Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06034
• Subject: NM_009948.2
• Aligned Length: 2321
• Identities: 1992
• Gaps: 10

Alignment

Query    1  ATGGCGGAAGCTCACCAGGCCGTGGCCTTCCAGTTCACGGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTCAGTCG  74
            |||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGGAAGCACACCAGGCAGTAGCTTTCCAGTTCACTGTGACCCCAGACGGGGTCGACTTCCGGCTTAGTCG  74

Query   75  GGAGGCCCTGAAACACGTCTACCTGTCTGGGATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTGATCCGCATCAAGAATGGCA  148
            ||||||.||||.||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  GGAGGCTCTGAGACACATCTACCTGTCTGGAATCAACTCCTGGAAGAAACGCCTTATTCGAATCAAGAATGGCA  148

Query  149  TCCTCAGGGGCGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTCGTCATCATGGCAACAGTGGGTTCCTCCTTC  222
            ||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||||||||.||||||..||.|
Sbjct  149  TCCTTAGGGGTGTGTACCCTGGCAGCCCCACCAGCTGGCTGGTTGTTGTCATGGCAACAGTTGGTTCCAACTAC  222

Query  223  TGCAACGTGGACATCTCCTTGGGGCTGGTCAGTTGCATCCAGAGATGCCTCCCTCAGGGGTGTGGCCCCTACCA  296
            |||||.||||||||||||.||||.||||||..|||||||||||||||||||||..|..|||.|||||.||....
Sbjct  223  TGCAAGGTGGACATCTCCATGGGACTGGTCGATTGCATCCAGAGATGCCTCCCGGAAAGGTATGGCCACTTTGG  296

Query  297  GACCCCGCAGACCCGGGCACTTCTCAGCATGGCCATCTTCTCCACGGGCGTCTGGGTGACGGGCATCTTCTTCT  370
            ||||||.|||||...|||||||||||||||||.||||||||||||.||.|||||||.|||.|||||.|||||||
Sbjct  297  GACCCCACAGACAGAGGCACTTCTCAGCATGGTCATCTTCTCCACCGGAGTCTGGGCGACAGGCATTTTCTTCT  370

Query  371  TCCGCCAAACCCTGAAGCTGCTTCTCTGCTACCATGGGTGGATGTTTGAGATGCATGGCAAGACCAGCAACTTG  444
            ||||.|||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||.||||||||..|||||||||||  |.||
Sbjct  371  TCCGACAAACCCTGAAGCTGCTGCTCTCCTACCACGGGTGGATGTTCGAGATGCACAGCAAGACCAGC--CATG  442

Query  445  --ACCAGGATCTGGGCTATGTGTATCCGCCTTCTATCCAGCCGGCACCCTATGCTCTACAGCTTCCAGACATCT  516
              ||||.||||||||||||.|||.||||.||.||.||||||||||..||.|||||||||||||||||.||.||.
Sbjct  443  CCACCAAGATCTGGGCTATCTGTGTCCGTCTCCTGTCCAGCCGGCGGCCCATGCTCTACAGCTTCCAAACGTCA  516

Query  517  CTGCCCAAGCTTCCTGTGCCCAGGGTGTCAGCCACAATTCAGCGGTACCTAGAGTCTGTGCGCCCCTTGTTGGA  590
            |||||.|||||||||||.|||||.|||.|||||||||||||.||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct  517  CTGCCTAAGCTTCCTGTCCCCAGCGTGCCAGCCACAATTCACCGGTACTTGGATTCTGTGCGGCCCTTATTGGA  590

Query  591  TGATGAGGAATATTACCGCATGGAGTTGCTGGCCAAAGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAAT  664
            ||||||.|.||||||||||||||||....|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  TGATGAAGCATATTACCGCATGGAGACATTGGCCAAGGAATTCCAGGACAAGACTGCCCCCAGGCTGCAGAAAT  664

Query  665  ACCTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAAGTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAGTACATCTACCTTCGAGGC  738
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||..|||||||.|||.||
Sbjct  665  ACCTGGTGCTCAAGTCATGGTGGGCAACTAACTATGTGAGTGACTGGTGGGAAGAATATGTCTACCTCCGAAGC  738

Query  739  AGGAGCCCTCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGTCATGGACCTTGTGCTCATCAAGAATACAGACGTGCAGGC  812
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||..|||||||.||.|||||.|||.|.|||||.||
Sbjct  739  AGGAGCCCCCTCATGGTGAACAGCAACTATTATGCCATGGATTTTGTGCTTATTAAGAACACAAATGTGCAAGC  812

Query  813  AGCCCGCCTGGGAAACATCATCCACGCCATGATCATGTATCGCCGTAAACTGGACCGTGAAGAAATCAAGCCTG  886
            ||||||.||.||.||...|.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  813  AGCCCGTCTAGGCAATGCCGTTCACGCCATGATCATGTATCGCCGCAAACTGGACCGTGAAGAGATCAAGCCGG  886

Query  887  TGATGGCACTGGGCATAGTGCCTATGTGCTCCTACCAGATGGAGGGGATGTTCAACACCACTCGGATCCCGGGC  960
            |.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct  887  TCATGGCACTGGGTATGGTGCCCATGTGCTCCTACCAGATGGAGAGGATGTTCAACACTACACGCATCCCAGGC  960

Query  961  AAGGACACAGATGTGCTACAGCACCTCTCAGACAGCCGGCACGTGGCTGTCTACCACAAGGGACGCTTCTTCAA  1034
            ||.||.|||||..|||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  961  AAAGAGACAGACTTGCTACAGCACCTCTCAGAGAGCAGGCACGTGGCTGTCTACCACAAAGGTCGCTTCTTCAA  1034

Query 1035  GCTGTGGCTCTATGAGGGCGCCCGTCTGCTCAAGCCTCAGGATCTGGAGATGCAGTTCCAGAGGATCCTGGACG  1108
            |.|.|||||||||||||||.|.||.|||||||||||.|..||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1035  GGTCTGGCTCTATGAGGGCTCGCGCCTGCTCAAGCCCCGAGACCTGGAGATGCAGTTCCAGAGAATCCTCGACG  1108

Query 1109  ACCCCTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACTGCAGGAGGAAGGGTGGAGTGGGCGCAG  1182
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||
Sbjct 1109  ACCCTTCCCCACCTCAGCCTGGGGAGGAGAAGCTGGCAGCCCTCACCGCAGGAGGAAGGGTAGAGTGGGCAGAG  1182

Query 1183  GCACGCCAGGCCTTCTTTAGCTCTGGAAAGAATAAGGCTGCCT-TGGAGGCCATCGAGCGTGCCGCTTTCTTCG  1255
            |||||.|||.|||||||.||||||||.|||||.|| |.||.|| ||||.||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1183  GCACGTCAGACCTTCTTCAGCTCTGGCAAGAACAA-GATGTCTCTGGACGCCATCGAACGTGCTGCTTTCTTTG  1255

Query 1256  TGGCCCTGGATGAGGAATCCTACTCCTATGACCCCGAAGATGAGGCCAGCCTCAGCCTCTATGGCAAGGCCCTG  1329
            ||.||||||||||.||.||..|.|.|||..||||.||.||||||.||||.||.||||||||.|||||.|||.||
Sbjct 1256  TGACCCTGGATGAAGATTCTCATTGCTACAACCCTGACGATGAGACCAGTCTTAGCCTCTACGGCAAAGCCTTG  1329

Query 1330  CTACATGGCAACTGCTACAACAGGTGGTTTGACAAATCCTTCACTCTCATTTCCTTCAAGAATGGCCAGTTGGG  1403
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||.|||||||||||.|||.||
Sbjct 1330  CTCCATGGCAACTGCTATAACAGGTGGTTTGACAAATCTTTCACCCTTATCTCCTGCAAGAATGGCCTGTTAGG  1403

Query 1404  TCTCAATGCAGAGCATGCGTGGGCAGATGCTCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACAGACA  1477
            .|||||..|.||.||..||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1404  CCTCAACACCGAACACTCGTGGGCAGACGCGCCCATCATTGGGCACCTCTGGGAGTTTGTCCTGGGCACTGATA  1477

Query 1478  GCTTCCACCTGGGCTACACGGAGACCGGGCACTGCCTGGGCAAACCGAACCCTGCGCTCGCACCTCCTACA-CG  1550
            .|||.||||||||||||||||||||.||.|||||..||||..|.||.|||.|..||.|..||||.||| || ||
Sbjct 1478  CCTTTCACCTGGGCTACACGGAGACAGGACACTGTGTGGGTGAGCCAAACACCACGTTGCCACCCCCT-CAGCG  1550

Query 1551  GCTGCAGTGGGACATTCCAAAACAGTGCCAGGCGGTCATCGAGAGTTCCTACCAGGTGGCCAAGGCGTTGGCAG  1624
            |||||.||||||||||||..|.|||||||.||..|.||||||||..||.|||||.||.||||||||..||||.|
Sbjct 1551  GCTGCCGTGGGACATTCCCGAGCAGTGCCGGGAAGCCATCGAGAACTCGTACCAAGTAGCCAAGGCACTGGCCG  1624

Query 1625  ACGACGTGGAGTTGTACTGCTTCCAGTTCCTGCCCTTTGGCAAAGGCCTCATCAAGAAGTGCCGGACCAGCCCT  1698
            |.|||||||||.|.|||||||||||||||.|.||||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||.
Sbjct 1625  ATGACGTGGAGCTCTACTGCTTCCAGTTCTTACCCTTTGGCAAAGGTCTTATCAAGAAGTGTAGGACCAGCCCC  1698

Query 1699  GATGCCTTTGTGCAGATCGCGCTGCAGCTGGCTCACTTCCGGGACAGGGGTAAGTTCTGCCTGACCTATGAGGC  1772
            ||.||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||..||.||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1699  GACGCTTTTGTGCAGATTGCCCTACAGCTGGCTCATTTCCGGGACAAAGGCAAGTTCTGCCTGACTTACGAGGC  1772

Query 1773  CTCAATGACCAGAATGTTCCGGGAGGGACGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAGCGAGTCCACAGCCTTTG  1846
            |||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||
Sbjct 1773  CTCGATGACAAGAATGTTCCGAGAGGGGCGGACTGAGACTGTGCGTTCCTGTACCAACGAGTCCGCAGCCTTTG  1846

Query 1847  TGCAGGCCATGATGGAGGGGTCCCACACAAAAGCAGACCTGCGAGATCTCTTCCAG-AAGGCTGCTAAGAAGCA  1919
            ||||||||||||||.||||||||||.|..|||..||||||.|.|||||||||||.| |||.||.|.|| |||||
Sbjct 1847  TGCAGGCCATGATGAAGGGGTCCCATAAGAAACAAGACCTCCAAGATCTCTTCCGGAAAGCCTCCGAA-AAGCA  1919

Query 1920  CCAGAATATGTACCGCCTGGCCATGACCGGGGCAGGGATCGACAGGCACCTCTTCTGCCTTTACTTGGTCTCCA  1993
            |||.||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1920  CCAAAACATGTACCGCCTAGCCATGACAGGGGCTGGGATCGACCGGCACCTCTTCTGCCTTTACATCGTCTCCA  1993

Query 1994  AGTACCTAGGAGTCAGCTCTCCTTTCCTTGCTGAGGTGCTCTCGGAACCCTGGCGTCTCTCCACCAGCCAGATC  2067
            |||||.|||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1994  AGTACTTAGGAGTTAGCTCTCCTTTCCTGGCTGAGGTACTTTCTGAACCCTGGAGCCTCTCCACCAGCCAGATC  2067

Query 2068  CCCCAATCCCAGATCCGCATGTTCGACCCAGAGCAGCACCCCAATCACCTGGGCGCTGGAGGTGGCTTTGGCCC  2141
            |||||.|.|||||||.|||||||.||||||.|.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2068  CCCCAGTTCCAGATCTGCATGTTTGACCCAAAACAGTATCCCAATCATCTGGGTGCTGGAGGTGGCTTTGGTCC  2141

Query 2142  TGTAGCAGATGATGGCTATGGAGTTTCCTACATGATTGCAGGCGAGAACACGATCTTCTTCCACATCTCCAGCA  2215
            .||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2142  CGTGGCGGATGATGGCTACGGGGTCTCTTACATGATCGCAGGAGAAAACACCATGTTCTTCCACATCTCCAGCA  2215

Query 2216  AGTTCTCAAGCTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGAAACCACATCCGCAAAGCCCTGCTGGACATTGCTGAT  2289
            |.|.||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||.|||.|||||||.||.||.
Sbjct 2216  AATACTCAAGTTCAGAGACGAACGCCCAGCGCTTTGGGAACCACATCCGCCAAGCACTGTTGGACATCGCCGAA  2289

Query 2290  CTTTTCCAAGTTCCCAAGGCCTACAGC  2316
            ||||||.||.||.|||||.|..|||||
Sbjct 2290  CTTTTCAAAATTTCCAAGACAGACAGC  2316