Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06063
- Subject:
- XM_017321372.1
- Aligned Length:
- 2715
- Identities:
- 2454
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGACTTCGGCAACTTCACCTATCATTCTGAAATGGGACCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACGCTAACAGTGGA 74
|||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1 ATGACTTCGGCAACTTCACCTATTATTTTAAAATGGGATCCCAAAAGTTTGGAAATCCGGACACTCACAGTGGA 74
Query 75 AAGGCTGTTGGAGCCACTTGTTACACAGGTGACTACACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGCCCATCTGGTAAAA 148
|||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 75 AAGACTATTGGAGCCACTTGTGACACAGGTGACAACACTTGTCAACACAAGCAACAAAGGTCCGTCTGGTAAAA 148
Query 149 AGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTACTAGCTGCCTCTGTAGAGCAAGCCACTCAGAATTTCCTGGAAAAG 222
||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 149 AGAAAGGGAGGTCAAAGAAAGCCCATGTGCTGGCAGCATCTGTAGAACAAGCTACTCAGAACTTCCTGGAAAAG 222
Query 223 GGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGTCAAGATCTCAAAGAAGAGTTGGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGCAAACA 296
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 223 GGTGAACAGATCGCTAAGGAGAGCCAAGACCTCAAAGAAGAGTTAGTGGCTGCTGTAGAGGATGTGCGGAAGCA 296
Query 297 AGGTGAGACGATGCGGATCGCCTCCTCCGAGTTTGCAGATGACCCTTGCTCGTCGGTAAAGCGCGGCACCATGG 370
|||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 297 AGGTGAGACAATGCGGATTGCCTCCTCAGAGTTTGCAGATGACCCTTGCTCTTCTGTCAAGCGTGGCACCATGG 370
Query 371 TACGGGCGGCAAGGGCTTTGCTCTCCGCGGTGACACGCTTACTCATCCTGGCGGACATGGCAGATGTCATGAGA 444
|.||.||.|||.|||||.||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 TGCGTGCAGCACGGGCTCTGCTATCGGCTGTGACACGCTTGCTCATCCTGGCCGACATGGCAGATGTCATGAGG 444
Query 445 CTTTTATCCCATCTGAAAATTGTGGAAGAGGCCCTGGAAGCTGTCAAAAATGCTACAAATGAGCAAGACCTTGC 518
||||||||.||||||||||||||.||.||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 CTTTTATCGCATCTGAAAATTGTCGAGGAGGCCTTGGAAGCAGTCAAAAATGCCACAAATGAACAAGACCTTGC 518
Query 519 AAACCGTTTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGAAACTTAACTATGTAGCAGCAAGAAGACAACAGGAGCTGA 592
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||.||||||||.|
Sbjct 519 AAACCGATTTAAAGAGTTTGGGAAAGAGATGGTGAAACTGAACTATGTAGCAGCAAGACGGCAGCAGGAGCTCA 592
Query 593 AGGATCCTCACTGTCGGGATGAGATGGCAGCCGCCCGAGGGGCTCTGAAGAAGAATGCCACAATGCTGTACACG 666
||||.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 593 AGGACCCTCACTGTAGGGATGAGATGGCTGCAGCCCGTGGAGCCCTGAAGAAGAATGCCACCATGCTGTACACA 666
Query 667 GCCTCTCAAGCATTTCTCCGCCACCCAGATGTCGCCGCTACGAGAGCCAACCGAGATTATGTGTTCAAACAAGT 740
|||||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 667 GCCTCCCAAGCCTTCCTCCGGCATCCAGATGTTGCTGCTACAAGAGCCAACCGAGATTATGTATTTAAACAAGT 740
Query 741 CCAGGAGGCCATCGCCGGCATCTCCAATGCTGCTCAAGCTACCTCGCCCACTGACGAAGCCAAGGGCCACACGG 814
|||.||||||||.||.||||||||||.|||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct 741 CCAAGAGGCCATAGCTGGCATCTCCAGTGCTGCTCAGGCCACCTCCCCCACCGATGAAGCCAAAGGCCACACAG 814
Query 815 GCATCGGCGAGCTGGCTGCGGCTCTTAATGAGTTTGACAATAAGATTATCCTGGACCCCATGACGTTCAGCGAG 888
|||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 815 GCATCGGCGAGCTGGCTGCAGCCCTGAATGAGTTTGATAATAAGATCATCCTGGACCCCATGACATTCAGCGAG 888
Query 889 GCCAGGTTCCGGCCGTCCCTGGAGGAGAGGCTGGAGAGCATCATCAGCGGCGCAGCGCTGATGGCCGACTCCTC 962
|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||.|||||
Sbjct 889 GCCAGGTTCCGACCATCCCTGGAGGAGAGACTGGAGAGCATCATCAGTGGGGCTGCTCTCATGGCAGATTCCTC 962
Query 963 CTGCACGCGAGACGACCGGCGCGAGAGGATCGTGGCGGAGTGCAACGCCGTGCGGCAGGCGCTCCAGGACCTGC 1036
||||||.||.||.|||||.||.|||.|.||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 963 CTGCACACGTGATGACCGCCGTGAGCGTATTGTGGCCGAGTGCAATGCAGTTCGACAGGCACTCCAGGACCTGC 1036
Query 1037 TCAGCGAGTACATGAATAATACTGGAAGGAAAGAAAAAGGAGATCCTCTCAACATTGCGATTGATAAGATGACT 1110
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1037 TAAGCGAGTACATGAATAACACTGGAAGGAAAGAGAAAGGAGACCCTCTCAACATTGCGATTGACAAGATGACC 1110
Query 1111 AAGAAAACAAGAGATCTAAGGAGACAGCTTCGGAAAGCAGTGATGGATCACATATCTGACTCTTTCCTGGAAAC 1184
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||.|||||||
Sbjct 1111 AAGAAAACAAGAGATCTGAGGAGACAGCTTCGGAAAGCTGTGATGGATCACATCTCAGATTCTTTCTTGGAAAC 1184
Query 1185 CAATGTTCCTTTGCTAGTTCTCATTGAGGCTGCAAAGAGCGGAAATGAAAAGGAAGTGAAAGAATATGCCCAAG 1258
||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 1185 CAATGTCCCCTTGCTGGTTCTCATTGAGGCTGCGAAGAGCGGGAATGAGAAGGAGGTGAAGGAATACGCCCAAG 1258
Query 1259 TTTTCCGTGAGCATGCCAACAAACTGGTAGAGGTTGCCAATTTGGCCTGTTCCATCTCCAACAATGAAGAAGGG 1332
||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259 TTTTCCGTGAACATGCCAACAAGCTGGTGGAGGTTGCCAATTTGGCTTGTTCCATCTCCAACAATGAGGAAGGG 1332
Query 1333 GTGAAATTAGTTCGGATGGCAGCCACCCAGATTGACAGCCTGTGTCCCCAGGTCATCAATGCCGCTCTGACACT 1406
|||||||||||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 1333 GTGAAATTAGTCAGAATGGCAGCCACCCAGATTGACAGCCTGTGTCCCCAAGTCATTAATGCTGCCCTCACACT 1406
Query 1407 GGCTGCCCGGCCACAGAGCAAAGTTGCTCAGGATAACATGGACGTCTTCAAAGACCAGTGGGAGAAGCAGGTCC 1480
||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1407 GGCTGCTCGGCCACAGAGTAAAGTTGCTCAGGACAACATGGATGTCTTCAAAGACCAGTGGGAAAAGCAAGTCC 1480
Query 1481 GAGTGTTGACAGAGGCCGTGGATGACATCACCTCAGTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAATCACATCTTG 1554
|.|||.|.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1481 GTGTGCTCACTGAGGCAGTGGATGACATCACCTCTGTGGATGACTTCCTCTCTGTCTCAGAAAACCATATCTTG 1554
Query 1555 GAGGATGTGAACAAGTGTGTGATAGCCCTCCAAGAGGGCGATGTGGACACTCTGGACCGGACTGCAGGGGCCAT 1628
||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1555 GAGGATGTGAACAAATGTGTGATTGCCCTGCAAGAGGGAGATGTGGACACACTGGATCGCACAGCTGGGGCCAT 1628
Query 1629 CAGGGGCCGGGCAGCTCGAGTCATACACATCATCAATGCTGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTTTATACTG 1702
..|||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1629 ACGGGGCCGGGCAGCCCGGGTCATTCACATCATCAATGCAGAGATGGAGAACTATGAAGCTGGGGTCTATACAG 1702
Query 1703 AGAAGGTGTTGGAAGCTACAAAATTGCTTTCTGAAACAGTGATGCCACGCTTCGCTGAACAAGTAGAGGTTGCC 1776
||||.|||.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1703 AGAAAGTGCTGGAAGCCACAAAATTGCTTTCAGAAACAGTGATGCCACGCTTTGCTGAACAAGTTGAGGTGGCC 1776
Query 1777 ATTGAAGCCCTGAGTGCCAACGTTCCTCAACCGTTTGAGGAGAATGAGTTCATCGATGCCTCTCGCCTGGTGTA 1850
||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777 ATCGAAGCCCTGAGCGCCAATGTCCCTCAGCCATTCGAGGAGAACGAGTTCATCGATGCCTCGCGCCTGGTGTA 1850
Query 1851 TGATGGCGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGATGATCAGGACCCCAGAAGAACTAGAGGATGATTCTGACT 1924
|||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 1851 TGACGGTGTTCGGGACATCAGAAAGGCTGTGCTGATGATCAGGACTCCAGAAGAGCTAGAAGATGATTCCGACT 1924
Query 1925 TTGAGCAAGAAGATTATGATGTGCGTAGCAGGACAAGTGTTCAGACTGAGGATGACCAGCTCATTGCAGGGCAG 1998
||||||||||.||||||||||||||.||..||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1925 TTGAGCAAGAGGATTATGATGTGCGGAGTCGGACAAGTGTTCAGACAGAGGACGACCAGCTCATTGCTGGACAG 1998
Query 1999 AGCGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCGCAGGAGGAGAAGGCAAAAATAGCTGAGCAGGTGGAGATATTCCA 2072
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1999 AGTGCACGGGCCATCATGGCGCAACTACCACAGGAGGAGAAAGCAAAAATAGCTGAACAGGTGGAGATTTTCCA 2072
Query 2073 TCAAGAGAAAAGCAAGCTGGATGCAGAAGTGGCCAAATGGGACGACAGCGGCAATGATATCATTGTACTGGCCA 2146
.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 2073 CCAAGAAAAAAGCAAGCTGGATGCTGAAGTGGCCAAGTGGGATGACAGCGGCAATGACATCATTGTGCTGGCCA 2146
Query 2147 AGCAGATGTGTATGATCATGATGGAAATGACAGACTTCACAAGAGGCAAAGGCCCATTGAAAAATACATCTGAT 2220
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 2147 AGCAGATGTGTATGATCATGATGGAGATGACAGACTTCACAAGAGGCAAAGGCCCACTGAAAAATACATCTGAT 2220
Query 2221 GTCATTAATGCTGCCAAGAAAATTGCCGAAGCAGGTTCTCGAATGGACAAATTAGCTCGTGCTGTGGCTGATCA 2294
||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 2221 GTCATTAATGCTGCCAAGAAGATTGCAGAAGCAGGCTCTCGAATGGACAAATTAGCGCGCGCTGTGGCTGATCA 2294
Query 2295 GTGTCCTGATTCAGCATGTAAGCAGGATTTATTAGCCTACCTTCAACGAATTGCCTTGTATTGCCATCAGCTTA 2368
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 2295 GTGTCCTGATTCAGCATGTAAGCAGGATTTATTAGCCTACCTTCAGCGGATTGCTTTGTACTGCCATCAGCTTA 2368
Query 2369 ATATCTGCAGCAAGGTGAAGGCAGAAGTGCAGAATCTGGGAGGAGAGCTCATTGTGTCAGGGCTGGACAGTGCC 2442
|.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2369 ACATCTGCAGCAAAGTGAAGGCCGAGGTTCAGAACCTAGGAGGAGAGCTCATTGTGTCAGGGCTGGACAGTGCT 2442
Query 2443 ACATCGCTTATCCAGGCAGCTAAAAACCTGATGAATGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCATCCTATGTGGCCTC 2516
|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct 2443 ACATCACTCATCCAGGCAGCCAAAAACCTGATGAATGCTGTTGTCCTCACGGTGAAAGCGTCTTATGTAGCCTC 2516
Query 2517 AACCAAATACCAGAAGGTCTATGGGACAGCAGCTGTCAACTCACCTGTTGTGTCTTGGAAGATGAAGGCTCCAG 2590
|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2517 AACTAAATACCAGAAGGTCTATGGAACAGCAGCTGTCAACTCTCCAGTTGTGTCTTGGAAGATGAAGGCTCCTG 2590
Query 2591 AGAAGAAGCCCCTTGTGAAGAGAGAAAAGCCTGAAGAATTCCAGACACGAGTTCGACGAGGTTCTCAGAAGAAA 2664
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||.||.|||||.||||||
Sbjct 2591 AAAAGAAGCCCCTTGTGAAGAGAGAAAAGCCTGAAGAATTCCAGACAAGAGTTAGACGGGGGTCTCAAAAGAAA 2664
Query 2665 CACATTTCGCCTGTACAGGCTTTAAGTGAATTCAAAGCAATGGATTCCTTC 2715
||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2665 CACATTTCACCTGTGCAGGCTTTAAGTGAATTCAAGGCAATGGATTCCTTC 2715