Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06056
• Subject: NM_001363749.2
• Aligned Length: 1292
• Identities: 1225
• Gaps: 58

Alignment

Query    1  ATGGAGCTGAGAGTCGGGAACAGGTACCGGCTGGGCCGGAAGATCGGCAGCGGCTCCTTCGGAGACATCTATCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGCTGAGAGTCGGGAACAGGTACCGGCTGGGCCGGAAGATCGGCAGCGGCTCCTTCGGAGACATCTATCT  74

Query   75  CGGTACGGACATTGCTGCAGGAGAAGAGGTTGCCATCAAGCTTGAATGTGTCAAAACCAAACACCCTCAGCTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGTACGGACATTGCTGCAGGAGAAGAGGTTGCCATCAAGCTTGAATGTGTCAAAACCAAACACCCTCAGCTCC  148

Query  149  ACATTGAGAGCAAAATCTACAAGATGATGCAGGGAGGAGTGGGCATCCCCACCATCAGATGGTGCGGGGCAGAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACATTGAGAGCAAAATCTACAAGATGATGCAGGGAGGAGTGGGCATCCCCACCATCAGATGGTGCGGGGCAGAG  222

Query  223  GGGGACTACAACGTCATGGTGATGGAGCTGCTGGGGCCAAGCCTGGAGGACCTCTTCAACTTCTGCTCCAGGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGACTACAACGTCATGGTGATGGAGCTGCTGGGGCCAAGCCTGGAGGACCTCTTCAACTTCTGCTCCAGGAA  296

Query  297  ATTCAGCCTCAAAACCGTCCTGCTGCTTGCTGACCAAATGATCAGTCGCATCGAATACATTCATTCAAAGAACT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTCAGCCTCAAAACCGTCCTGCTGCTTGCTGACCAAATGATCAGTCGCATCGAATACATTCATTCAAAGAACT  370

Query  371  TCATCCACCGGGATGTGAAGCCAGACAACTTCCTCATGGGCCTGGGGAAGAAGGGCAACCTGGTGTACATCATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCATCCACCGGGATGTGAAGCCAGACAACTTCCTCATGGGCCTGGGGAAGAAGGGCAACCTGGTGTACATCATC  444

Query  445  GACTTCGGGCTGGCCAAGAAGTACCGGGATGCACGCACCCACCAGCACATCCCCTATCGTGAGAACAAGAACCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTCGGGCTGGCCAAGAAGTACCGGGATGCACGCACCCACCAGCACATCCCCTATCGTGAGAACAAGAACCT  518

Query  519  CACGGGGACGGCGCGGTACGCCTCCATCAACACGCACCTTGGAATTGAACAATCCCGAAGAGATGACTTGGAGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACGGGGACGGCGCGGTACGCCTCCATCAACACGCACCTTGGAATTGAACAATCCCGAAGAGATGACTTGGAGT  592

Query  593  CTCTGGGCTACGTGCTAATGTACTTCAACCTGGGCTCTCTCCCCTGGCAGGGGCTGAAGGCTGCCACCAAGAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCTGGGCTACGTGCTAATGTACTTCAACCTGGGCTCTCTCCCCTGGCAGGGGCTGAAGGCTGCCACCAAGAGA  666

Query  667  CAGAAATACGAAAGGATTAGCGAGAAGAAAATGTCCACCCCCATCGAAGTGTTGTGTAAAGGCTACCCTTCCGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGAAATACGAAAGGATTAGCGAGAAGAAAATGTCCACCCCCATCGAAGTGTTGTGTAAAGGCTACCCTTCCGA  740

Query  741  ATTTGCCACATACCTGAATTTCTGCCGTTCCTTGCGTTTTGACGACAAGCCTGACTACTCGTACCTGCGGCAGC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ATTTGCCACATACCTGAATTTCTGCCGTTCCTTGCGTTTTGACGACAAGCCTGACTACTCGTACCTGCGGCAGC  814

Query  815  TTTTCCGGAATCTGTTCCATCGCCAGGGCTTCTCCTATGACTACGTGTTCGACTGGAACATGCTCAAATTTGGT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTTCCGGAATCTGTTCCATCGCCAGGGCTTCTCCTATGACTACGTGTTCGACTGGAACATGCTCAAATTTGGT  888

Query  889  GCCAGCCGGGCCGCCGATGACGCCGAGCGGGAGCGCAGGGACCGAGAGGAGCGGCTGAGACACTCGCGGAACCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCCAGCCGGGCCGCCGATGACGCCGAGCGGGAGCGCAGGGACCGAGAGGAGCGGCTGAGACACTCGCGGAACCC  962

Query  963  GGCTACCCGCGGCCTCCCTTCCACAGCCTCCGGCCGCCTGCGGGGGACGCAGGAAGTGGCTCCCCCCACACCCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGCTACCCGCGGCCTCCCTTCCACAGCCTCCGGCCGCCTGCGGGGGACGCAGGAAGTGGCTCCCCCCACACCCC  1036

Query 1037  TCACCCCTACCTCACACACGGCTAACACCTCCCCCCGGCCTGTCTCCGGCATGGAGAGAGAGCGGAAAGTGAGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCACCCCTACCTCACACACGGCTAACACCTCCCCCCGGCCCGTCTCCGGCATGGAGAGAGAGCGGAAAGTGAGT  1110

Query 1111  ATGCGGCTGCACCGCGGGGCCCCCGTCAACATCTCCTCGTCCGACCTCACAGGCCGACAAGATACCTCTCGCAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATGCGGCTGCACCGCGGGGCCCCCGTCAACATCTCCTCGTCCGACCTCACAGGCCGACAAGATACCTCTCGCAT  1184

Query 1185  GTCCACCTCACAGATTCCTGG-TCGGG----TGGCTTCCAGTGGTCTTCAG-----------------------  1230
            ||||||||||||||     || .|.||    ||||.||      |||.|.|                       
Sbjct 1185  GTCCACCTCACAGA-----GGAGCAGGGACATGGCATC------TCTCCGGCTGCACGCGGCCCGCCAGGGCAC  1247

Query 1231  --TCTGTCGT----------------GCACCGA-  1245
              .|||.|||                |||||.| 
Sbjct 1248  CCGCTGCCGTCCCCAGCGCCCACGACGCACCTAC  1281