Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05975
• Subject: XM_006520019.3
• Aligned Length: 2368
• Identities: 2047
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  ATGAGGACTTACCATTGTATACCATTATTCATCTGGACCTATATGTTCCATACAGTTGACACCATCCTATTACA  74
            ||||||||||||..||||.|.|.|.|..||||||||||.|..||.|||||||..|||||||.||.|..||||||
Sbjct    1  ATGAGGACTTACAGTTGTCTTCAACTGGTCATCTGGACTTGCATTTTCCATATGGTTGACAACAGCACATTACA  74

Query   75  AGAAAAACCTAACAGTTATTTATCAAGCAAAAAGATAGTGGGTCTGACAAAAGATGACGGTAAAATGCTACGTC  148
            ||.|||...||.||||.|.||....||   ||.|||||||..|||||.|||.|||||.|||||||||||.|.||
Sbjct   75  AGGAAAGGATAGCAGTCACTTCCTGAG---AAGGATAGTGAATCTGAAAAAGGATGAGGGTAAAATGCTCCATC  145

Query  149  GCACCAAGCGTGGCTGGATGTGGAATCAGTTCTTCTTATTGGAAGAGTACACAGGTACTGACACACAATATGTA  222
            |..||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||||
Sbjct  146  GTGCCAAGCGTGGCTGGATGTGGAATCAGTTCTTCCTCTTAGAAGAGTATACAGGTACAGACACTCAGTATGTA  219

Query  223  GGCAAGCTTCACACTGACCAAGATAAAGGAGATGGAAATTTAAAATACATACTAACAGGAGATGGGGCTGGCAG  296
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||||||||.|||||||.
Sbjct  220  GGAAAGCTTCACACTGACCAAGATAAAGGAGATGGAAATTTAAAATACATTTTGACAGGAGATGGAGCTGGCAA  293

Query  297  TCTATTTGTTATAGATGAAAATACAGGAGACATTCATGCTGCAAAGAAACTAGACAGAGAAGAAAAATCTCTGT  370
            |||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  TCTGTTTGTTATAGATGAAAATACAGGAGATATTCACGCTGCAAAGAGACTAGACAGAGAAGAAAAATCTCTGT  367

Query  371  ACATTCTTCGTGCCAAGGCTATAGACAGAAAAACTGGGCGGCAGGTGGAACCGGAATCGGAATTTATCATTAAA  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  368  ACATTCTTCGTGCCAAGGCTATAGACAGAAAGACCGGACGACAAGTGGAGCCAGAATCTGAGTTTATCATTAAA  441

Query  445  ATACATGATATCAATGACAATGAGCCAAAATTTACAAAAGACTTATACACTGCCAGTGTTCCTGAAATGTCTGG  518
            ||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  ATCCATGATATTAATGACAATGAACCAAAATTCACGAAAGACCTGTACACAGCCAGTGTTCCTGAAATGTCTGG  515

Query  519  AGTCGGTACATCTGTTATACAAGTAACTGCAACAGATGCAGATGACGCCAACTATGGAAATAGTGCCAAAGTGG  592
            |||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct  516  AGTTGGTACGTCTGTTATACAAGTAACTGCCACCGATGCAGATGATGCTAACTATGGGAACAGTGCTAAAGTGG  589

Query  593  TCTATAGCATATTGCAAGGACAGCCATATTTTTCAGTGGACCCAGAATCAGGCATAATAAAAACTGCATTACCA  666
            ||||.|||||..|||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  590  TCTACAGCATTCTGCAAGGGCAGCCATACTTTTCAGTGGACCCGGAATCAGGCATAATAAAGACTGCATTGCCA  663

Query  667  GACATGAGCAGAGAAAATAGAGAGCAGTACCAGGTTGTTATACAGGCCAAAGACATGGGTGGCCAGATGGGAGG  740
            |||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  GACATGAGCAGAGAAAACAAAGAGCAGTACCAAGTTGTTATTCAGGCTAAGGACATGGGTGGCCAGATGGGAGG  737

Query  741  CCTTTCTGGAACCACCACAGTGAACATCACGCTGACAGATGTCAACAACAACCCTCCTCGATTTCCCCAGAGTA  814
            |||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct  738  CCTCTCTGGCACCACCACAGTGAACATCACCCTAACAGATGTCAACAACAACCCTCCTCGGTTCCCACAGAGCA  811

Query  815  CGTATCAATTTAATTCTCCTGAGTCTGTACCTCTTGGAACTCATCTTGGAAGGATAAAAGCCAATGACCCTGAC  888
            |.|||||.||||||||||..|||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  812  CTTATCAGTTTAATTCTCTGGAGTCGGCACCTCTTGGAACTCATCTTGGAAGGATAAAAGCCAATGACCCAGAC  885

Query  889  GTGGGGGAAAATGCAGAAATGGAGTATAGCATTGCTGAAGGAGATGGTGCAGACATGTTCGATGTCATCACTGA  962
            .|||||||.||.||.||..||||.|||||||||||.||||||||.||..||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  886  ATGGGGGAGAACGCCGAGCTGGAATATAGCATTGCAGAAGGAGAAGGATCAGACATGTTTGATGTGATCACTGA  959

Query  963  CAAGGATACACAGGAAGGGATTATAACTGTCAAACAGAATTTAGATTTTGAAAATCAAATGCTCTATACTTTAA  1036
            |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.|.||.|||||||
Sbjct  960  CAAAGATACACAGGAAGGGATCATAACTGTCAAACAGAATTTAGATTTTGAAAAGAAAATGTTGTACACTTTAA  1033

Query 1037  GAGTGGATGCAAGTAACACTCACCCTGATCCACGATTCTTACACCTGGGACCTTTCAAAGATACAGCTGTGGTC  1110
            ||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||..||||..||||.
Sbjct 1034  GAGTGGATGCAAGTAATACCCACCCTGATCCTCGATTCTTACACCTTGGACCTTTCAAAGACTCAGCCATGGTT  1107

Query 1111  AAAATATCTGTGGAAGATATAGATGAGCCTCCTGTGTTCACTAAAGTCTCTTACTTGATAGAAGTAGATGAAGA  1184
            ||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||||.|||..|||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1108  AAGATATCTGTGGAAGATGTAGATGAGCCCCCTGTGTTCAGTAAGCTCTCTTACTTGATGGAAGTTGATGAAGA  1181

Query 1185  TGTAAAGGAGGGCAGTATCATTGGACAGGTTACAGCATACGATCCAGATGCCAGGAACAATTTAATAAAGTACT  1258
            |||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||.||||||..|||||||.||||
Sbjct 1182  TGTGAAGGAGGGGAGCATCATCGGACAAGTCACAGCATATGACCCAGATGCCATGAACAACATAATAAAATACT  1255

Query 1259  CTGTTGATCGGCATACTGATATGGACCGTATTTTTGGTATTCACTCAGAAAATGGTTCTATTTTCACTTTGAAA  1332
            ||||.||.||.|||||||||||||||||..||||..|||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct 1256  CTGTGGACCGCCATACTGATATGGACCGAGTTTTCAGTATTCACTCAGAAAATGGTTCTATCTTCACTCTGAAA  1329

Query 1333  GCCCTTGACCGGGAATCATCTCCTTGGCATAACATCACTGTTACAGCCACAGAAATAAATAACCCAAAACAAAG  1406
            .||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  CCCCTGGATCGGGAATCATCCCCTTGGCATAACATCACCATTACAGCCACAGAGATAAATAACCCAAAACAAAG  1403

Query 1407  TAGCCACATCCCTGTCTTCATCAGAATTCTAGATATAAATGACCATGCTCCGGAATTTGCCATGTATTATGAAA  1480
            ||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||..||.|||||||
Sbjct 1404  TAGCCAAATTCCTGTCTTCATCAGAATCCTTGATATAAATGATCATGCTCCAGAATTTGCCACTTACTATGAAA  1477

Query 1481  CATTTGTTTGTGAAAATGCAAAACCTGGGCAGTTGATTCAGACTGTCAGTGTCATGGATAAGGATGACCCTCCC  1554
            ||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||.||.|||||.|||||.
Sbjct 1478  CATTTGTTTGTGAAAATGCAAAGTCTGGCCAGTTGATTCAAACTATAAGTGTCATGGACAAAGATGATCCTCCT  1551

Query 1555  CGAGGTCACAAATTCTTTTTTGAACCAGTGCCAGAATTTACTCTCAATCCGAATTTCACCATTGTAGATAATAA  1628
            |||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 1552  CGAGGACACAAGTTCTTCTTTGAGCCAGTGCCAGAATTTCCTCTAAACCCAAACTTCACAATTGTAGACAATAA  1625

Query 1629  AGATAATACAGCAGGAATCATGACTCGGAAAGATGGCTACAGTCGCAACAAAATGAGCACCTACTTATTGCCGA  1702
            ||||||||||||||||||..|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||.|||||||.||.|||||.
Sbjct 1626  AGATAATACAGCAGGAATTGTAACTCGAAAAGATGGGTACAGCCGCAACAAAATGAACACCTACCTACTGCCGG  1699

Query 1703  TTTTAATCTTTGACAACGATTATCCAATTCAAAGCAGCACTGGTACACTCACTATCCGTGTGTGTGCCTGCGAT  1776
            ||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1700  TTTTAATCTTCGACAATGATTATCCTATTCAAAGCAGCACTGGCACACTCACGATCCGTGTGTGCGCATGCGAT  1773

Query 1777  AATCAAGGAAACATGCAATCCTGCACCGCAGAAGCCCTGATCCTTTCAGCCGGCCTGAGCACGGGAGCTCTCGT  1850
            ||.|..||.||||||||.|||||||..||.||.||||||||.|||.|.||.|||||||||||.||.||.|||.|
Sbjct 1774  AACCTGGGGAACATGCAGTCCTGCAATGCGGAGGCCCTGATGCTTGCTGCAGGCCTGAGCACAGGGGCGCTCAT  1847

Query 1851  TGCGATTCTACTCTGTGTCCTCATACTGCTTATTTTAGTCGTGTTGTTTGCTGCATTGAAGAGGCAAAGAAAAA  1924
            .||.|||||.||.||||||.||||.|||||||.|.||.|.||..|||||||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct 1848  CGCTATTCTCCTTTGTGTCGTCATCCTGCTTACTCTAATTGTACTGTTTGCTGCATTGAAGAGGCAACGGAAAA  1921

Query 1925  AGGAACCTCTGATAATTTCAAAAGACGATGTCCGGGACAACATTGTGACCTACAACGATGAAGGCGGCGGGGAA  1998
            ||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||.||.
Sbjct 1922  AGGAGCCTCTGATCATTTCAAAGGATGACGTCCGGGACAATATTGTGACCTATAATGACGAAGGTGGTGGAGAG  1995

Query 1999  GAAGATACCCAAGCTTTTGACATTGGCACATTAAGGAATCCAGAGGCAAGAGAAGACAGTAAACTTAGACGGGA  2072
            |||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1996  GAAGACACACAGGCTTTTGACATCGGCACATTAAGGAATCCGGAAGCAAGAGAAGACAGTAAACTTAGAAGAGA  2069

Query 2073  TGTAATGCCTGAAACTATTTTTCAGATAAGGAGGACTGTGCCTCTGTGGGAAAATATTGATGTACAAGATTTTA  2146
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2070  TGTCATGCCTGAAACTATTTTTCAGATAAGGAGGACAGTACCCCTCTGGGAAAATATTGACGTACAAGATTTTA  2143

Query 2147  TCCATCGAAGATTAAAAGAAAACGACGCAGACCCAAGTGCACCTCCATATGATTCGCTGGCAACGTATGCCTAT  2220
            |.||.||.|||.|.||||||||||||.||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||||||
Sbjct 2144  TACACCGGAGACTGAAAGAAAACGACTCAGACCCAAGTGCACCGCCCTACGACTCCCTGGCCACTTATGCCTAT  2217

Query 2221  GAAGGGAATGATTCCATAGCAGATTCGCTCAGTTCTTTGGAATCTCTCACAGCTGATTGTAACCAAGATTATGA  2294
            ||||||||||||||..|.||..||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 2218  GAAGGGAATGATTCTGTTGCCAATTCTCTCAGCTCCTTAGAATCTCTCACAGCTGATTGCAACCAGGATTATGA  2291

Query 2295  TTACCTCAGTGACTGGGGGCCTCGTTTCAAAAAACTTGCCGATATGTATGGGGGTGATGATAGTGA-CCGAGAC  2367
            ||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||.|.||.||||| |.|| ||
Sbjct 2292  TTACCTTAGCGACTGGGGACCTCGGTTCAAAAAACTCGCAGAAATGTATGGGGGTAACGACAGTGATCTGA-AC  2364