Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06063
- Subject:
- XM_011241194.2
- Aligned Length:
- 2754
- Identities:
- 2454
- Gaps:
- 39
Alignment
Query 1 ---------------------------------------ATGACTTCGGCAACTTCACCTATCATTCTGAAATG 35
|||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||
Sbjct 1 ATGACAGATATTCACTCAAGCTACACATACACAGGGAGCATGACTTCGGCAACTTCACCTATTATTTTAAAATG 74
Query 36 GGACCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACGCTAACAGTGGAAAGGCTGTTGGAGCCACTTGTTACACAGGTGACTA 109
|||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 75 GGATCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACACTCACAGTGGAAAGACTATTGGAGCCACTTGTGACACAGGTGACAA 148
Query 110 CACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGCCCATCTGGTAAAAAGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTACTAGCT 183
|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 149 CACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGTCCGTCTGGTAAAAAGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTGCTGGCA 222
Query 184 GCCTCTGTAGAGCAAGCCACTCAGAATTTCCTGGAAAAGGGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGTCAAGATCTCAA 257
||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 223 GCATCTGTAGAACAAGCTACTCAGAACTTCCTGGAAAAGGGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGCCAAGACCTCAA 296
Query 258 AGAAGAGTTGGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGCAAACAAGGTGAGACGATGCGGATCGCCTCCTCCGAGTTTG 331
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 297 AGAAGAGTTAGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGGAAGCAAGGTGAGACAATGCGGATTGCCTCCTCAGAGTTTG 370
Query 332 CAGATGACCCTTGCTCGTCGGTAAAGCGCGGCACCATGGTACGGGCGGCAAGGGCTTTGCTCTCCGCGGTGACA 405
||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||.||.||.|||.|||||.||||.||.||.||||||
Sbjct 371 CAGATGACCCTTGCTCTTCTGTCAAGCGTGGCACCATGGTGCGTGCAGCACGGGCTCTGCTATCGGCTGTGACA 444
Query 406 CGCTTACTCATCCTGGCGGACATGGCAGATGTCATGAGACTTTTATCCCATCTGAAAATTGTGGAAGAGGCCCT 479
|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||.|
Sbjct 445 CGCTTGCTCATCCTGGCCGACATGGCAGATGTCATGAGGCTTTTATCGCATCTGAAAATTGTCGAGGAGGCCTT 518
Query 480 GGAAGCTGTCAAAAATGCTACAAATGAGCAAGACCTTGCAAACCGTTTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGA 553
||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGAAGCAGTCAAAAATGCCACAAATGAACAAGACCTTGCAAACCGATTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGA 592
Query 554 AACTTAACTATGTAGCAGCAAGAAGACAACAGGAGCTGAAGGATCCTCACTGTCGGGATGAGATGGCAGCCGCC 627
||||.||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||
Sbjct 593 AACTGAACTATGTAGCAGCAAGACGGCAGCAGGAGCTCAAGGACCCTCACTGTAGGGATGAGATGGCTGCAGCC 666
Query 628 CGAGGGGCTCTGAAGAAGAATGCCACAATGCTGTACACGGCCTCTCAAGCATTTCTCCGCCACCCAGATGTCGC 701
||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 667 CGTGGAGCCCTGAAGAAGAATGCCACCATGCTGTACACAGCCTCCCAAGCCTTCCTCCGGCATCCAGATGTTGC 740
Query 702 CGCTACGAGAGCCAACCGAGATTATGTGTTCAAACAAGTCCAGGAGGCCATCGCCGGCATCTCCAATGCTGCTC 775
.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||||.||||||||
Sbjct 741 TGCTACAAGAGCCAACCGAGATTATGTATTTAAACAAGTCCAAGAGGCCATAGCTGGCATCTCCAGTGCTGCTC 814
Query 776 AAGCTACCTCGCCCACTGACGAAGCCAAGGGCCACACGGGCATCGGCGAGCTGGCTGCGGCTCTTAATGAGTTT 849
|.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 815 AGGCCACCTCCCCCACCGATGAAGCCAAAGGCCACACAGGCATCGGCGAGCTGGCTGCAGCCCTGAATGAGTTT 888
Query 850 GACAATAAGATTATCCTGGACCCCATGACGTTCAGCGAGGCCAGGTTCCGGCCGTCCCTGGAGGAGAGGCTGGA 923
||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct 889 GATAATAAGATCATCCTGGACCCCATGACATTCAGCGAGGCCAGGTTCCGACCATCCCTGGAGGAGAGACTGGA 962
Query 924 GAGCATCATCAGCGGCGCAGCGCTGATGGCCGACTCCTCCTGCACGCGAGACGACCGGCGCGAGAGGATCGTGG 997
||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||.|.||.||||
Sbjct 963 GAGCATCATCAGTGGGGCTGCTCTCATGGCAGATTCCTCCTGCACACGTGATGACCGCCGTGAGCGTATTGTGG 1036
Query 998 CGGAGTGCAACGCCGTGCGGCAGGCGCTCCAGGACCTGCTCAGCGAGTACATGAATAATACTGGAAGGAAAGAA 1071
|.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1037 CCGAGTGCAATGCAGTTCGACAGGCACTCCAGGACCTGCTAAGCGAGTACATGAATAACACTGGAAGGAAAGAG 1110
Query 1072 AAAGGAGATCCTCTCAACATTGCGATTGATAAGATGACTAAGAAAACAAGAGATCTAAGGAGACAGCTTCGGAA 1145
||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAAGGAGACCCTCTCAACATTGCGATTGACAAGATGACCAAGAAAACAAGAGATCTGAGGAGACAGCTTCGGAA 1184
Query 1146 AGCAGTGATGGATCACATATCTGACTCTTTCCTGGAAACCAATGTTCCTTTGCTAGTTCTCATTGAGGCTGCAA 1219
|||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1185 AGCTGTGATGGATCACATCTCAGATTCTTTCTTGGAAACCAATGTCCCCTTGCTGGTTCTCATTGAGGCTGCGA 1258
Query 1220 AGAGCGGAAATGAAAAGGAAGTGAAAGAATATGCCCAAGTTTTCCGTGAGCATGCCAACAAACTGGTAGAGGTT 1293
|||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1259 AGAGCGGGAATGAGAAGGAGGTGAAGGAATACGCCCAAGTTTTCCGTGAACATGCCAACAAGCTGGTGGAGGTT 1332
Query 1294 GCCAATTTGGCCTGTTCCATCTCCAACAATGAAGAAGGGGTGAAATTAGTTCGGATGGCAGCCACCCAGATTGA 1367
|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|.||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GCCAATTTGGCTTGTTCCATCTCCAACAATGAGGAAGGGGTGAAATTAGTCAGAATGGCAGCCACCCAGATTGA 1406
Query 1368 CAGCCTGTGTCCCCAGGTCATCAATGCCGCTCTGACACTGGCTGCCCGGCCACAGAGCAAAGTTGCTCAGGATA 1441
|||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1407 CAGCCTGTGTCCCCAAGTCATTAATGCTGCCCTCACACTGGCTGCTCGGCCACAGAGTAAAGTTGCTCAGGACA 1480
Query 1442 ACATGGACGTCTTCAAAGACCAGTGGGAGAAGCAGGTCCGAGTGTTGACAGAGGCCGTGGATGACATCACCTCA 1515
|||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|.||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1481 ACATGGATGTCTTCAAAGACCAGTGGGAAAAGCAAGTCCGTGTGCTCACTGAGGCAGTGGATGACATCACCTCT 1554
Query 1516 GTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAATCACATCTTGGAGGATGTGAACAAGTGTGTGATAGCCCTCCAAGA 1589
|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1555 GTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAACCATATCTTGGAGGATGTGAACAAATGTGTGATTGCCCTGCAAGA 1628
Query 1590 GGGCGATGTGGACACTCTGGACCGGACTGCAGGGGCCATCAGGGGCCGGGCAGCTCGAGTCATACACATCATCA 1663
|||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||..|||||||||||||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1629 GGGAGATGTGGACACACTGGATCGCACAGCTGGGGCCATACGGGGCCGGGCAGCCCGGGTCATTCACATCATCA 1702
Query 1664 ATGCTGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTTTATACTGAGAAGGTGTTGGAAGCTACAAAATTGCTTTCTGAA 1737
||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1703 ATGCAGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTCTATACAGAGAAAGTGCTGGAAGCCACAAAATTGCTTTCAGAA 1776
Query 1738 ACAGTGATGCCACGCTTCGCTGAACAAGTAGAGGTTGCCATTGAAGCCCTGAGTGCCAACGTTCCTCAACCGTT 1811
|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||
Sbjct 1777 ACAGTGATGCCACGCTTTGCTGAACAAGTTGAGGTGGCCATCGAAGCCCTGAGCGCCAATGTCCCTCAGCCATT 1850
Query 1812 TGAGGAGAATGAGTTCATCGATGCCTCTCGCCTGGTGTATGATGGCGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGA 1885
.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 CGAGGAGAACGAGTTCATCGATGCCTCGCGCCTGGTGTATGACGGTGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGA 1924
Query 1886 TGATCAGGACCCCAGAAGAACTAGAGGATGATTCTGACTTTGAGCAAGAAGATTATGATGTGCGTAGCAGGACA 1959
||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||..|||||
Sbjct 1925 TGATCAGGACTCCAGAAGAGCTAGAAGATGATTCCGACTTTGAGCAAGAGGATTATGATGTGCGGAGTCGGACA 1998
Query 1960 AGTGTTCAGACTGAGGATGACCAGCTCATTGCAGGGCAGAGCGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCGCAGGA 2033
|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1999 AGTGTTCAGACAGAGGACGACCAGCTCATTGCTGGACAGAGTGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCACAGGA 2072
Query 2034 GGAGAAGGCAAAAATAGCTGAGCAGGTGGAGATATTCCATCAAGAGAAAAGCAAGCTGGATGCAGAAGTGGCCA 2107
||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2073 GGAGAAAGCAAAAATAGCTGAACAGGTGGAGATTTTCCACCAAGAAAAAAGCAAGCTGGATGCTGAAGTGGCCA 2146
Query 2108 AATGGGACGACAGCGGCAATGATATCATTGTACTGGCCAAGCAGATGTGTATGATCATGATGGAAATGACAGAC 2181
|.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2147 AGTGGGATGACAGCGGCAATGACATCATTGTGCTGGCCAAGCAGATGTGTATGATCATGATGGAGATGACAGAC 2220
Query 2182 TTCACAAGAGGCAAAGGCCCATTGAAAAATACATCTGATGTCATTAATGCTGCCAAGAAAATTGCCGAAGCAGG 2255
|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 2221 TTCACAAGAGGCAAAGGCCCACTGAAAAATACATCTGATGTCATTAATGCTGCCAAGAAGATTGCAGAAGCAGG 2294
Query 2256 TTCTCGAATGGACAAATTAGCTCGTGCTGTGGCTGATCAGTGTCCTGATTCAGCATGTAAGCAGGATTTATTAG 2329
.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CTCTCGAATGGACAAATTAGCGCGCGCTGTGGCTGATCAGTGTCCTGATTCAGCATGTAAGCAGGATTTATTAG 2368
Query 2330 CCTACCTTCAACGAATTGCCTTGTATTGCCATCAGCTTAATATCTGCAGCAAGGTGAAGGCAGAAGTGCAGAAT 2403
||||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 2369 CCTACCTTCAGCGGATTGCTTTGTACTGCCATCAGCTTAACATCTGCAGCAAAGTGAAGGCCGAGGTTCAGAAC 2442
Query 2404 CTGGGAGGAGAGCTCATTGTGTCAGGGCTGGACAGTGCCACATCGCTTATCCAGGCAGCTAAAAACCTGATGAA 2477
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2443 CTAGGAGGAGAGCTCATTGTGTCAGGGCTGGACAGTGCTACATCACTCATCCAGGCAGCCAAAAACCTGATGAA 2516
Query 2478 TGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCATCCTATGTGGCCTCAACCAAATACCAGAAGGTCTATGGGACAGCAGCTG 2551
||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2517 TGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCGTCTTATGTAGCCTCAACTAAATACCAGAAGGTCTATGGAACAGCAGCTG 2590
Query 2552 TCAACTCACCTGTTGTGTCTTGGAAGATGAAGGCTCCAGAGAAGAAGCCCCTTGTGAAGAGAGAAAAGCCTGAA 2625
|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 TCAACTCTCCAGTTGTGTCTTGGAAGATGAAGGCTCCTGAAAAGAAGCCCCTTGTGAAGAGAGAAAAGCCTGAA 2664
Query 2626 GAATTCCAGACACGAGTTCGACGAGGTTCTCAGAAGAAACACATTTCGCCTGTACAGGCTTTAAGTGAATTCAA 2699
||||||||||||.|||||.||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GAATTCCAGACAAGAGTTAGACGGGGGTCTCAAAAGAAACACATTTCACCTGTGCAGGCTTTAAGTGAATTCAA 2738
Query 2700 AGCAATGGATTCCTTC 2715
.|||||||||||||||
Sbjct 2739 GGCAATGGATTCCTTC 2754