Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_06090
- Subject:
- NM_005216.5
- Aligned Length:
- 1368
- Identities:
- 1315
- Gaps:
- 51
Alignment
Query 1 ATGGGGTACTTCCGGTGTGCAGGTGCTGGGTCCTTCGGCAGGAGGAGGAAGATGGAGCCCAGCACCGCGGCCCG 74
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------ATGGAGCCCAGCACCGCGGCCCG 23
Query 75 GGCTTGGGCCCTCTTTTGGTTGCTGCTGCCCTTGCTTGGCGCGGTTTGCGCCAGCGGACCCCGCACCTTAGTGC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 24 GGCTTGGGCCCTCTTTTGGTTGCTGCTGCCCTTGCTTGGCGCGGTTTGCGCCAGCGGACCCCGCACCTTAGTGC 97
Query 149 TGCTGGACAACCTCAACGTGCGGGAGACTCATTCGCTTTTCTTCCGGAGCCTGAAGGACCGGGGCTTTGAGCTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 98 TGCTGGACAACCTCAACGTGCGGGAGACTCATTCGCTTTTCTTCCGGAGCCTGAAGGACCGGGGCTTTGAGCTC 171
Query 223 ACATTCAAGACCGCTGATGACCCCAGCCTGTCTCTCATAAAGTATGGGGAATTCCTCTATGACAATCTCATCAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 172 ACATTCAAGACCGCTGATGACCCCAGCCTGTCTCTCATAAAGTATGGGGAATTCCTCTATGACAATCTCATCAT 245
Query 297 TTTCTCCCCTTCGGTAGAAGATTTTGGAGGCAACATCAACGTGGAGACCATCAGTGCCTTTATTGACGGTGGAG 370
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 246 TTTCTCCCCTTCGGTAGAAGATTTTGGAGGCAACATCAACGTGGAGACCATCAGTGCCTTTATTGACGGCGGAG 319
Query 371 GCAGTGTGCTGGTAGCTGCCAGCTCCGACATTGGTGACCCTCTTCGAGAGCTGGGCAGTGAGTGCGGGATTGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 320 GCAGTGTGCTGGTAGCTGCCAGCTCCGACATTGGTGACCCTCTTCGAGAGCTGGGCAGTGAGTGCGGGATTGAG 393
Query 445 TTTGACGAGGAGAAAACGGCTGTCATTGACCATCACAACTATGACATCTCAGACCTTGGCCAGCATACGCTCAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 394 TTTGACGAGGAGAAAACGGCTGTCATTGACCATCACAACTATGACATCTCAGACCTTGGCCAGCATACGCTCAT 467
Query 519 CGTGGCTGACACTGAGAACCTGCTGAAGGCCCCAACCATCGTTGGGAAATCATCTCTAAATCCCATCCTCTTTC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 468 CGTGGCTGACACTGAGAACCTGCTGAAGGCCCCAACCATCGTTGGGAAATCATCTCTAAATCCCATCCTCTTTC 541
Query 593 GAGGTGTTGGGATGGTGGCCGATCCTGATAACCCTTTGGTGCTGGACATCCTGACGGGCTCTTCCACCTCTTAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 542 GAGGTGTTGGGATGGTGGCCGATCCTGATAACCCTTTGGTGCTGGACATCCTGACGGGCTCTTCCACCTCTTAC 615
Query 667 TCCTTCTTCCCGGACAAGCCTATCACCCAGTATCCACATGCGGTGGGGAAGAACACCCTCCTCATTGCTGGGCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 616 TCCTTCTTCCCGGACAAGCCTATCACCCAGTATCCACATGCGGTGGGGAAGAACACCCTCCTCATTGCTGGGCT 689
Query 741 CCAGGCCAGGAACAATGCCCGCGTCATCTTCAGCGGCTCCCTCGACTTCTTCAGCGACTCCTTCTTCAACTCAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 690 CCAGGCCAGGAACAATGCCCGCGTCATCTTCAGCGGCTCCCTCGACTTCTTCAGCGACTCCTTCTTCAACTCAG 763
Query 815 CAGTGCAGAAGGCGGCGCCCGGCTCCCAGAGGTATTCCCAGACAGGCAACTATGAACTAGCTGTGGCCCTCTCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 764 CAGTGCAGAAGGCGGCGCCCGGCTCCCAGAGGTATTCCCAGACAGGCAACTATGAACTAGCTGTGGCCCTCTCC 837
Query 889 CGCTGGGTGTTCAAGGAGGAGGGTGTCCTCCGTGTGGGGCCTGTGTCCCATCATCGGGTGGGTGAGACAGCCCC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 838 CGCTGGGTGTTCAAGGAGGAGGGTGTCCTCCGTGTGGGGCCTGTGTCCCATCATCGGGTGGGCGAGACAGCCCC 911
Query 963 ACCCAATGCCTACACTGTCACTGACCTAGTGGAGTATAGCATCGTGATCCAGCAGCTCTCAAATGGCAAATGGG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 912 ACCCAATGCCTACACTGTCACTGACCTAGTGGAGTATAGCATCGTGATCCAGCAGCTCTCAAATGGCAAATGGG 985
Query 1037 TCCCCTTTGATGGCGATGACATTCAGCTGGAGTTTGTCCGCATTGATCCTTTTGTGAGGACCTTCCTGAAGAAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 986 TCCCCTTTGATGGCGATGACATTCAGCTGGAGTTTGTCCGCATTGATCCTTTTGTGAGGACCTTCCTGAAGAAG 1059
Query 1111 AAAGGTGGCAAATACAGTGTTCAGTTCAAGTTGCCCGACGTGTATGGTGTATTCCAGTTTAAAGTGGATTACAA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1060 AAAGGTGGCAAATACAGTGTTCAGTTCAAGTTGCCCGACGTGTATGGTGTATTCCAGTTTAAAGTGGATTACAA 1133
Query 1185 CCGGCTAGGCTACACACACCTGTACTCTTCCACTCAGGTATCCGTGCGGCCACTCCAGCACACGCAGTATGAGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1134 CCGGCTAGGCTACACACACCTGTACTCTTCCACTCAGGTATCCGTGCGGCCACTCCAGCACACGCAGTATGAGC 1207
Query 1259 GCTTCATCCCCTCGGCCTACCCCTACTACGCCAGCGCCTTCTCCATGATGCTGGGGCTCTTCATCTTCAGCATC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1208 GCTTCATCCCCTCGGCCTACCCCTACTACGCCAGCGCCTTCTCCATGATGCTGGGGCTCTTCATCTTCAGCATC 1281
Query 1333 GTCTTCTTGCACATGAAGGAGAAGGAGAAGTCCGAC 1368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1282 GTCTTCTTGCACATGAAGGAGAAGGAGAAGTCCGAC 1317