Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_05989
• Subject: NM_001321027.1
• Aligned Length: 971
• Identities: 793
• Gaps: 82

Alignment

Query   1  ATGGATCCCAAATATCAGCGTGTAGAGCTAAATGATGGTCACTTCATGCCCGTATTGGGATTTGGCACCTATGC  74
           ||||||.|.|||||.|||.||||..||||.||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGATTCGAAATACCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCCTGTCCTGGGATTTGGCACCTATGC  74

Query  75  ACCTCCAGAGGTTCCGAGGAACAGAGCTGTAGAGGTCACCAAATTAGCAATAGAAGCTGGCTTCCGCCATATTG  148
           .|||.||||||||||.|..|..|.||||.||||||.|..||||||.|||||||||||.||.||||.||||||||
Sbjct  75  GCCTGCAGAGGTTCCTAAAAGTAAAGCTCTAGAGGCCGTCAAATTGGCAATAGAAGCCGGGTTCCACCATATTG  148

Query 149  ATTCTGCTTATTTATACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222
           |||||||..||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATTCTGCACATGTTTACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222

Query 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGTGCACTTTCTTTCAACCACAGATGGTCCAACCAGCCTT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||.|..||.||||.||.||||||.|||||||||
Sbjct 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGAGCAATTCCCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296

Query 297  GGAAAGCTCACTGAAAAAACTTCAACTGGACTATGTTGACCTCTATCTTCTTCATTTCCCAATGGCTCTCAAGC  370
           ||||||.|||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.||.||       
Sbjct 297  GGAAAGGTCACTGAAAAATCTTCAATTGGACTATGTTGACCTCTATCTTATTCATTTTCCAGTGTCT-------  363

Query 371  CAGGTGAGACGCCACTACCAAAAGATGAAAATGGAAAAGTAATATTCGACACAGTGGATCTCTCTGCCACATGG  444
                                                 ||||                                
Sbjct 364  --------------------------------------GTAA--------------------------------  367

Query 445  GAGGTCATGGAGAAGTGTAAGGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCAAACTTCAACTACAGGCAGCT  518
            |||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||.|||
Sbjct 368  -AGGCCATGGAGAAGTGTAAAGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCACAGGCTGCT  440

Query 519  GGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGACTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTAGAATGTCATCCTTACCTCA  592
           ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||
Sbjct 441  GGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTGGAATGTCATCCTTACTTCA  514

Query 593  ACCAGAGCAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCCACAGTGCTCTGGGAACCCAA  666
           |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||.
Sbjct 515  ACCAGAGAAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCCCAT  588

Query 667  CGACATAAACTATGGGTGGACCCAAACTCCCCAGTTCTTTTGGAGGACCCAGTTCTTTGTGCCTTAGCAAAGAA  740
           |||.|..|||.||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 589  CGAGAAGAACCATGGGTGGACCCGAACTCCCCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAAA  662

Query 741  ACACAAACGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTGCAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGCT  814
           .|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663  GCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTGCAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGCT  736

Query 815  ACAATGAGCAGCGGATCAGAGAGAACATCCAGGTTTTTGAATTCCAGTTGACATCAGAGGATATGAAAGTTCTA  888
           |||||||||||||.||||||.|||||.|.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||...||
Sbjct 737  ACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCCATA  810

Query 889  GATGGTCTAAACAGAAATTATCGATATGTTG-TCATGGAT-TTTCTTATGGACCATCCTGATTATCCATTTTCA  960
           |||||.||||||||||||...|||||| ||| .|.|.||| |||.|..||| ||..|||.|||||||||||||.
Sbjct 811  GATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATAT-TTGACCCTTGATATTTTTGCTGG-CCCCCCTAATTATCCATTTTCT  882

Query 961  GATGAATAT  969
           |||||||||
Sbjct 883  GATGAATAT  891