Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06073
- Subject:
- NM_001202855.3
- Aligned Length:
- 1509
- Identities:
- 1422
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGATCTCATCCCAAACTTGGCCGTGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGATACTCCTCTATCTATA 74
||||.||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTCTCATCCCAGACTTGGCCATGGAAACCTGGCTTCTCCTGGCTGTCAGCCTGGTGCTCCTCTATCTATA 74
Query 75 TGGAACCCGTACACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTTTTGGGAAATG 148
||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 75 TGGAACCCATTCACATGGACTTTTTAAGAAGCTTGGAATTCCAGGGCCCACACCTCTGCCTTTTTTGGGAAATA 148
Query 149 CTTTGTCCTTCCGTAAGGGCTATTGGACGTTTGACATGGAATGTTATAAAAAGTATAGAAAAGTCTGGGGTATT 222
.||||||||.||.||||||||.|||.|.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||.|||||..||
Sbjct 149 TTTTGTCCTACCATAAGGGCTTTTGTATGTTTGACATGGAATGTCATAAAAAGTATGGAAAAGTGTGGGGCTTT 222
Query 223 TATGACTGTCAACAGCCTATGCTGGCTATCACAGATCCCGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA 296
|||||..|||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TATGATGGTCAACAGCCTGTGCTGGCTATCACAGATCCTGACATGATCAAAACAGTGCTAGTGAAAGAATGTTA 296
Query 297 TTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTCGGGCCAGTGGGATTTATGAAAAATGCCATCTCTATAGCTGAGGATG 370
|||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTCTGTCTTCACAAACCGGAGGCCTTTTGGTCCAGTGGGATTTATGAAAAGTGCCATCTCTATAGCTGAGGATG 370
Query 371 AAGAATGGAAGAGAATACGATCATTGCTGTCTCCAACATTCACCAGCGGAAAACTCAAGGAGATGGTCCCTATC 444
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGAATGGAAGAGATTACGATCATTGCTGTCTCCAACCTTCACCAGTGGAAAACTCAAGGAGATGGTCCCTATC 444
Query 445 ATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTGCCCAGTATGGAGATGTGTTGGTGAGAAATCTGAGGCGGGAAGCAGAGACAGGCAAGCCTGTCACCTTGAA 518
Query 519 ACACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAGCATCGACTCTCTCAACA 592
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 519 AGACGTCTTTGGGGCCTACAGCATGGATGTGATCACTAGCACATCATTTGGAGTGAACATCGACTCTCTCAACA 592
Query 593 ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTAATCCATTAGATCCATTCGTTCTCTCA 666
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||...||.|||||||||.||||||||
Sbjct 593 ATCCACAAGACCCCTTTGTGGAAAACACCAAGAAGCTTTTAAGATTTGATTTTTTGGATCCATTCTTTCTCTCA 666
Query 667 ATAAAAGTCTTTCCATTCCTTACCCCAATTCTTGAAGCATTAAATATCACTGTGTTTCCAAGAAAAGTTATAAG 740
|||| |||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||||.||||||.||.
Sbjct 667 ATAA---TCTTTCCATTCCTCATCCCAATTCTTGAAGTATTAAATATCTGTGTGTTTCCAAGAGAAGTTACAAA 737
Query 741 TTTTCTAACAAAATCTGTAAAACAGATAAAAGAAGGTCGCCTCAAAGAGACACAAAAGCACCGAGTGGATTTCC 814
||||.|||.|||||||||||||..|||.||||||.||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 738 TTTTTTAAGAAAATCTGTAAAAAGGATGAAAGAAAGTCGCCTCGAAGATACACAAAAGCACCGAGTGGATTTCC 811
Query 815 TTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGACTCTGAGACCCACAAAGCTCTGTCTGATCTGGAGCTCATG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 812 TTCAGCTGATGATTGACTCTCAGAATTCAAAAGAAACTGAGTCCCACAAAGCTCTGTCCGATCTGGAGCTCGTG 885
Query 889 GCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCTTTCATTATATATGAACT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 886 GCCCAATCAATTATCTTTATTTTTGCTGGCTATGAAACCACGAGCAGTGTTCTCTCCTTCATTATGTATGAACT 959
Query 963 GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAAGTGCAGAAGGAAATTGATACAGTTTTACCCAATAAGGCACCACCCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 960 GGCCACTCACCCTGATGTCCAGCAGAAACTGCAGGAGGAAATTGATGCAGTTTTACCCAATAAGGCACCACCCA 1033
Query 1037 CCTATGATACTGTGCTACAGTTGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACACTCAGATTATTCCCAGTTGCT 1110
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
Sbjct 1034 CCTATGATACTGTGCTACAGATGGAGTATCTTGACATGGTGGTGAATGAAACGCTCAGATTATTCCCAATTGCT 1107
Query 1111 ATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAAATCAATGGGATGTTTATTCCCAAAGGGGTGGTGGTGAT 1184
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 ATGAGACTTGAGAGGGTCTGCAAAAAAGATGTTGAGATCAATGGGATGTTCATTCCCAAAGGGGTGGTGGTGAT 1181
Query 1185 GATTCCAAGCTATGTTCTTCATCATGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTCCCTGAAAGGTTCA 1258
||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1182 GATTCCAAGCTATGCTCTTCACCGTGACCCAAAGTACTGGACAGAGCCTGAGAAGTTCCTCCCTGAAAGATTCA 1255
Query 1259 GTAAAAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAAACTGCATTGGC 1332
|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 GCAAGAAGAACAAGGACAACATAGATCCTTACATATACACACCCTTTGGAAGTGGACCCAGAAACTGCATTGGC 1329
Query 1333 ATGAGGTTTGCTCTCGTGAACATGAAACTTGCTCTAGTCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTGTAA 1406
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 ATGAGGTTTGCTCTCATGAACATGAAACTTGCTCTAATCAGAGTCCTTCAGAACTTCTCCTTCAAACCTTGTAA 1403
Query 1407 AGAAACACAGATCCCCCTGAAATTACGCTTTGGAGGACTTCTTCTAACAGAAAAACCCATTGTTCTAAAGGCTG 1480
|||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 1404 AGAAACACAGATCCCCCTGAAATTAAGCTTAGGAGGACTTCTTCAACCAGAAAAACCCGTTGTTCTAAAGGTTG 1477
Query 1481 AGTCAAGGGATGAGACCGTAAGTGGAGCC 1509
||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct 1478 AGTCAAGGGATGGCACCGTAAGTGGAGCC 1506