Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_06086
Subject:
NM_001135041.2
Aligned Length:
1139
Identities:
1136
Gaps:
0

Alignment

Query    1  MMRQAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVP  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MMRQAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVP  74

Query   75  PLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKE  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  PLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKE  148

Query  149  AKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAAS  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAAS  222

Query  223  SYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQV  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  SYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQV  296

Query  297  DAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVE  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  DAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVE  370

Query  371  AAQETVADYQQTIKKYRQLTANLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEV  444
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEV  444

Query  445  AQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICRAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSF  518
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSF  518

Query  519  AAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKY  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKY  592

Query  593  YQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKK  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  YQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKK  666

Query  667  IRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKAS  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  IRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKAS  740

Query  741  EQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDR  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  EQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDR  814

Query  815  ETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQAD  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQAD  888

Query  889  IDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMR  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  IDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMR  962

Query  963  LHISQLQHENSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTS  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  LHISQLQHENSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTS  1036

Query 1037  PAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  PAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVT  1110

Query 1111  FSCAAGFGQRHRLVLTQEQLHQLHIRLIS  1139
            ||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1111  FSCAAGFGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS  1139