Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06063
- Subject:
- XM_011532555.2
- Aligned Length:
- 2859
- Identities:
- 2714
- Gaps:
- 144
Alignment
Query 1 ATGACTTCGGCAACTTCACCTATCATTCTGAAATGGGACCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACGCTAACAGTGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACTTCGGCAACTTCACCTATCATTCTGAAATGGGACCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACGCTAACAGTGGA 74
Query 75 AAGGCTGTTGGAGCCACTTGTTACACAGGTGACTACACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGCCCATCTGGTAAAA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAGGCTGTTGGAGCCACTTGTTACACAGGTGACTACACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGCCCATCTGGTAAAA 148
Query 149 AGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTACTAGCTGCCTCTGTAGAGCAAGCCACTCAGAATTTCCTGGAAAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTACTAGCTGCCTCTGTAGAGCAAGCCACTCAGAATTTCCTGGAAAAG 222
Query 223 GGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGTCAAGATCTCAAAGAAGAGTTGGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGCAAACA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGTCAAGATCTCAAAGAAGAGTTGGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGCAAACA 296
Query 297 AGGTGAGACGATGCGGATCGCCTCCTCCGAGTTTGCAGATGACCCTTGCTCGTCGGTAAAGCGCGGCACCATGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGGTGAGACGATGCGGATCGCCTCCTCCGAGTTTGCAGATGACCCTTGCTCGTCGGTAAAGCGCGGCACCATGG 370
Query 371 TACGGGCGGCAAGGGCTTTGCTCTCCGCGGTGACACGCTTACTCATCCTGGCGGACATGGCAGATGTCATGAGA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TACGGGCGGCAAGGGCTTTGCTCTCCGCGGTGACACGCTTACTCATCCTGGCGGACATGGCAGATGTCATGAGA 444
Query 445 CTTTTATCCCATCTGAAAATTGTGGAAGAGGCCCTGGAAGCTGTCAAAAATGCTACAAATGAGCAAGACCTTGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTTTTATCCCATCTGAAAATTGTGGAAGAGGCCCTGGAAGCTGTCAAAAATGCTACAAATGAGCAAGACCTTGC 518
Query 519 AAACCGTTTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGAAACTTAACTATGTAGCAGCAAGAAGACAACAGGAGCTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 AAACCGTTTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGAAACTTAACTATGTAGCAGCAAGAAGACAACAGGAGCTGA 592
Query 593 AGGATCCTCACTGTCGGGATGAGATGGCAGCCGCCCGAGGGGCTCTGAAGAAGAATGCCACAATGCTGTACACG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGGATCCTCACTGTCGGGATGAGATGGCAGCCGCCCGAGGGGCTCTGAAGAAGAATGCCACAATGCTGTACACG 666
Query 667 GCCTCTCAAGCATTTCTCCGCCACCCAGATGTCGCCGCTACGAGAGCCAACCGAGATTATGTGTTCAAACAAGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCCTCTCAAGCATTTCTCCGCCACCCAGATGTCGCCGCTACGAGAGCCAACCGAGATTATGTGTTCAAACAAGT 740
Query 741 CCAGGAGGCCATCGCCGGCATCTCCAATGCTGCTCAAGCTACCTCGCCCACTGACGAAGCCAAGGGCCACACGG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCAGGAGGCCATCGCCGGCATCTCCAATGCTGCTCAAGCTACCTCGCCCACTGACGAAGCCAAGGGCCACACGG 814
Query 815 GCATCGGCGAGCTGGCTGCGGCTCTTAATGAGTTTGACAATAAGATTATCCTGGACCCCATGACGTTCAGCGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCATCGGCGAGCTGGCTGCGGCTCTTAATGAGTTTGACAATAAGATTATCCTGGACCCCATGACGTTCAGCGAG 888
Query 889 GCCAGGTTCCGGCCGTCCCTGGAGGAGAGGCTGGAGAGCATCATCAGCGGCGCAGCGCTGATGGCCGACTCCTC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GCCAGGTTCCGGCCGTCCCTGGAGGAGAGGCTGGAGAGCATCATCAGCGGCGCAGCGCTGATGGCCGACTCCTC 962
Query 963 CTGCACGCGAGACGACCGGCGCGAGAGGATCGTGGCGGAGTGCAACGCCGTGCGGCAGGCGCTCCAGGACCTGC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTGCACGCGAGACGACCGGCGCGAGAGGATCGTGGCGGAGTGCAACGCCGTGCGGCAGGCGCTCCAGGACCTGC 1036
Query 1037 TCAGCGAGTACATGAATAATACTGGAAGGAAAGAAAAAGGAGATCCTCTCAACATTGCGATTGATAAGATGACT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCAGCGAGTACATGAATAATACTGGAAGGAAAGAAAAAGGAGATCCTCTCAACATTGCGATTGATAAGATGACT 1110
Query 1111 AAGAAAACAAGAGATCTAAGGAGACAGCTTCGGAAAGCAGTGATGGATCACATATCTGACTCTTTCCTGGAAAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGAAAACAAGAGATCTAAGGAGACAGCTTCGGAAAGCAGTGATGGATCACATATCTGACTCTTTCCTGGAAAC 1184
Query 1185 CAATGTTCCTTTGCTAGTTCTCATTGAGGCTGCAAAGAGCGGAAATGAAAAGGAAGTGAAAGAATATGCCCAAG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAATGTTCCTTTGCTAGTTCTCATTGAGGCTGCAAAGAGCGGAAATGAAAAGGAAGTGAAAGAATATGCCCAAG 1258
Query 1259 TTTTCCGTGAGCATGCCAACAAACTGGTAGAGGTTGCCAATTTGGCCTGTTCCATCTCCAACAATGAAGAAGGG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTTTCCGTGAGCATGCCAACAAACTGGTAGAGGTTGCCAATTTGGCCTGTTCCATCTCCAACAATGAAGAAGGG 1332
Query 1333 GTGAAATTAGTTCGGATGGCAGCCACCCAGATTGACAGCCTGTGTCCCCAGGTCATCAATGCCGCTCTGACACT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GTGAAATTAGTTCGGATGGCAGCCACCCAGATTGACAGCCTGTGTCCCCAGGTCATCAATGCCGCTCTGACACT 1406
Query 1407 GGCTGCCCGGCCACAGAGCAAAGTTGCTCAGGATAACATGGACGTCTTCAAAGACCAGTGGGAGAAGCAGGTCC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGCTGCCCGGCCACAGAGCAAAGTTGCTCAGGATAACATGGACGTCTTCAAAGACCAGTGGGAGAAGCAGGTCC 1480
Query 1481 GAGTGTTGACAGAGGCCGTGGATGACATCACCTCAGTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAATCACATCTTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 GAGTGTTGACAGAGGCCGTGGATGACATCACCTCAGTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAATCACATCTTG 1554
Query 1555 GAGGATGTGAACAAGTGTGTGATAGCCCTCCAAGAGGGCGATGTGGACACTCTGGACCGGACTGCAGGGGCCAT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GAGGATGTGAACAAGTGTGTGATAGCCCTCCAAGAGGGCGATGTGGACACTCTGGACCGGACTGCAGGGGCCAT 1628
Query 1629 CAGGGGCCGGGCAGCTCGAGTCATACACATCATCAATGCTGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTTTATACTG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CAGGGGCCGGGCAGCTCGAGTCATACACATCATCAATGCTGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTTTATACTG 1702
Query 1703 AGAAGGTGTTGGAAGCTACAAAATTGCTTTCTGAAACAGTGATGCCACGCTTCGCTGAACAAGTAGAGGTTGCC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AGAAGGTGTTGGAAGCTACAAAATTGCTTTCTGAAACAGTGATGCCACGCTTCGCTGAACAAGTAGAGGTTGCC 1776
Query 1777 ATTGAAGCCCTGAGTGCCAACGTTCCTCAACCGTTTGAGGAGAATGAGTTCATCGATGCCTCTCGCCTGGTGTA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 ATTGAAGCCCTGAGTGCCAACGTTCCTCAACCGTTTGAGGAGAATGAGTTCATCGATGCCTCTCGCCTGGTGTA 1850
Query 1851 TGATGGCGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGATGATCAGGACCCCAGAAGAACTAGAGGATGATTCTGACT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGATGGCGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGATGATCAGGACCCCAGAAGAACTAGAGGATGATTCTGACT 1924
Query 1925 TTGAGCAAGAAGATTATGATGTGCGTAGCAGGACAAGTGTTCAGACTGAGGATGACCAGCTCATTGCAGGGCAG 1998
|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 TTGAGCAGGAAGATTATGATGTGCGTAGCAGGACAAGTGTTCAGACTGAGGATGACCAGCTCATTGCAGGGCAG 1998
Query 1999 AGCGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCGCAGGAGGAGAAGGCAAAAATAGCTGAGCAGGTGGAGATATTCCA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 AGCGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCGCAGGAGGAGAAGGCAAAAATAGCTGAGCAGGTGGAGATATTCCA 2072
Query 2073 TCAAGAGAAAAGCAAGCTGGATGCAGAAGTGGCCAAATGGGACGACAGCGGCAATGATATCATTGTACTGGCCA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TCAAGAGAAAAGCAAGCTGGATGCAGAAGTGGCCAAATGGGACGACAGCGGCAATGATATCATTGTACTGGCCA 2146
Query 2147 AGCAGATGTGTATGATCATGATGGAAATGACAGACTTCACAAGAGGCAAAGGCCCATTGAAAAATACATCTGAT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AGCAGATGTGTATGATCATGATGGAAATGACAGACTTCACAAGAGGCAAAGGCCCATTGAAAAATACATCTGAT 2220
Query 2221 GTCATTAATGCTGCCAAGAAAATTGCCGAAGCAGGTTCTCGAATGGACAAATTAGCTCGTGCTGTGGCTGATCA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GTCATTAATGCTGCCAAGAAAATTGCCGAAGCAGGTTCTCGAATGGACAAATTAGCTCGTGCTGTGGCTGATCA 2294
Query 2295 GTGTCCTGATTCAGCATGTAAGCAGGATTTATTAGCCTACCTTCAACGAATTGCCTTGTATTGCCATCAGCTTA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GTGTCCTGATTCAGCATGTAAGCAGGATTTATTAGCCTACCTTCAACGAATTGCCTTGTATTGCCATCAGCTTA 2368
Query 2369 ATATCTGCAGCAAGGTGAAGGCAGAAGTGCAGAATCTGGGAGGAGAGCTCATTGTGTCAGG------------- 2429
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 ATATCTGCAGCAAGGTGAAGGCAGAAGTGCAGAATCTGGGAGGAGAGCTCATTGTGTCAGGGACAGGAGTTCAG 2442
Query 2430 -------------------------------------------------------------------------- 2429
Sbjct 2443 AGCACTTTCACTACCTTTTATGAGGTAGATTGTGATGTCATAGATGGGGGCAGGGCTAGTCAACTTTCTACCCA 2516
Query 2430 ---------------------------------------------------------GCTGGACAGTGCCACAT 2446
|||||||||||||||||
Sbjct 2517 CCTCCCAACCTGTGCTGAGGGAGCTCCGATCGGGAGTGGAAGCAGTGATTCCTCCATGCTGGACAGTGCCACAT 2590
Query 2447 CGCTTATCCAGGCAGCTAAAAACCTGATGAATGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCATCCTATGTGGCCTCAACC 2520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CGCTTATCCAGGCAGCTAAAAACCTGATGAATGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCATCCTATGTGGCCTCAACC 2664
Query 2521 AAATACCAGAAGGTCTATGGGACAGCAGCTGTCAACTCACCTGTTGTGTCTTGGAAGATGAAGGCTCCAGAGAA 2594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 AAATACCAGAAGGTCTATGGGACAGCAGCTGTCAACTCACCTGTTGTGTCTTGGAAGATGAAGGCTCCAGAGAA 2738
Query 2595 GAAGCCCCTTGTGAAGAGAGAAAAGCCTGAAGAATTCCAGACACGAGTTCGACGAGGTTCTCAGAAGAAACACA 2668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 GAAGCCCCTTGTGAAGAGAGAAAAGCCTGAAGAATTCCAGACACGAGTTCGACGAGGTTCTCAGAAGAAACACA 2812
Query 2669 TTTCGCCTGTACAGGCTTTAAGTGAATTCAAAGCAATGGATTCCTTC 2715
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TTTCGCCTGTACAGGCTTTAAGTGAATTCAAAGCAATGGATTCCTTC 2859