Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_06086
• Subject: NM_023019.3
• Aligned Length: 1144
• Identities: 1136
• Gaps: 5

Alignment

Query    1  MMRQAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVP  74
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Sbjct    1  MMRQAPTARKTTTRRPKPTRPASTGVAGASSSLGPSGSASAGELSSSEPSTPAQTPLAAPIIPTPVLTSPGAVP  74

Query   75  PLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKE  148
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Sbjct   75  PLPSPSKEEEGLRAQVRDLEEKLETLRLKRAEDKAKLKELEKHKIQLEQVQEWKSKMQEQQADLQRRLKEARKE  148

Query  149  AKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAAS  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AKEALEAKERYMEEMADTADAIEMATLDKEMAEERAESLQQEVEALKERVDELTTDLEILKAEIEEKGSDGAAS  222

Query  223  SYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQV  296
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Sbjct  223  SYQLKQLEEQNARLKDALVRMRDLSSSEKQEHVKLQKLMEKKNQELEVVRQQRERLQEELSQAESTIDELKEQV  296

Query  297  DAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVE  370
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Sbjct  297  DAALGAEEMVEMLTDRNLNLEEKVRELRETVGDLEAMNEMNDELQENARETELELREQLDMAGARVREAQKRVE  370

Query  371  AAQETVADYQQTIKKYRQLTANLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEV  444
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Sbjct  371  AAQETVADYQQTIKKYRQLTAHLQDVNRELTNQQEASVERQQQPPPETFDFKIKFAETKAHAKAIEMELRQMEV  444

Query  445  AQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICRAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSF  518
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Sbjct  445  AQANRHMSLLTAFMPDSFLRPGGDHDCVLVLLLMPRLICKAELIRKQAQEKFELSENCSERPGLRGAAGEQLSF  518

Query  519  AAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKY  592
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Sbjct  519  AAGLVYSLSLLQATLHRYEHALSQCSVDVYKKVGSLYPEMSAHERSLDFLIELLHKDQLDETVNVEPLTKAIKY  592

Query  593  YQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKK  666
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Sbjct  593  YQHLYSIHLAEQPEDCTMQLADHIKFTQSALDCMSVEVGRLRAFLQGGQEATDIALLLRDLETSCSDIRQFCKK  666

Query  667  IRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKAS  740
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Sbjct  667  IRRRMPGTDAPGIPAALAFGPQVSDTLLDCRKHLTWVVAVLQEVAAAAAQLIAPLAENEGLLVAALEELAFKAS  740

Query  741  EQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDR  814
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Sbjct  741  EQIYGTPSSSPYECLRQSCNILISTMNKLATAMQEGEYDAERPPSKPPPVELRAAALRAEITDAEGLGLKLEDR  814

Query  815  ETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQAD  888
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Sbjct  815  ETVIKELKKSLKIKGEELSEANVRLSLLEKKLDSAAKDADERIEKVQTRLEETQALLRKKEKEFEETMDALQAD  888

Query  889  IDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAG-----GAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQ  957
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Sbjct  889  IDQLEAEKAELKQRLNSQSKRTIEGLRGPPPSGIATLVSGIAGEEQQRGAIPGQAPGSVPGPGLVKDSPLLLQQ  962

Query  958  ISAMRLHISQLQHENSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVD  1031
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Sbjct  963  ISAMRLHISQLQHENSILKGAQMKASLASLPPLHVAKLSHEGPGSELPAGALYRKTSQLLETLNQLSTHTHVVD  1036

Query 1032  ITRTSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVY  1105
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Sbjct 1037  ITRTSPAAKSPSAQLMEQVAQLKSLSDTVEKLKDEVLKETVSQRPGATVPTDFATFPSSAFLRAKEEQQDDTVY  1110

Query 1106  MGKVTFSCAAGFGQRHRLVLTQEQLHQLHIRLIS  1139
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Sbjct 1111  MGKVTFSCAAGFGQRHRLVLTQEQLHQLHSRLIS  1144