTGACCGAGAGGAAAAGGCTGAATATACGTTAACGGCTCAGGCAGTGGACTTTGAGACAAACAAGCCCCTTGA  443

Query  444  GCCTCCTTCTGAATTTATTATTAAAGTTCAAGACATCAATGACAATGCACCAGAGTTTCTTAATGGACCCTATC  517
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||
Sbjct  444  GCCTCCTTCTGAATTTATTATTAAGGTTCAAGATATCAACGACAATGCACCTGAGTTCCTCAATGGACCTTATC  517

Query  518  ATGCTACTGTGCCAGAAATGTCCATTTTGGGTACATCTGTCACTAACGTCACTGCGACCGACGCTGATGACCCA  591
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||||||
Sbjct  518  ATGCTACTGTTCCAGAGATGTCCATTTTGGGTACATCTGTCACTAATGTAACTGCCACTGATGCTGACGACCCA  591

Query  592  GTTTATGGAAACAGTGCAAAGTTGGTTTATAGTATATTGGAAGGGCAGCCTTATTTTTCCATTGAGCCTGAAAC  665
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  GTTTATGGAAACAGTGCAAAGTTGGTTTACAGTATCTTGGAGGGACAGCCGTATTTTTCCATTGAGCCTGAAAC  665

Query  666  AGCTATTATAAAAACTGCCCTTCCCAACATGGACAGAGAAGCCAAGGAGGAGTACCTGGTTGTTATCCAAGCCA  739
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct  666  AGCCATTATAAAAACTGCCCTTCCTAACATGGACAGAGAAGCCAAGGAGGAATACCTGGTCGTAATACAAGCCA  739

Query  740  AAGATATGGGTGGACACTCTGGTGGCCTGTCTGGGACCACGACACTTACAGTGACTCTTACTGATGTTAATGAC  813
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct  740  AAGATATGGGTGGACACTCTGGTGGTCTGTCTGGAACCACAACACTCACAGTGACCCTGACTGATGTTAATGAC  813

Query  814  AATCCTCCAAAATTTGCACAGAGCCTGTATCACTTCTCAGTACCGGAAGATGTGGTTCTTGGCACTGCAATAGG  887
            |||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct  814  AATCCTCCAAAATTTGCTCAGAGTTTGTATCACTTCTCAGTACCAGAAGATGTGGTCCTTGGCACTGCGATAGG  887

Query  888  AAGGGTGAAGGCCAATGATCAGGATATTGGTGAAAATGCACAGTCATCATATGATATCATCGATGGAGATGGAA  961
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||.|
Sbjct  888  AAGGGTTAAGGCTAATGATCAGGATATTGGTGAAAATGCACAATCATCCTATGACATCATTGATGGAGATGGGA  961

Query  962  CAGCACTTTTTGAAATCACTTCTGATGCCCAGGCCCAGGATGGCATTATAAGGCTAAGAAAACCTCTGGACTTT  1035
            |||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  962  CAGCACTATTCGAAATCACTTCTGATGCCCAGGCCCAGGATGGTGTTATAAGACTGAGAAAGCCTCTGGACTTT  1035

Query 1036  GAGACCAAAAAATCCTATACGCTAAAGGTAGAGGCAGCCAATGTCCATATTGACCCACGCTTCAGTGGCAGGGG  1109
            ||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 1036  GAGACCAAAAAATCCTATACTCTGAAGGTGGAAGCAGCCAATATCCACATCGACCCACGTTTCAGTAGCAGGGG  1109

Query 1110  GCCCTTTAAAGACACGGCGACAGTCAAAATCGTGGTTGAAGATGCTGATGAGCCTCCGGTCTTCTCTTCACCGA  1183
            .||||||||.||.||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1110  ACCCTTTAAGGATACAGCAACAGTCAAAATTGTCGTAGAGGATGCTGATGAGCCTCCGGTCTTCTCTTCACCAA  1183

Query 1184  CTTACCTACTTGAAGTTCATGAAAATGCTGCTCTAAACTCCGTGATTGGGCAAGTGACTGCTCGTGACCCTGAT  1257
            |||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1184  CTTACCTCCTTGAAGTTCATGAAAATGCTGCTTTGAACTCTGTGATTGGCCAAGTGACAGCTCGTGACCCTGAT  1257

Query 1258  ATCACTTCCAGTCCTATAAGGTTTTCCATCGACCGGCACACTGACCTGGAGAGGCAGTTCAACATTAATGCAGA  1331
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1258  ATCACTTCCAGTCCAATAAGGTTTTCCATTGACCGCCACACTGACCTGGAAAGACAGTTCAACATCAATGCAGA  1331

Query 1332  CGATGGGAAGATAACGCTGGCAACACCACTTGACAGAGAATTAAGTGTATGGCACAACATAACAATCATTGCTA  1405
            .||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.|||||||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1332  TGATGGGAAGATAACACTGGCAACTCCACTGGACAGAGAACTAAGTGTTTGGCACAACATCACCATCATTGCTA  1405

Query 1406  CTGAAATTAGGAACCACAGTCAGATATCACGAGTACCTGTTGCTATTAAAGTGCTGGATGTCAATGACAACGCC  1479
            ||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  CTGAGATCAGGAACCACAGTCAGATATCTCGAGTGCCTGTTGCTATTAAAGTGCTGGATGTCAATGACAACGCC  1479

Query 1480  CCTGAATTCGCATCCGAATATGAGGCATTTTTATGTGAAAATGGAAAACCCGGCCAAGTCATTCAAACTGTTAG  1553
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 1480  CCTGAATTCGCATCCGAATATGAGGCATTTTTATGTGAAAATGGAAAACCCGGCCAAGTCATTCAAACAGTAAG  1553

Query 1554  CGCCATGGACAAAGATGATCCCAAAAACGGACATTATTTCTTATACAGTCTCCTTCCAGAAATGGTCAACAATC  1627
            .||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1554  TGCCATGGACAAAGACGATCCCAAAAACGGACATTTTTTCTTGTACAGTCTTCTTCCAGAAATGGTCAACAACC  1627

Query 1628  CGAATTTCACCATCAAGAAAAATGAAGATAATTCCCTCAGTATTTTGGCAAAGCATAATGGATTCAACCGCCAG  1701
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  CAAATTTCACCATCAAGAAAAATGAAGATAATTCCCTGAGCATTCTGGCAAAACATAATGGATTCAACCGCCAG  1701

Query 1702  AAGCAAGAAGTCTATCTTTTACCAATCATAATCAGTGATAGTGGAAATCCTCCACTGAGCAGCACTAGCACCTT  1775
            ||||||||||||||.|||.|.||.||..|.||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1702  AAGCAAGAAGTCTACCTTCTGCCTATAGTGATCAGTGACAGTGGAAACCCCCCTCTGAGTAGCACCAGTACGTT  1775

Query 1776  GACAATCAGGGTCTGTGGCTGCAGCAATGACGGTGTCGTCCAGTCTTGCAATGTCGAAGCTTATGTCCTTCCAA  1849
            |||.|||.|.|||||||||||.||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1776  GACCATCCGAGTCTGTGGCTGTAGCAATGATGGCGTGGTCCAGTCGTGCAATGTTGAAGCTTATGTCCTTCCTA  1849

Query 1850  TTGGACTCAGTATGGGCGCCTTAATTGCCATATTAGCATGCATCATTTTGCTGTTAGTCATCGTGGTGCTGTTT  1923
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1850  TTGGACTCAGTATGGGCGCCTTAATTGCTATATTAGCATGCATCATTTTGCTGCTCGTCATTGTGGTTCTGTTT  1923

Query 1924  GTAACTCTACGGCGGCATAAAAATGAACCATTAATTATCAAAGATGATGAAGACGTTCGAGAAAACATCATTCG  1997
            ||.||.||..||.||||.||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1924  GTTACCCTGAGGAGGCACAAAAATGAACCACTTATTATCAAAGATGACGAAGACGTTCGAGAAAACATCATTCG  1997

Query 1998  CTACGATGATGAAGGAGGAGGGGAGGAGGACACAGAGGCTTTTGACATTGCAACTTTACAAAATCCAGATGGAA  2071
            ||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1998  CTACGACGACGAAGGAGGAGGGGAGGAGGACACAGAGGCTTTTGACATTGCAACTTTGCAAAACCCAGATGGAA  2071

Query 2072  TTAATGGATTTTTACCCCGTAAGGATATTAAACCAGATTTGCAGTTTATGCCAAGGCAAGGGCTTGCTCCAGTT  2145
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2072  TTAATGGATTTTTACCCCGTAAGGATATTAAACCAGATTTGCAGTTTATGCCAAGGCAAGGGCTTGCTCCAGTT  2145

Query 2146  CCAAATGGTGTTGATGTCGATGAATTTATAAATGTAAGGCTGCATGAGGCAGATAATGATCCCACAGCCCCGCC  2219
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 2146  CCAAATGGTGTTGATGTCGATGAATTTATAAATGTAAGGCTGCATGAGGCAGATAATGACCCCACGGCCCCACC  2219

Query 2220  ATATGACTCCATTCAGATATATGGCTATGAAGGCCGAGGGTCAGTGGCTGGCTCCCTCAGCTCCTTGGAGTCCA  2293
            ||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2220  ATATGACTCCATACAGATTTATGGCTATGAAGGCCGAGGGTCTGTGGCTGGCTCCCTCAGCTCCTTGGAGTCCA  2293

Query 2294  CCACATCAGACTCAGACCAGAATTTTGACTACCTCAGTGACTGGGGTCCCCGCTTTAAGAGACTGGGCGAACTC  2367
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2294  CCACATCAGACTCAGACCAGAATTTTGACTACCTCAGTGACTGGGGTCCCCGCTTTAAGAGACTGGGCGAACTC  2367

Query 2368  TACTCTGTTGGTGAAAGTGACAAAGAAACT  2397
            ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368  TACTCTGTTGGTGAAAGTGACAAAGAAACT  2397