Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06086
• Subject: NM_001190837.1
• Aligned Length: 1271
• Identities: 1132
• Gaps: 132

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  MAQSKRHVYSRTPSGSRMSAEASARPLRVGSRVEVIGKGHRGTVAYVGATLFATGKWVGVILDEAKGKNDGTVQ  74

Query    1  -----------------------------------------------------MMRQAPTARKTTTRRPKPTRP  21
                                                                 ....|||||||||||||||||
Sbjct   75  GRKYFTCDEGHGIFVRQSQIQVFEDGADTTSPETPDSSASKVLKREGTDTTAKTSKLAPTARKTTTRRPKPTRP  148

Query   22  ASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEE  95
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVPPLPSPSKEEEGLRAQVRDLEE  222

Query   96  KLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADA  169
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  KLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKEAKEALEAKERYMEEMADTADA  296

Query  170  IEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRM  243
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  IEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAASSYQLKQLEEQNARLKDALVRM  370

Query  244  RDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLE  317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  RDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQVDAALGAEEMVEMLTDRNLNLE  444

Query  318  EKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTA  391
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  EKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVEAAQETVADYQQTIKKYRQLTA  518

Query  392  NLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRP  465
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  HLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEVAQANRHMSLLTAFMPDSFLRP  592

Query  466  GGDHDCVLVLLLMPRLICRAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHA  539
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSFAAGLVYSLSLLQATLHRYEHA  666

Query  540  LSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLA  613
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  LSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKYYQHLYSIHLAEQPEDCTMQLA  740

Query  614  DHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGP  687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  DHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKKIRRRMPGTDAPGIPAALAFGP  814

Query  688  QVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNI  761
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  QVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKASEQIYGTPSSSPYECLRQSCNI  888

Query  762  LISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEA  835
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  LISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDRETVIKELKKSLKIKGEELSEA  962

Query  836  NVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKR  909
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  NVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQADIDQLEAEKAELKQRLNSQSKR  1036

Query  910  TIEGLRGPPPSGIATLVSGIAG-----GAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGA  978
            ||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGEEQQRGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQISAMRLHISQLQHENSILKGA  1110

Query  979  QMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQVAQ  1052
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  QMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVDITRTSPAAKSPSAQLMEQVAQ  1184

Query 1053  LKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQRHRLVLT  1126
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  LKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVYMGKVTFSCAAGFGQRHRLVLT  1258

Query 1127  QEQLHQLHIRLIS  1139
            ||||||||.||||
Sbjct 1259  QEQLHQLHSRLIS  1271