Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06086
• Subject: NM_001190836.1
• Aligned Length: 1238
• Identities: 1123
• Gaps: 101

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQGRKYFTCDEGHGIFVRQ  74

Query    1  ------------------------MMRQAPTARKTTTRRPK-PTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEP  49
                                    ......|  .||....| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  SQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGT--DTTAKTSKLPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEP  146

Query   50  STPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQ  123
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  STPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQ  220

Query  124  VQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKER  197
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  VQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKER  294

Query  198  VDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVV  271
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  VDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVV  368

Query  272  RQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENAR  345
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  RQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENAR  442

Query  346  ETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTANLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETF  419
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  ETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETF  516

Query  420  DFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICRAELIRKQAQ  493
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  517  DFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQ  590

Query  494  EKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDF  567
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  EKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDF  664

Query  568  LIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQ  641
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  LIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQ  738

Query  642  EATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAA  715
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  EATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAA  812

Query  716  QLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPP  789
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  QLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPP  886

Query  790  VELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTR  863
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  VELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTR  960

Query  864  LEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGGAIPGQ  937
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  LEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGGAIPGQ  1034

Query  938  APGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYR  1011
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  APGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYR  1108

Query 1012  KTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFA  1085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  KTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFA  1182

Query 1086  TFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQRHRLVLTQEQLHQLHIRLIS  1139
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1183  TFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS  1236