Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05975
• Subject: XM_011245337.2
• Aligned Length: 2605
• Identities: 2047
• Gaps: 242

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAAGACTCGGCTGGGGAGACACTGTAAAAGGGGGAAAGGAAGGGATGAGACAGAAGCAACAACAGAATCAAC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCTGCTGAGCAAGGCTAACTGCTTTCCATTGCTAAACAAGATTTCAACATTCTCTTTGTGTGTGCTTACACGCA  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  TTGGTGCTTACACAAGTACGTGTTTACTAAGTGTCTTCCCTGTAATCAGACTACACATTGAAACTTTCATCCTT  222

Query    1  ---------------ATGAGGACTTACCATTGTATACCATTATTCATCTGGACCTATATGTTCCATACAGTTGA  59
                           ||||||||||||..||||.|.|.|.|..||||||||||.|..||.|||||||..|||||
Sbjct  223  CTGAAGGTGAAGATAATGAGGACTTACAGTTGTCTTCAACTGGTCATCTGGACTTGCATTTTCCATATGGTTGA  296

Query   60  CACCATCCTATTACAAGAAAAACCTAACAGTTATTTATCAAGCAAAAAGATAGTGGGTCTGACAAAAGATGACG  133
            ||.||.|..||||||||.|||...||.||||.|.||....||   ||.|||||||..|||||.|||.|||||.|
Sbjct  297  CAACAGCACATTACAAGGAAAGGATAGCAGTCACTTCCTGAG---AAGGATAGTGAATCTGAAAAAGGATGAGG  367

Query  134  GTAAAATGCTACGTCGCACCAAGCGTGGCTGGATGTGGAATCAGTTCTTCTTATTGGAAGAGTACACAGGTACT  207
            ||||||||||.|.|||..||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.||||||||.||||||||.
Sbjct  368  GTAAAATGCTCCATCGTGCCAAGCGTGGCTGGATGTGGAATCAGTTCTTCCTCTTAGAAGAGTATACAGGTACA  441

Query  208  GACACACAATATGTAGGCAAGCTTCACACTGACCAAGATAAAGGAGATGGAAATTTAAAATACATACTAACAGG  281
            |||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.|||||
Sbjct  442  GACACTCAGTATGTAGGAAAGCTTCACACTGACCAAGATAAAGGAGATGGAAATTTAAAATACATTTTGACAGG  515

Query  282  AGATGGGGCTGGCAGTCTATTTGTTATAGATGAAAATACAGGAGACATTCATGCTGCAAAGAAACTAGACAGAG  355
            ||||||.|||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||.|||||||||||
Sbjct  516  AGATGGAGCTGGCAATCTGTTTGTTATAGATGAAAATACAGGAGATATTCACGCTGCAAAGAGACTAGACAGAG  589

Query  356  AAGAAAAATCTCTGTACATTCTTCGTGCCAAGGCTATAGACAGAAAAACTGGGCGGCAGGTGGAACCGGAATCG  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||.
Sbjct  590  AAGAAAAATCTCTGTACATTCTTCGTGCCAAGGCTATAGACAGAAAGACCGGACGACAAGTGGAGCCAGAATCT  663

Query  430  GAATTTATCATTAAAATACATGATATCAATGACAATGAGCCAAAATTTACAAAAGACTTATACACTGCCAGTGT  503
            ||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||.|.|||||.||||||||
Sbjct  664  GAGTTTATCATTAAAATCCATGATATTAATGACAATGAACCAAAATTCACGAAAGACCTGTACACAGCCAGTGT  737

Query  504  TCCTGAAATGTCTGGAGTCGGTACATCTGTTATACAAGTAACTGCAACAGATGCAGATGACGCCAACTATGGAA  577
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  738  TCCTGAAATGTCTGGAGTTGGTACGTCTGTTATACAAGTAACTGCCACCGATGCAGATGATGCTAACTATGGGA  811

Query  578  ATAGTGCCAAAGTGGTCTATAGCATATTGCAAGGACAGCCATATTTTTCAGTGGACCCAGAATCAGGCATAATA  651
            |.|||||.|||||||||||.|||||..|||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  812  ACAGTGCTAAAGTGGTCTACAGCATTCTGCAAGGGCAGCCATACTTTTCAGTGGACCCGGAATCAGGCATAATA  885

Query  652  AAAACTGCATTACCAGACATGAGCAGAGAAAATAGAGAGCAGTACCAGGTTGTTATACAGGCCAAAGACATGGG  725
            ||.||||||||.||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct  886  AAGACTGCATTGCCAGACATGAGCAGAGAAAACAAAGAGCAGTACCAAGTTGTTATTCAGGCTAAGGACATGGG  959

Query  726  TGGCCAGATGGGAGGCCTTTCTGGAACCACCACAGTGAACATCACGCTGACAGATGTCAACAACAACCCTCCTC  799
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  TGGCCAGATGGGAGGCCTCTCTGGCACCACCACAGTGAACATCACCCTAACAGATGTCAACAACAACCCTCCTC  1033

Query  800  GATTTCCCCAGAGTACGTATCAATTTAATTCTCCTGAGTCTGTACCTCTTGGAACTCATCTTGGAAGGATAAAA  873
            |.||.||.|||||.||.|||||.||||||||||..|||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  GGTTCCCACAGAGCACTTATCAGTTTAATTCTCTGGAGTCGGCACCTCTTGGAACTCATCTTGGAAGGATAAAA  1107

Query  874  GCCAATGACCCTGACGTGGGGGAAAATGCAGAAATGGAGTATAGCATTGCTGAAGGAGATGGTGCAGACATGTT  947
            |||||||||||.|||.|||||||.||.||.||..||||.|||||||||||.||||||||.||..||||||||||
Sbjct 1108  GCCAATGACCCAGACATGGGGGAGAACGCCGAGCTGGAATATAGCATTGCAGAAGGAGAAGGATCAGACATGTT  1181

Query  948  CGATGTCATCACTGACAAGGATACACAGGAAGGGATTATAACTGTCAAACAGAATTTAGATTTTGAAAATCAAA  1021
            .|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct 1182  TGATGTGATCACTGACAAAGATACACAGGAAGGGATCATAACTGTCAAACAGAATTTAGATTTTGAAAAGAAAA  1255

Query 1022  TGCTCTATACTTTAAGAGTGGATGCAAGTAACACTCACCCTGATCCACGATTCTTACACCTGGGACCTTTCAAA  1095
            ||.|.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1256  TGTTGTACACTTTAAGAGTGGATGCAAGTAATACCCACCCTGATCCTCGATTCTTACACCTTGGACCTTTCAAA  1329

Query 1096  GATACAGCTGTGGTCAAAATATCTGTGGAAGATATAGATGAGCCTCCTGTGTTCACTAAAGTCTCTTACTTGAT  1169
            ||..||||..||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||||.|||..|||||||||||||
Sbjct 1330  GACTCAGCCATGGTTAAGATATCTGTGGAAGATGTAGATGAGCCCCCTGTGTTCAGTAAGCTCTCTTACTTGAT  1403

Query 1170  AGAAGTAGATGAAGATGTAAAGGAGGGCAGTATCATTGGACAGGTTACAGCATACGATCCAGATGCCAGGAACA  1243
            .|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||.|||||
Sbjct 1404  GGAAGTTGATGAAGATGTGAAGGAGGGGAGCATCATCGGACAAGTCACAGCATATGACCCAGATGCCATGAACA  1477

Query 1244  ATTTAATAAAGTACTCTGTTGATCGGCATACTGATATGGACCGTATTTTTGGTATTCACTCAGAAAATGGTTCT  1317
            |..|||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||..||||..|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  ACATAATAAAATACTCTGTGGACCGCCATACTGATATGGACCGAGTTTTCAGTATTCACTCAGAAAATGGTTCT  1551

Query 1318  ATTTTCACTTTGAAAGCCCTTGACCGGGAATCATCTCCTTGGCATAACATCACTGTTACAGCCACAGAAATAAA  1391
            ||.||||||.|||||.||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||||||.|||||
Sbjct 1552  ATCTTCACTCTGAAACCCCTGGATCGGGAATCATCCCCTTGGCATAACATCACCATTACAGCCACAGAGATAAA  1625

Query 1392  TAACCCAAAACAAAGTAGCCACATCCCTGTCTTCATCAGAATTCTAGATATAAATGACCATGCTCCGGAATTTG  1465
            |||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1626  TAACCCAAAACAAAGTAGCCAAATTCCTGTCTTCATCAGAATCCTTGATATAAATGATCATGCTCCAGAATTTG  1699

Query 1466  CCATGTATTATGAAACATTTGTTTGTGAAAATGCAAAACCTGGGCAGTTGATTCAGACTGTCAGTGTCATGGAT  1539
            |||..||.|||||||||||||||||||||||||||||..||||.|||||||||||.|||.|.|||||||||||.
Sbjct 1700  CCACTTACTATGAAACATTTGTTTGTGAAAATGCAAAGTCTGGCCAGTTGATTCAAACTATAAGTGTCATGGAC  1773

Query 1540  AAGGATGACCCTCCCCGAGGTCACAAATTCTTTTTTGAACCAGTGCCAGAATTTACTCTCAATCCGAATTTCAC  1613
            ||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1774  AAAGATGATCCTCCTCGAGGACACAAGTTCTTCTTTGAGCCAGTGCCAGAATTTCCTCTAAACCCAAACTTCAC  1847

Query 1614  CATTGTAGATAATAAAGATAATACAGCAGGAATCATGACTCGGAAAGATGGCTACAGTCGCAACAAAATGAGCA  1687
            .||||||||.|||||||||||||||||||||||..|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||.||
Sbjct 1848  AATTGTAGACAATAAAGATAATACAGCAGGAATTGTAACTCGAAAAGATGGGTACAGCCGCAACAAAATGAACA  1921

Query 1688  CCTACTTATTGCCGATTTTAATCTTTGACAACGATTATCCAATTCAAAGCAGCACTGGTACACTCACTATCCGT  1761
            |||||.||.|||||.||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 1922  CCTACCTACTGCCGGTTTTAATCTTCGACAATGATTATCCTATTCAAAGCAGCACTGGCACACTCACGATCCGT  1995

Query 1762  GTGTGTGCCTGCGATAATCAAGGAAACATGCAATCCTGCACCGCAGAAGCCCTGATCCTTTCAGCCGGCCTGAG  1835
            |||||.||.||||||||.|..||.||||||||.|||||||..||.||.||||||||.|||.|.||.||||||||
Sbjct 1996  GTGTGCGCATGCGATAACCTGGGGAACATGCAGTCCTGCAATGCGGAGGCCCTGATGCTTGCTGCAGGCCTGAG  2069

Query 1836  CACGGGAGCTCTCGTTGCGATTCTACTCTGTGTCCTCATACTGCTTATTTTAGTCGTGTTGTTTGCTGCATTGA  1909
            |||.||.||.|||.|.||.|||||.||.||||||.||||.|||||||.|.||.|.||..|||||||||||||||
Sbjct 2070  CACAGGGGCGCTCATCGCTATTCTCCTTTGTGTCGTCATCCTGCTTACTCTAATTGTACTGTTTGCTGCATTGA  2143

Query 1910  AGAGGCAAAGAAAAAAGGAACCTCTGATAATTTCAAAAGACGATGTCCGGGACAACATTGTGACCTACAACGAT  1983
            ||||||||.|.||||||||.||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.
Sbjct 2144  AGAGGCAACGGAAAAAGGAGCCTCTGATCATTTCAAAGGATGACGTCCGGGACAATATTGTGACCTATAATGAC  2217

Query 1984  GAAGGCGGCGGGGAAGAAGATACCCAAGCTTTTGACATTGGCACATTAAGGAATCCAGAGGCAAGAGAAGACAG  2057
            |||||.||.||.||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2218  GAAGGTGGTGGAGAGGAAGACACACAGGCTTTTGACATCGGCACATTAAGGAATCCGGAAGCAAGAGAAGACAG  2291

Query 2058  TAAACTTAGACGGGATGTAATGCCTGAAACTATTTTTCAGATAAGGAGGACTGTGCCTCTGTGGGAAAATATTG  2131
            ||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 2292  TAAACTTAGAAGAGATGTCATGCCTGAAACTATTTTTCAGATAAGGAGGACAGTACCCCTCTGGGAAAATATTG  2365

Query 2132  ATGTACAAGATTTTATCCATCGAAGATTAAAAGAAAACGACGCAGACCCAAGTGCACCTCCATATGATTCGCTG  2205
            |.||||||||||||||.||.||.|||.|.||||||||||||.||||||||||||||||.||.||.||.||.|||
Sbjct 2366  ACGTACAAGATTTTATACACCGGAGACTGAAAGAAAACGACTCAGACCCAAGTGCACCGCCCTACGACTCCCTG  2439

Query 2206  GCAACGTATGCCTATGAAGGGAATGATTCCATAGCAGATTCGCTCAGTTCTTTGGAATCTCTCACAGCTGATTG  2279
            ||.||.|||||||||||||||||||||||..|.||..||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2440  GCCACTTATGCCTATGAAGGGAATGATTCTGTTGCCAATTCTCTCAGCTCCTTAGAATCTCTCACAGCTGATTG  2513

Query 2280  TAACCAAGATTATGATTACCTCAGTGACTGGGGGCCTCGTTTCAAAAAACTTGCCGATATGTATGGGGGTGATG  2353
            .|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||.|.|
Sbjct 2514  CAACCAGGATTATGATTACCTTAGCGACTGGGGACCTCGGTTCAAAAAACTCGCAGAAATGTATGGGGGTAACG  2587

Query 2354  ATAGTGA-CCGAGAC  2367
            |.||||| |.|| ||
Sbjct 2588  ACAGTGATCTGA-AC  2601